More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2730 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  77.75 
 
 		 400 aa  645    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  80.5 
 
 		 395 aa  643    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  81.25 
 
 		 400 aa  687    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  78 
 
 		 396 aa  649    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  78.75 
 
 		 397 aa  644    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 396 aa  644    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  76.75 
 
 		 400 aa  646    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  78 
 
 		 396 aa  649    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  78.25 
 
 		 400 aa  650    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  77.75 
 
 		 400 aa  645    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  76.25 
 
 		 400 aa  643    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  78 
 
 		 400 aa  645    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  76.25 
 
 		 400 aa  642    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  77.14 
 
 		 400 aa  641    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  77.25 
 
 		 396 aa  642    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  77.25 
 
 		 396 aa  642    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  78 
 
 		 396 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  77 
 
 		 396 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  77 
 
 		 396 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  77 
 
 		 396 aa  639    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  76.25 
 
 		 396 aa  637    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  77 
 
 		 396 aa  642    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  77 
 
 		 396 aa  642    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2730  elongation factor Tu  100 
 
 		 400 aa  819    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  77 
 
 		 396 aa  642    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  77 
 
 		 396 aa  642    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0318  elongation factor Tu  84 
 
 		 400 aa  714    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000823048  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  80.75 
 
 		 395 aa  644    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  79.5 
 
 		 400 aa  659    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  78.75 
 
 		 397 aa  644    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  79.5 
 
 		 400 aa  659    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  75.5 
 
 		 400 aa  636    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  75.5 
 
 		 400 aa  636    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  76.75 
 
 		 400 aa  646    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  76.25 
 
 		 396 aa  637    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  77 
 
 		 400 aa  641    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  80.25 
 
 		 395 aa  665    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  75.88 
 
 		 400 aa  632  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  75.88 
 
 		 396 aa  632  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  75.88 
 
 		 399 aa  633  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  75.87 
 
 		 397 aa  628  1e-179  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  75.68 
 
 		 397 aa  627  1e-178  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  75 
 
 		 396 aa  622  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  74.75 
 
 		 396 aa  623  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  75 
 
 		 396 aa  622  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 396 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 396 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  74.75 
 
 		 396 aa  623  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  73.32 
 
 		 397 aa  624  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  73.71 
 
 		 400 aa  624  1e-177  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  73.5 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  73.5 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  72.5 
 
 		 397 aa  619  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  72.35 
 
 		 405 aa  617  1e-176  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  74 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  72.5 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  72.5 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  74 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  75.88 
 
 		 395 aa  618  1e-176  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  72.35 
 
 		 405 aa  617  1e-176  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  72.82 
 
 		 397 aa  616  1e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1066  elongation factor Tu  78.25 
 
 		 396 aa  617  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093515  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1053  elongation factor Tu  78.25 
 
 		 396 aa  617  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0848244  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0665  elongation factor Tu  77.25 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.835908  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0686  elongation factor Tu  75 
 
 		 399 aa  615  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.23848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0699  elongation factor Tu  75.5 
 
 		 399 aa  616  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495422  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  73.75 
 
 		 396 aa  616  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  74.12 
 
 		 395 aa  614  1e-175  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  73.75 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0678  elongation factor Tu  77.25 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.596975  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  72.82 
 
 		 397 aa  616  1e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  74.75 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  72 
 
 		 394 aa  615  1e-175  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  73.75 
 
 		 396 aa  616  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  75.13 
 
 		 396 aa  616  1e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  73.75 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000705932  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2859  elongation factor Tu  77.75 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2871  elongation factor Tu  77.75 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.373737  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  73.5 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  74.06 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0311  elongation factor Tu  74.75 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3864  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0325  elongation factor Tu  74.75 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.275223  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  72.5 
 
 		 399 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0756  elongation factor Tu  73.5 
 
 		 391 aa  611  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.097757  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0102  elongation factor Tu  76.5 
 
 		 395 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000129876  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  73.5 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0495  elongation factor Tu  74.75 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0610373  hitchhiker  0.00000000794033 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0734  elongation factor Tu  73.5 
 
 		 391 aa  611  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.481957  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  73.25 
 
 		 396 aa  610  9.999999999999999e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  73.25 
 
 		 396 aa  610  9.999999999999999e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3599  elongation factor Tu  72.93 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0100711  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  74.5 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3874  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5072  elongation factor Tu  77.25 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.798369  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0483  elongation factor Tu  74.75 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000918892  hitchhiker  0.00000259901 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0918  elongation factor Tu  77.25 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3330  elongation factor Tu  77.25 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.91579e-16 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0792  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.476652  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  73.25 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>