More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0345 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  78.54 
 
 		 396 aa  649    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1330  elongation factor Tu  83.08 
 
 		 391 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262111  normal  0.0428037 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  76.96 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1198  elongation factor Tu  81.54 
 
 		 391 aa  647    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0734  elongation factor Tu  90.26 
 
 		 391 aa  733    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.481957  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  78.48 
 
 		 396 aa  656    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  78.48 
 
 		 396 aa  656    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  634    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  634    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  82.03 
 
 		 396 aa  677    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_004310  BR1235  elongation factor Tu  81.54 
 
 		 391 aa  647    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0193734  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1251  elongation factor Tu  81.54 
 
 		 391 aa  647    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.299738  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  638    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0359  elongation factor Tu  100 
 
 		 391 aa  796    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  78.73 
 
 		 396 aa  649    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  78.93 
 
 		 396 aa  653    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  76.71 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  78.93 
 
 		 396 aa  653    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1837  elongation factor Tu  83.08 
 
 		 391 aa  661    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569594  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0984  elongation factor Tu  84.1 
 
 		 391 aa  672    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0503391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  78.93 
 
 		 396 aa  653    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1940  elongation factor Tu  81.79 
 
 		 391 aa  654    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  76.71 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  79.75 
 
 		 396 aa  659    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06090  elongation factor Tu  77.02 
 
 		 397 aa  643    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.878067  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  76.96 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  75.44 
 
 		 396 aa  637    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  75.44 
 
 		 396 aa  637    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  78.73 
 
 		 396 aa  643    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0664  elongation factor Tu  83.85 
 
 		 391 aa  664    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000028425  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1707  elongation factor Tu  100 
 
 		 391 aa  796    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1714  elongation factor Tu  100 
 
 		 391 aa  796    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  638    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0563  elongation factor Tu  83.59 
 
 		 391 aa  660    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000014358  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  76.71 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  76.71 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  76.96 
 
 		 396 aa  646    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0756  elongation factor Tu  90.26 
 
 		 391 aa  733    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.097757  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  76.71 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  76.71 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  76.71 
 
 		 396 aa  640    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  76.71 
 
 		 396 aa  640    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  82.03 
 
 		 396 aa  677    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0223  elongation factor Tu  88.46 
 
 		 391 aa  693    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  634    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  78.93 
 
 		 396 aa  653    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  78.73 
 
 		 396 aa  643    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5072  elongation factor Tu  80.51 
 
 		 396 aa  636    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.798369  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0969  elongation factor Tu  84.1 
 
 		 391 aa  672    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0124791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  80.51 
 
 		 396 aa  667    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  80.51 
 
 		 396 aa  667    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0555  elongation factor Tu  87.18 
 
 		 391 aa  683    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0578  elongation factor Tu  87.18 
 
 		 391 aa  683    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1954  elongation factor Tu  81.79 
 
 		 391 aa  654    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172059  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  76.96 
 
 		 396 aa  646    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  79.75 
 
 		 396 aa  662    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0345  elongation factor Tu  100 
 
 		 391 aa  796    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  0.827994 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  80.25 
 
 		 396 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1413  elongation factor Tu  82.56 
 
 		 391 aa  657    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.3744 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06230  elongation factor Tu  77.02 
 
 		 397 aa  643    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141067  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1428  elongation factor Tu  82.56 
 
 		 391 aa  657    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00224702  decreased coverage  0.00405593 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0274  elongation factor Tu  88.46 
 
 		 391 aa  693    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  77.72 
 
 		 396 aa  639    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  77.97 
 
 		 396 aa  635    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  80.76 
 
 		 396 aa  670    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  80.76 
 
 		 396 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  80.25 
 
 		 396 aa  662    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  78.23 
 
 		 396 aa  638    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000705932  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  78.73 
 
 		 396 aa  649    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  76.71 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  77.97 
 
 		 396 aa  639    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0242  elongation factor Tu  86.45 
 
 		 391 aa  676    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.333301  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2434  elongation factor Tu  86.45 
 
 		 391 aa  676    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.349806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0696  elongation factor Tu  83.85 
 
 		 391 aa  664    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628191  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  76.71 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  76.71 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  638    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  638    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1680  elongation factor Tu  83.03 
 
 		 391 aa  660    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0832876  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1826  elongation factor Tu  83.03 
 
 		 391 aa  660    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636429  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2536  elongation factor Tu  98.98 
 
 		 391 aa  791    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1315  elongation factor Tu  83.08 
 
 		 391 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127  normal  0.248012 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2549  elongation factor Tu  98.98 
 
 		 391 aa  791    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.812394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  79.75 
 
 		 396 aa  662    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1213  elongation factor Tu  81.54 
 
 		 391 aa  647    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  76.65 
 
 		 396 aa  635    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0331  elongation factor Tu  100 
 
 		 391 aa  796    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.386625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1812  elongation factor Tu  83.08 
 
 		 391 aa  661    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1797  elongation factor Tu  81.52 
 
 		 396 aa  638    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.871801  normal  0.0555959 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1814  elongation factor Tu  81.52 
 
 		 396 aa  638    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  76.71 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  76.71 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  76.71 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  76.46 
 
 		 396 aa  634  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  75.95 
 
 		 396 aa  633  1e-180  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  76.46 
 
 		 396 aa  634  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  75.95 
 
 		 396 aa  632  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  76.71 
 
 		 396 aa  632  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  76.71 
 
 		 396 aa  632  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1247  elongation factor Tu  79.19 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.727206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>