More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0109 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  77.33 
 
 
396 aa  637    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0120  elongation factor Tu  85.57 
 
 
395 aa  677    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.73817e-61 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  80.1 
 
 
396 aa  659    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  82.41 
 
 
397 aa  664    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  79.35 
 
 
396 aa  653    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0189  elongation factor Tu  82.28 
 
 
394 aa  649    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000120666  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  78.25 
 
 
400 aa  656    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  77.33 
 
 
396 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  79.25 
 
 
400 aa  660    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0108  elongation factor Tu  85.82 
 
 
395 aa  677    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000077853  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  75.75 
 
 
399 aa  639    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  77.16 
 
 
394 aa  635    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0108  elongation factor Tu  85.57 
 
 
395 aa  677    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000780653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0104  elongation factor Tu  85.57 
 
 
395 aa  677    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.21711e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl621  elongation factor Tu  77.61 
 
 
394 aa  635    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0102  elongation factor Tu  85.57 
 
 
395 aa  677    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000109965  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  84.56 
 
 
395 aa  701    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  76.07 
 
 
397 aa  634    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  78.75 
 
 
400 aa  651    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  78.75 
 
 
400 aa  651    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  76.07 
 
 
397 aa  634    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  76.32 
 
 
397 aa  637    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  75.75 
 
 
399 aa  639    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  77.33 
 
 
396 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  78.09 
 
 
396 aa  640    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  79 
 
 
400 aa  655    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  100 
 
 
395 aa  805    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  80.1 
 
 
396 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  96.96 
 
 
395 aa  754    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  79.25 
 
 
400 aa  659    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  82.75 
 
 
400 aa  678    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  79.15 
 
 
400 aa  655    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0585  elongation factor Tu  83.8 
 
 
394 aa  655    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546317  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0108  elongation factor Tu  85.57 
 
 
395 aa  677    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000587402  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  77.58 
 
 
396 aa  634    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  77.75 
 
 
400 aa  635    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  75.19 
 
 
394 aa  643    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  77.1 
 
 
395 aa  639    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  75.75 
 
 
399 aa  639    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  75.94 
 
 
399 aa  640    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  79.25 
 
 
400 aa  656    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  80.35 
 
 
396 aa  642    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  80.35 
 
 
396 aa  642    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  77.58 
 
 
396 aa  640    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  77.58 
 
 
396 aa  640    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  76.38 
 
 
397 aa  637    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  78.59 
 
 
396 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  75.94 
 
 
399 aa  640    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  77.83 
 
 
396 aa  642    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  78.73 
 
 
396 aa  639    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0139  elongation factor Tu  85.82 
 
 
395 aa  677    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5197  elongation factor Tu  85.82 
 
 
395 aa  677    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000100424  unclonable  4.51566e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0129  elongation factor Tu  85.57 
 
 
395 aa  677    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000035963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0103  elongation factor Tu  85.79 
 
 
396 aa  677    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  77.33 
 
 
396 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  77.33 
 
 
396 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  78.09 
 
 
396 aa  640    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  77.33 
 
 
396 aa  637    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2730  elongation factor Tu  80.75 
 
 
400 aa  651    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  80.1 
 
 
396 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  77.75 
 
 
400 aa  634    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  78.34 
 
 
396 aa  637    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  78.34 
 
 
396 aa  637    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  76.25 
 
 
399 aa  644    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0102  elongation factor Tu  87.09 
 
 
395 aa  691    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000129876  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  77.02 
 
 
396 aa  638    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  79.35 
 
 
396 aa  653    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0318  elongation factor Tu  77.81 
 
 
400 aa  647    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000823048  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  82.41 
 
 
397 aa  664    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  77.41 
 
 
394 aa  642    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  77.41 
 
 
394 aa  635    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  77.41 
 
 
394 aa  642    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  77.41 
 
 
394 aa  635    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  77.25 
 
 
400 aa  639    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  77.25 
 
 
400 aa  639    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0571  elongation factor Tu  83.8 
 
 
394 aa  655    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000209792  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0792  elongation factor Tu  78.01 
 
 
396 aa  645    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.476652  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  77.1 
 
 
396 aa  641    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  77.41 
 
 
394 aa  642    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  77.41 
 
 
394 aa  642    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  76.69 
 
 
399 aa  645    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  77.83 
 
 
396 aa  642    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  77.02 
 
 
396 aa  638    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  80.1 
 
 
396 aa  659    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  76.56 
 
 
396 aa  632  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  76.9 
 
 
394 aa  634  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  77.02 
 
 
396 aa  633  1e-180  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252436  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  77.02 
 
 
396 aa  633  1e-180  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000135478  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  76.32 
 
 
396 aa  630  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  76.32 
 
 
396 aa  630  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  76.32 
 
 
396 aa  630  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  76.32 
 
 
396 aa  630  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  76.88 
 
 
399 aa  631  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  76.32 
 
 
396 aa  630  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  76.32 
 
 
396 aa  630  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  77.08 
 
 
396 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  77.08 
 
 
396 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  77.08 
 
 
396 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  77.08 
 
 
396 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  75.57 
 
 
397 aa  632  1e-180  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>