More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2335 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0177  elongation factor Tu  79.75 
 
 		 400 aa  642    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000229884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  80.7 
 
 		 399 aa  680    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0192  elongation factor Tu  79.75 
 
 		 400 aa  642    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174926  normal  0.0285704 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  81.16 
 
 		 400 aa  672    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  77.64 
 
 		 396 aa  639    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  79.65 
 
 		 395 aa  656    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  80.7 
 
 		 400 aa  678    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  81.41 
 
 		 400 aa  674    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  80 
 
 		 400 aa  684    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  84.75 
 
 		 400 aa  711    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  83.5 
 
 		 400 aa  705    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  77 
 
 		 400 aa  639    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  83.5 
 
 		 400 aa  705    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  83.21 
 
 		 400 aa  704    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  80 
 
 		 400 aa  682    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  80 
 
 		 400 aa  681    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  77.64 
 
 		 396 aa  639    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  83.25 
 
 		 400 aa  706    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  77.64 
 
 		 396 aa  639    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  100 
 
 		 400 aa  820    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  99.75 
 
 		 400 aa  818    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  77.64 
 
 		 396 aa  639    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 397 aa  631  1e-180  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 397 aa  631  1e-180  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  76.25 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  76.88 
 
 		 397 aa  630  1e-179  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  76.88 
 
 		 397 aa  630  1e-179  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0318  elongation factor Tu  76 
 
 		 400 aa  629  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000823048  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  76 
 
 		 396 aa  625  1e-178  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  73.58 
 
 		 405 aa  625  1e-178  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  73.58 
 
 		 405 aa  625  1e-178  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  75 
 
 		 396 aa  624  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  75.75 
 
 		 396 aa  624  1e-178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  74.5 
 
 		 396 aa  621  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  74.5 
 
 		 396 aa  621  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0699  elongation factor Tu  76.25 
 
 		 399 aa  622  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495422  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  75 
 
 		 396 aa  622  1e-177  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  75 
 
 		 396 aa  622  1e-177  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 396 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  75 
 
 		 396 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  75.88 
 
 		 394 aa  623  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  75.88 
 
 		 394 aa  623  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  74.75 
 
 		 396 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  74.75 
 
 		 396 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  75.88 
 
 		 394 aa  622  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  75.88 
 
 		 394 aa  622  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  75.25 
 
 		 400 aa  619  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  75.25 
 
 		 400 aa  619  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  74.75 
 
 		 397 aa  619  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  75.88 
 
 		 396 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  75.25 
 
 		 397 aa  620  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0686  elongation factor Tu  76 
 
 		 399 aa  620  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.23848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  75.88 
 
 		 396 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  75 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  77.64 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  77.64 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  73.75 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  73.75 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  72.86 
 
 		 399 aa  610  9.999999999999999e-175  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 395 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0238  elongation factor Tu  74.19 
 
 		 397 aa  611  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602877  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  73.37 
 
 		 399 aa  610  9.999999999999999e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  74.25 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  74.5 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2730  elongation factor Tu  75.5 
 
 		 400 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0102  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 395 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000129876  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  75.38 
 
 		 394 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  75.38 
 
 		 394 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06090  elongation factor Tu  73.76 
 
 		 397 aa  608  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.878067  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0756  elongation factor Tu  74.69 
 
 		 391 aa  610  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.097757  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0734  elongation factor Tu  74.69 
 
 		 391 aa  610  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.481957  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  74.12 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  72.86 
 
 		 399 aa  609  1e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06230  elongation factor Tu  73.76 
 
 		 397 aa  608  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141067  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  74.12 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  77.25 
 
 		 395 aa  610  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 394 aa  608  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 394 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  72.5 
 
 		 396 aa  606  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 399 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  73 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  73 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  74.06 
 
 		 395 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  74.5 
 
 		 397 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0495  elongation factor Tu  72 
 
 		 394 aa  607  9.999999999999999e-173  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  71.86 
 
 		 395 aa  606  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  73 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  72.5 
 
 		 396 aa  606  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  73.25 
 
 		 396 aa  606  9.999999999999999e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000705932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5197  elongation factor Tu  76.5 
 
 		 395 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000100424  unclonable  4.51566e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0129  elongation factor Tu  76.25 
 
 		 395 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000035963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0120  elongation factor Tu  76.25 
 
 		 395 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.73817e-61 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2909  translation elongation factor Tu  73.65 
 
 		 405 aa  603  1.0000000000000001e-171  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.124736  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0367  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>