More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3646 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03190  protein chain elongation factor EF-Tu (duplicate of tufB)  80.76 
 
 		 394 aa  635    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00381408  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03856  protein chain elongation factor EF-Tu (duplicate of tufA)  80.76 
 
 		 394 aa  636    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000229508  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0374  translation elongation factor Tu  80.76 
 
 		 394 aa  635    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155333  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4015  translation elongation factor Tu  80.76 
 
 		 394 aa  636    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000705833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  96.72 
 
 		 396 aa  784    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  96.72 
 
 		 396 aa  784    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3458  elongation factor Tu  93.18 
 
 		 396 aa  745    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0650384  normal  0.118326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  83.59 
 
 		 396 aa  684    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  84.6 
 
 		 396 aa  692    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  84.6 
 
 		 396 aa  692    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  94.95 
 
 		 396 aa  775    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  94.95 
 
 		 396 aa  775    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2257  elongation factor Tu  93.92 
 
 		 396 aa  732    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.534766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1262  elongation factor Tu  93.92 
 
 		 396 aa  732    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.084043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3904  elongation factor Tu  92.66 
 
 		 396 aa  723    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.806817 
 
 
-
 
NC_004310  BR1235  elongation factor Tu  82.07 
 
 		 391 aa  637    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0193734  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1251  elongation factor Tu  82.07 
 
 		 391 aa  637    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.299738  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  79.49 
 
 		 394 aa  640    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  79.49 
 
 		 394 aa  641    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0624  translation elongation factor Tu  78.54 
 
 		 397 aa  650    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000430921  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  96.72 
 
 		 396 aa  784    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  96.72 
 
 		 396 aa  784    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0380  elongation factor Tu  80.05 
 
 		 396 aa  640    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0392  elongation factor Tu  80.05 
 
 		 396 aa  640    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0355  elongation factor Tu  80.3 
 
 		 396 aa  641    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0367  elongation factor Tu  80.3 
 
 		 396 aa  641    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4550  elongation factor Tu  78.03 
 
 		 397 aa  645    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0141185  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0305  elongation factor Tu  88.38 
 
 		 396 aa  699    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.58276e-16  normal  0.0546751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0317  elongation factor Tu  88.38 
 
 		 396 aa  699    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.28692e-16  hitchhiker  0.000217605 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  94.95 
 
 		 396 aa  772    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  94.95 
 
 		 396 aa  772    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0391  elongation factor Tu  87.63 
 
 		 396 aa  695    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.578399  decreased coverage  0.00326089 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0403  elongation factor Tu  87.63 
 
 		 396 aa  695    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000926456  normal  0.170531 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  81.06 
 
 		 396 aa  659    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  96.72 
 
 		 396 aa  784    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  96.72 
 
 		 396 aa  784    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  79.55 
 
 		 396 aa  662    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  79.55 
 
 		 396 aa  662    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5081  elongation factor Tu  78.09 
 
 		 397 aa  635    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406478  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5093  elongation factor Tu  78.09 
 
 		 397 aa  635    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000584025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  96.72 
 
 		 396 aa  784    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  96.72 
 
 		 396 aa  784    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  97.98 
 
 		 396 aa  793    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  97.98 
 
 		 396 aa  793    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  92.91 
 
 		 396 aa  751    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0276  elongation factor Tu  92.66 
 
 		 396 aa  722    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000219388  decreased coverage  0.00000000221899 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  86.36 
 
 		 396 aa  711    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  86.36 
 
 		 396 aa  711    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4538  elongation factor Tu  93.67 
 
 		 396 aa  730    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000878057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  96.72 
 
 		 396 aa  784    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  96.72 
 
 		 396 aa  784    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  96.72 
 
 		 396 aa  784    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  80.3 
 
 		 396 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  80.3 
 
 		 396 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  81.31 
 
 		 396 aa  662    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  81.31 
 
 		 396 aa  662    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3599  elongation factor Tu  90.63 
 
 		 396 aa  737    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0100711  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3797  elongation factor Tu  90.38 
 
 		 396 aa  736    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000312567  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0929  elongation factor Tu  76.35 
 
 		 407 aa  638    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000367222  hitchhiker  0.00313256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0931  elongation factor Tu  76.35 
 
 		 407 aa  638    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000100695  hitchhiker  0.00709672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  80.3 
 
 		 396 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  90.15 
 
 		 396 aa  734    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  89.9 
 
 		 396 aa  733    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0254  elongation factor Tu  93.67 
 
 		 396 aa  757    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000130058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4449  elongation factor Tu  93.67 
 
 		 396 aa  757    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000257017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  99.75 
 
 		 396 aa  805    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  99.75 
 
 		 396 aa  805    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0336  elongation factor Tu  93.67 
 
 		 396 aa  730    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0999082  decreased coverage  0.000417386 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  81.06 
 
 		 396 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  81.06 
 
 		 396 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  81.31 
 
 		 396 aa  660    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  94.95 
 
 		 396 aa  773    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  94.95 
 
 		 396 aa  773    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0495  elongation factor Tu  78.03 
 
 		 394 aa  650    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  97.98 
 
 		 396 aa  793    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  97.98 
 
 		 396 aa  793    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  80.56 
 
 		 396 aa  663    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  80.56 
 
 		 396 aa  663    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  96.72 
 
 		 396 aa  784    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  92.91 
 
 		 396 aa  751    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  96.72 
 
 		 396 aa  784    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3445  elongation factor Tu  93.18 
 
 		 396 aa  745    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00653639  normal  0.407086 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  79.49 
 
 		 394 aa  655    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  79.49 
 
 		 394 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  79.49 
 
 		 394 aa  655    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  79.49 
 
 		 394 aa  640    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0444  elongation factor Tu  82.32 
 
 		 396 aa  650    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0557163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0456  elongation factor Tu  82.32 
 
 		 396 aa  650    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0756  elongation factor Tu  78.79 
 
 		 391 aa  646    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.097757  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0734  elongation factor Tu  78.79 
 
 		 391 aa  646    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.481957  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  97.98 
 
 		 396 aa  793    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  97.98 
 
 		 396 aa  793    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08680  elongation factor Tu  80.86 
 
 		 397 aa  663    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000467002  hitchhiker  0.000980752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08830  elongation factor Tu  80.86 
 
 		 397 aa  663    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0517061  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  97.98 
 
 		 396 aa  793    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  97.98 
 
 		 396 aa  793    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  79.49 
 
 		 394 aa  653    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  79.49 
 
 		 394 aa  653    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  76.94 
 
 		 399 aa  634    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0665  elongation factor Tu  81.06 
 
 		 396 aa  636    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.835908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>