More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1048 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  76.46 
 
 		 396 aa  647    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  77.02 
 
 		 396 aa  638    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  76.46 
 
 		 396 aa  641    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  76.77 
 
 		 396 aa  651    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  77.78 
 
 		 396 aa  655    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  77.02 
 
 		 396 aa  645    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  77.02 
 
 		 396 aa  645    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  76.65 
 
 		 396 aa  638    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  76.46 
 
 		 396 aa  647    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  76.77 
 
 		 396 aa  651    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  77.02 
 
 		 396 aa  652    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  77.02 
 
 		 396 aa  652    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  76.46 
 
 		 396 aa  647    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  77.02 
 
 		 396 aa  653    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  77.53 
 
 		 396 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  77.53 
 
 		 396 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  77.27 
 
 		 396 aa  650    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  76.4 
 
 		 396 aa  639    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  100 
 
 		 394 aa  806    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  76.46 
 
 		 396 aa  641    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  76.65 
 
 		 396 aa  638    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  77.02 
 
 		 396 aa  638    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  76.46 
 
 		 396 aa  647    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  75.51 
 
 		 396 aa  632  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  75.51 
 
 		 396 aa  632  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  75.51 
 
 		 396 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  75.51 
 
 		 396 aa  632  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  75.51 
 
 		 396 aa  632  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  633  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  76.71 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  76.71 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3599  elongation factor Tu  75.7 
 
 		 396 aa  633  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0100711  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3797  elongation factor Tu  75.44 
 
 		 396 aa  633  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000312567  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  75.51 
 
 		 396 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0254  elongation factor Tu  75.7 
 
 		 396 aa  633  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000130058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4449  elongation factor Tu  75.7 
 
 		 396 aa  633  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000257017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  76.26 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  76.26 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  633  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  76.01 
 
 		 396 aa  633  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  76.26 
 
 		 396 aa  633  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  74.24 
 
 		 396 aa  627  1e-179  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  75.13 
 
 		 396 aa  628  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3874  elongation factor Tu  75.7 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  74.24 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  74.24 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  628  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  75.76 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000015318  hitchhiker  0.0000000000310582 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  76.26 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  76.26 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  75.57 
 
 		 397 aa  627  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  75.76 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  75.76 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  74.24 
 
 		 396 aa  627  1e-179  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000705932  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  75 
 
 		 396 aa  627  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  75 
 
 		 396 aa  627  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  75.51 
 
 		 396 aa  628  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  75.51 
 
 		 396 aa  628  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  75.57 
 
 		 397 aa  627  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  75.7 
 
 		 395 aa  628  1e-179  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3864  elongation factor Tu  75.7 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  75.76 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000150336  hitchhiker  0.00000130036 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  74.24 
 
 		 396 aa  628  1e-179  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  74.24 
 
 		 396 aa  628  1e-179  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  72.98 
 
 		 397 aa  627  1e-178  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252436  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3356  elongation factor Tu  77.53 
 
 		 396 aa  625  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.449846 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  74.12 
 
 		 399 aa  627  1e-178  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000135478  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  74.87 
 
 		 395 aa  626  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1677  elongation factor Tu  77.53 
 
 		 396 aa  625  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0620439  hitchhiker  0.0000672774 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  73.37 
 
 		 399 aa  627  1e-178  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  72.98 
 
 		 397 aa  627  1e-178  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>