More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0686 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2859  elongation factor Tu  84.21 
 
 
396 aa  657    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2871  elongation factor Tu  84.21 
 
 
396 aa  657    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.373737  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  79.5 
 
 
396 aa  647    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  79.5 
 
 
396 aa  647    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  77.5 
 
 
400 aa  644    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  80 
 
 
400 aa  662    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  78.39 
 
 
400 aa  643    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  76.56 
 
 
397 aa  636    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1344  elongation factor Tu  84.83 
 
 
396 aa  662    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.536684  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  81.2 
 
 
396 aa  665    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0918  elongation factor Tu  85.71 
 
 
396 aa  662    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3343  elongation factor Tu  85.21 
 
 
396 aa  660    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311584 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  75.69 
 
 
397 aa  634    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  78.25 
 
 
400 aa  644    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0678  elongation factor Tu  84.96 
 
 
396 aa  662    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.596975  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  80.7 
 
 
396 aa  657    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  76.56 
 
 
397 aa  636    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  76.56 
 
 
397 aa  636    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  78.95 
 
 
396 aa  648    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  80.7 
 
 
396 aa  657    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  77.5 
 
 
400 aa  650    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  77.19 
 
 
396 aa  642    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  77.19 
 
 
396 aa  642    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0665  elongation factor Tu  84.96 
 
 
396 aa  662    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.835908  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  78.45 
 
 
396 aa  641    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  81.2 
 
 
396 aa  665    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0686  elongation factor Tu  100 
 
 
399 aa  816    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.23848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0699  elongation factor Tu  99 
 
 
399 aa  810    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495422  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0611  elongation factor Tu  85.21 
 
 
396 aa  639    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000377135 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0624  elongation factor Tu  85.21 
 
 
396 aa  639    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.137052  hitchhiker  2.36831e-16 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  78.59 
 
 
396 aa  644    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  76.75 
 
 
396 aa  636    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  76.75 
 
 
396 aa  636    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  75.25 
 
 
400 aa  635    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  76.94 
 
 
396 aa  638    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  77.75 
 
 
400 aa  647    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  76.56 
 
 
397 aa  636    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  80.95 
 
 
396 aa  647    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  80.95 
 
 
396 aa  647    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  79.95 
 
 
396 aa  650    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  79.95 
 
 
396 aa  650    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  79 
 
 
396 aa  643    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  80 
 
 
400 aa  662    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3330  elongation factor Tu  85.21 
 
 
396 aa  660    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.91579e-16 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  80.2 
 
 
396 aa  653    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  77.5 
 
 
400 aa  651    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1066  elongation factor Tu  86.72 
 
 
396 aa  671    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093515  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1053  elongation factor Tu  86.72 
 
 
396 aa  671    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0848244  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  80.2 
 
 
396 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  80.2 
 
 
396 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  78.95 
 
 
396 aa  646    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  79.35 
 
 
396 aa  644    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  80.5 
 
 
396 aa  660    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  81.2 
 
 
396 aa  665    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  78.45 
 
 
396 aa  641    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  81.2 
 
 
396 aa  665    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  80.5 
 
 
396 aa  660    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  78.59 
 
 
396 aa  644    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  76 
 
 
400 aa  639    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  76 
 
 
400 aa  639    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  77.69 
 
 
396 aa  638    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  77.69 
 
 
396 aa  638    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  78.95 
 
 
397 aa  645    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  76.94 
 
 
396 aa  638    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  78.95 
 
 
397 aa  645    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  79 
 
 
396 aa  643    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1331  elongation factor Tu  84.83 
 
 
396 aa  662    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0012019  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  76.63 
 
 
399 aa  633  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  75.69 
 
 
397 aa  634  1e-180  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  76.5 
 
 
395 aa  634  1e-180  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  76.63 
 
 
400 aa  632  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  76.25 
 
 
396 aa  631  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  76.25 
 
 
396 aa  631  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  75 
 
 
400 aa  634  1e-180  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0318  elongation factor Tu  76.5 
 
 
400 aa  633  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000823048  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  74.69 
 
 
399 aa  633  1e-180  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  76.25 
 
 
396 aa  629  1e-179  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  72.68 
 
 
394 aa  629  1e-179  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  75.75 
 
 
396 aa  627  1e-179  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  77.5 
 
 
396 aa  628  1e-179  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  76.07 
 
 
396 aa  630  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  75.5 
 
 
400 aa  628  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  76.75 
 
 
396 aa  628  1e-179  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000705932  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0177  elongation factor Tu  77.75 
 
 
400 aa  625  1e-178  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000229884  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  73.68 
 
 
399 aa  625  1e-178  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0325  elongation factor Tu  76.75 
 
 
396 aa  624  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.275223  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0311  elongation factor Tu  76.75 
 
 
396 aa  624  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  77.25 
 
 
396 aa  627  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  73.68 
 
 
399 aa  625  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  75.88 
 
 
394 aa  625  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0756  elongation factor Tu  76.94 
 
 
391 aa  625  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.097757  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0734  elongation factor Tu  76.94 
 
 
391 aa  625  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.481957  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0483  elongation factor Tu  76.75 
 
 
396 aa  624  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000918892  hitchhiker  0.00000259901 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0495  elongation factor Tu  76.75 
 
 
396 aa  624  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0610373  hitchhiker  0.00000000794033 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  73.68 
 
 
399 aa  625  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  75.88 
 
 
394 aa  625  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0931  elongation factor Tu  85.46 
 
 
396 aa  625  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  75.88 
 
 
394 aa  626  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  75.88 
 
 
394 aa  626  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0192  elongation factor Tu  77.75 
 
 
400 aa  625  1e-178  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174926  normal  0.0285704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>