More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1168 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0651  elongation factor Tu  85.86 
 
 		 396 aa  672    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000337363  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0792  elongation factor Tu  85.35 
 
 		 396 aa  695    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.476652  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  100 
 
 		 396 aa  795    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  76.53 
 
 		 395 aa  629  1e-179  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  77.1 
 
 		 395 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0627  elongation factor Tu  77.1 
 
 		 395 aa  616  1e-175  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0129162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  76.84 
 
 		 395 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  71.96 
 
 		 405 aa  610  1e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  71.96 
 
 		 405 aa  610  1e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2054  elongation factor Tu  76.21 
 
 		 395 aa  609  1e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00228831  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0524  elongation factor Tu  77.66 
 
 		 398 aa  608  1e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00168014  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0762  elongation factor Tu  76.65 
 
 		 398 aa  607  9.999999999999999e-173  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000170202  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0102  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 395 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000129876  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  73.18 
 
 		 400 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  72.11 
 
 		 400 aa  600  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  73.15 
 
 		 395 aa  598  1e-170  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  71.61 
 
 		 400 aa  598  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl621  elongation factor Tu  72.38 
 
 		 394 aa  595  1e-169  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  70.6 
 
 		 400 aa  596  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  72.61 
 
 		 400 aa  597  1e-169  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  72.61 
 
 		 400 aa  596  1e-169  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  69.97 
 
 		 394 aa  597  1e-169  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  71.65 
 
 		 397 aa  592  1e-168  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0387  elongation factor Tu  70.48 
 
 		 395 aa  592  1e-168  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  71.21 
 
 		 400 aa  591  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  71.57 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  71.57 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  70.92 
 
 		 395 aa  591  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  71.21 
 
 		 400 aa  591  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  71.65 
 
 		 397 aa  592  1e-168  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  71.57 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  71.57 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0108  elongation factor Tu  73.54 
 
 		 395 aa  588  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000077853  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0108  elongation factor Tu  73.28 
 
 		 395 aa  587  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000780653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0104  elongation factor Tu  73.28 
 
 		 395 aa  587  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.21711e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0102  elongation factor Tu  73.28 
 
 		 395 aa  587  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000109965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0120  elongation factor Tu  73.28 
 
 		 395 aa  587  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.73817e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0108  elongation factor Tu  73.28 
 
 		 395 aa  587  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000587402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0139  elongation factor Tu  73.54 
 
 		 395 aa  588  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3175  elongation factor Tu  70.15 
 
 		 395 aa  587  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0129  elongation factor Tu  73.28 
 
 		 395 aa  587  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000035963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0103  elongation factor Tu  73.47 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0571  elongation factor Tu  74.23 
 
 		 394 aa  585  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000209792  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  70.71 
 
 		 400 aa  586  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4484  translation elongation factor Tu  70.23 
 
 		 395 aa  586  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000251988  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  72.34 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  71.83 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000135478  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3456  elongation factor Tu  70.48 
 
 		 395 aa  587  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0019954  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0585  elongation factor Tu  74.23 
 
 		 394 aa  585  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546317  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  71.83 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252436  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  71.9 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  72.34 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  71.9 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1403  elongation factor Tu  70.23 
 
 		 395 aa  584  1e-166  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  69.9 
 
 		 394 aa  584  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  69.9 
 
 		 394 aa  584  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5197  elongation factor Tu  73.03 
 
 		 395 aa  585  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000100424  unclonable  4.51566e-25 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  70.71 
 
 		 400 aa  586  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 397 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  70.68 
 
 		 400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  70.71 
 
 		 397 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0189  elongation factor Tu  73.79 
 
 		 394 aa  583  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000120666  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  71.76 
 
 		 395 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  70.56 
 
 		 396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  70.56 
 
 		 396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  70.68 
 
 		 400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  70.71 
 
 		 399 aa  581  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  71.39 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  70.05 
 
 		 396 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  70.05 
 
 		 396 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  71.65 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 397 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  70.89 
 
 		 397 aa  581  1.0000000000000001e-165  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  71.07 
 
 		 397 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  71.03 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  70.78 
 
 		 396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0254  elongation factor Tu  70.56 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000130058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4449  elongation factor Tu  70.56 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000257017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  69.97 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  71.14 
 
 		 396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  69.44 
 
 		 400 aa  581  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  69.44 
 
 		 400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  71.65 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  69.64 
 
 		 394 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  69.64 
 
 		 394 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  70.28 
 
 		 399 aa  581  1.0000000000000001e-165  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2952  elongation factor Tu  69.92 
 
 		 402 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00124181  hitchhiker  0.00000107296 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1290  elongation factor Tu  71.11 
 
 		 400 aa  580  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000272484  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  69.87 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  69.87 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  70.03 
 
 		 399 aa  578  1e-164  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  69.62 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  70.89 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  70.89 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  69.62 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  69.62 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  69.62 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  70.13 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  70.3 
 
 		 397 aa  578  1e-164  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>