More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0154 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl621  elongation factor Tu  89.34 
 
 		 394 aa  733    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  100 
 
 		 395 aa  807    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  77.86 
 
 		 395 aa  639    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  77.1 
 
 		 395 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  77.61 
 
 		 395 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  73.5 
 
 		 400 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  73.5 
 
 		 400 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  73.37 
 
 		 400 aa  608  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  73.62 
 
 		 400 aa  609  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  73 
 
 		 400 aa  609  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  74.75 
 
 		 397 aa  605  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  74.75 
 
 		 397 aa  605  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  73.67 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  73.67 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4484  translation elongation factor Tu  70.99 
 
 		 395 aa  602  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000251988  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0102  elongation factor Tu  76.34 
 
 		 395 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000129876  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  73.67 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  73.67 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0318  elongation factor Tu  73.12 
 
 		 400 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000823048  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0792  elongation factor Tu  73.72 
 
 		 396 aa  597  1e-170  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.476652  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  73.15 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  73.12 
 
 		 400 aa  596  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0387  elongation factor Tu  70.23 
 
 		 395 aa  596  1e-169  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  73.12 
 
 		 400 aa  597  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  71.54 
 
 		 397 aa  594  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  71.65 
 
 		 397 aa  596  1e-169  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  71.65 
 
 		 397 aa  596  1e-169  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  72.36 
 
 		 400 aa  595  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  72.11 
 
 		 400 aa  597  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3456  elongation factor Tu  70.48 
 
 		 395 aa  596  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0019954  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  72.34 
 
 		 395 aa  597  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  72.34 
 
 		 395 aa  597  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  72.59 
 
 		 396 aa  594  1e-169  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  72.59 
 
 		 396 aa  594  1e-169  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2730  elongation factor Tu  74.12 
 
 		 400 aa  597  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  70.72 
 
 		 405 aa  593  1e-168  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  72.04 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  71.25 
 
 		 394 aa  592  1e-168  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1403  elongation factor Tu  70.74 
 
 		 395 aa  593  1e-168  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  70.13 
 
 		 395 aa  592  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  72.41 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  70.93 
 
 		 399 aa  591  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  70.72 
 
 		 405 aa  593  1e-168  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2054  elongation factor Tu  72.34 
 
 		 395 aa  591  1e-168  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00228831  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0139  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 395 aa  587  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0108  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 395 aa  587  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000077853  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  70.93 
 
 		 400 aa  590  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  71.36 
 
 		 400 aa  589  1e-167  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  70.85 
 
 		 400 aa  589  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  70.85 
 
 		 400 aa  590  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  71.36 
 
 		 400 aa  589  1e-167  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0108  elongation factor Tu  74.55 
 
 		 395 aa  587  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000780653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0104  elongation factor Tu  74.55 
 
 		 395 aa  587  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.21711e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0102  elongation factor Tu  74.55 
 
 		 395 aa  587  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000109965  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  71.39 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0108  elongation factor Tu  74.55 
 
 		 395 aa  587  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000587402  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf525  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 397 aa  586  1e-166  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  70.89 
 
 		 396 aa  584  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  70.89 
 
 		 396 aa  584  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  70.57 
 
 		 400 aa  585  1e-166  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  71.39 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  71.39 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  71.97 
 
 		 396 aa  584  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3175  elongation factor Tu  69.11 
 
 		 395 aa  585  1e-166  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0120  elongation factor Tu  74.55 
 
 		 395 aa  587  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.73817e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5197  elongation factor Tu  74.05 
 
 		 395 aa  584  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000100424  unclonable  4.51566e-25 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  69.97 
 
 		 394 aa  587  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  69.72 
 
 		 394 aa  585  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  69.72 
 
 		 394 aa  585  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  69.97 
 
 		 394 aa  587  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0129  elongation factor Tu  74.55 
 
 		 395 aa  587  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000035963  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0189  elongation factor Tu  73.54 
 
 		 394 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000120666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0103  elongation factor Tu  74.05 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 399 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0585  elongation factor Tu  73.42 
 
 		 394 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546317  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  73.92 
 
 		 396 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  73.92 
 
 		 396 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  70.63 
 
 		 396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0571  elongation factor Tu  73.42 
 
 		 394 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000209792  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  70.63 
 
 		 396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  70.89 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0762  elongation factor Tu  72.8 
 
 		 398 aa  580  1e-164  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000170202  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3997  translation elongation factor Tu  72.91 
 
 		 394 aa  579  1e-164  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  70.23 
 
 		 394 aa  580  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  70.23 
 
 		 394 aa  579  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  70.78 
 
 		 397 aa  578  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  70.78 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  70.78 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0611  elongation factor Tu  70.33 
 
 		 394 aa  580  1e-164  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.016281  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1247  elongation factor Tu  71.79 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.727206  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  71.03 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  70.89 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0524  elongation factor Tu  72.8 
 
 		 398 aa  580  1e-164  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00168014  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  69.5 
 
 		 399 aa  578  1e-164  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  69.19 
 
 		 396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  70.96 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  69.97 
 
 		 394 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  69.72 
 
 		 394 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>