More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0420 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  80.25 
 
 		 395 aa  663    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  77.06 
 
 		 396 aa  634    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  82 
 
 		 400 aa  691    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  100 
 
 		 400 aa  821    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 396 aa  642    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 396 aa  642    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  79.65 
 
 		 400 aa  663    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  76 
 
 		 397 aa  637    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  76 
 
 		 400 aa  635    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  76.25 
 
 		 397 aa  635    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  82.16 
 
 		 400 aa  691    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  78.25 
 
 		 396 aa  638    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  82.75 
 
 		 400 aa  702    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  78.25 
 
 		 397 aa  636    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0318  elongation factor Tu  77.75 
 
 		 400 aa  643    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000823048  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  78.25 
 
 		 397 aa  636    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  79.65 
 
 		 399 aa  664    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  83.75 
 
 		 400 aa  706    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  77.06 
 
 		 396 aa  634    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 396 aa  642    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2952  elongation factor Tu  76.3 
 
 		 402 aa  634    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00124181  hitchhiker  0.00000107296 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 396 aa  636    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  77.06 
 
 		 396 aa  634    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 396 aa  642    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  78 
 
 		 400 aa  661    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  78 
 
 		 400 aa  660    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  82.75 
 
 		 400 aa  702    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0177  elongation factor Tu  78 
 
 		 400 aa  634    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000229884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  77.75 
 
 		 396 aa  636    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  83.25 
 
 		 400 aa  700    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0192  elongation factor Tu  78 
 
 		 400 aa  634    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174926  normal  0.0285704 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  83.25 
 
 		 400 aa  700    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  80 
 
 		 400 aa  684    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  80 
 
 		 400 aa  683    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  77.11 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  77.25 
 
 		 396 aa  634  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  77.25 
 
 		 396 aa  634  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 399 aa  631  1e-180  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  77.89 
 
 		 395 aa  632  1e-180  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0102  elongation factor Tu  79.75 
 
 		 395 aa  634  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000129876  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000015318  hitchhiker  0.0000000000310582 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  76.75 
 
 		 396 aa  632  1e-180  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  76.75 
 
 		 396 aa  632  1e-180  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  77.25 
 
 		 396 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  77.25 
 
 		 396 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  77.11 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  77.75 
 
 		 396 aa  632  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  77.44 
 
 		 396 aa  632  1e-180  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  76.81 
 
 		 396 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  76.81 
 
 		 396 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3299  elongation factor Tu  76.3 
 
 		 402 aa  631  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00521718  hitchhiker  0.000291329 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000150336  hitchhiker  0.00000130036 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  77.11 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5197  elongation factor Tu  79 
 
 		 395 aa  629  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000100424  unclonable  4.51566e-25 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  77.25 
 
 		 396 aa  627  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0108  elongation factor Tu  79.25 
 
 		 395 aa  629  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000077853  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  74.69 
 
 		 399 aa  629  1e-179  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  76.75 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0108  elongation factor Tu  79 
 
 		 395 aa  629  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000780653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0104  elongation factor Tu  79 
 
 		 395 aa  629  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.21711e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0102  elongation factor Tu  79 
 
 		 395 aa  629  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000109965  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  77.11 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2730  elongation factor Tu  78.25 
 
 		 400 aa  628  1e-179  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3874  elongation factor Tu  76.69 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  78 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0139  elongation factor Tu  79.25 
 
 		 395 aa  629  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  77.11 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  77.11 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0103  elongation factor Tu  79.2 
 
 		 396 aa  627  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0108  elongation factor Tu  79 
 
 		 395 aa  629  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000587402  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  77.5 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  76.75 
 
 		 396 aa  628  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  76.75 
 
 		 396 aa  628  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0035  elongation factor Tu  76.44 
 
 		 396 aa  627  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775684  hitchhiker  0.000000000148389 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  77.11 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  77.11 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  77.11 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  77.25 
 
 		 396 aa  628  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  77.25 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0129  elongation factor Tu  79 
 
 		 395 aa  629  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000035963  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  77.11 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  77.11 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  77.11 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>