More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A0139 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0318  elongation factor Tu  77.5 
 
 
400 aa  638    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000823048  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  77.58 
 
 
396 aa  639    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0189  elongation factor Tu  82.03 
 
 
394 aa  638    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000120666  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  77.75 
 
 
400 aa  637    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  85.82 
 
 
395 aa  677    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0108  elongation factor Tu  100 
 
 
395 aa  800    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000077853  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  77.58 
 
 
396 aa  639    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0108  elongation factor Tu  99.75 
 
 
395 aa  800    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000780653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0104  elongation factor Tu  99.75 
 
 
395 aa  800    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.21711e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0102  elongation factor Tu  99.75 
 
 
395 aa  800    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000109965  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  86.33 
 
 
395 aa  679    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0120  elongation factor Tu  99.75 
 
 
395 aa  800    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.73817e-61 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  77.5 
 
 
396 aa  640    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  77.5 
 
 
400 aa  640    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  78.5 
 
 
396 aa  643    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0103  elongation factor Tu  98.22 
 
 
396 aa  790    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  79.25 
 
 
400 aa  657    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  77.89 
 
 
400 aa  635    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  77.58 
 
 
396 aa  639    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0108  elongation factor Tu  99.75 
 
 
395 aa  800    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000587402  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  82.03 
 
 
395 aa  677    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0139  elongation factor Tu  100 
 
 
395 aa  800    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  78.75 
 
 
400 aa  643    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  78.75 
 
 
400 aa  643    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  78.25 
 
 
400 aa  644    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  77.83 
 
 
396 aa  639    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  77.83 
 
 
396 aa  639    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0102  elongation factor Tu  95.44 
 
 
395 aa  742    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000129876  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  77.58 
 
 
396 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  77.5 
 
 
396 aa  640    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  77.25 
 
 
396 aa  638    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  77.25 
 
 
396 aa  638    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  77.83 
 
 
396 aa  637    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5197  elongation factor Tu  98.99 
 
 
395 aa  796    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000100424  unclonable  4.51566e-25 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  77.5 
 
 
400 aa  640    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0129  elongation factor Tu  99.75 
 
 
395 aa  800    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000035963  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  77.58 
 
 
396 aa  639    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0571  elongation factor Tu  81.52 
 
 
394 aa  637    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000209792  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  77.97 
 
 
396 aa  634    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  76.34 
 
 
394 aa  637    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  76.34 
 
 
394 aa  637    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0585  elongation factor Tu  81.52 
 
 
394 aa  637    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546317  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  76.59 
 
 
394 aa  639    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  76.59 
 
 
394 aa  639    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  76.34 
 
 
394 aa  631  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  76.14 
 
 
394 aa  632  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  77.89 
 
 
397 aa  632  1e-180  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  77.89 
 
 
397 aa  632  1e-180  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  76 
 
 
400 aa  632  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  76.4 
 
 
394 aa  633  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  76.14 
 
 
394 aa  631  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  76.5 
 
 
400 aa  632  1e-180  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  76.5 
 
 
400 aa  632  1e-180  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  77.22 
 
 
396 aa  629  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  74.94 
 
 
394 aa  629  1e-179  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  76.32 
 
 
396 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl621  elongation factor Tu  76.84 
 
 
394 aa  624  1e-178  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  76.32 
 
 
396 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  76.32 
 
 
396 aa  625  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  76.32 
 
 
396 aa  625  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  76.32 
 
 
396 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  75.82 
 
 
396 aa  624  1e-178  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  76.57 
 
 
396 aa  624  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  76.32 
 
 
396 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  76.32 
 
 
396 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  75.82 
 
 
396 aa  624  1e-178  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  76.32 
 
 
396 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  76.32 
 
 
396 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  76.32 
 
 
396 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  73.68 
 
 
399 aa  626  1e-178  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  76.32 
 
 
396 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  76.32 
 
 
396 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  75.82 
 
 
396 aa  622  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000015318  hitchhiker  0.0000000000310582 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2859  elongation factor Tu  79.85 
 
 
396 aa  620  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2871  elongation factor Tu  79.85 
 
 
396 aa  620  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.373737  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  73.43 
 
 
399 aa  622  1e-177  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  75.82 
 
 
396 aa  622  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  77.83 
 
 
396 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  77.83 
 
 
396 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  76.32 
 
 
396 aa  623  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  75.82 
 
 
396 aa  622  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  74.81 
 
 
396 aa  621  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  74.81 
 
 
396 aa  621  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  76.63 
 
 
395 aa  621  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  73.43 
 
 
399 aa  623  1e-177  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  75.82 
 
 
396 aa  622  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000150336  hitchhiker  0.00000130036 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  75.57 
 
 
396 aa  620  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  75.31 
 
 
396 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  75.31 
 
 
396 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  75.31 
 
 
396 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  75.31 
 
 
396 aa  620  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  75.31 
 
 
396 aa  620  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0254  elongation factor Tu  75 
 
 
396 aa  619  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000130058  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4449  elongation factor Tu  75 
 
 
396 aa  619  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000257017  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  75.57 
 
 
396 aa  620  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  75.57 
 
 
396 aa  620  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  75.5 
 
 
396 aa  619  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  75.31 
 
 
396 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3874  elongation factor Tu  75.25 
 
 
396 aa  620  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3864  elongation factor Tu  75.25 
 
 
396 aa  620  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>