More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_08650 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  77.56 
 
 		 395 aa  649    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  100 
 
 		 400 aa  819    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09710  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  86.5 
 
 		 400 aa  696    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000220871  hitchhiker  0.00000138274 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2133  translation elongation factor Tu  90.25 
 
 		 400 aa  720    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000733128  normal  0.725841 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1178  translation elongation factor Tu  76.79 
 
 		 401 aa  640    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000242479  unclonable  0.0000000292333 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  74.26 
 
 		 397 aa  629  1e-179  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  73.13 
 
 		 396 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  73.13 
 
 		 396 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  73.13 
 
 		 396 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  76.43 
 
 		 397 aa  621  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  74.63 
 
 		 400 aa  622  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  74.63 
 
 		 400 aa  621  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  73.13 
 
 		 396 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  76.43 
 
 		 397 aa  621  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  73.76 
 
 		 397 aa  623  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  72.64 
 
 		 396 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  72.64 
 
 		 396 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  74.38 
 
 		 400 aa  617  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  72.82 
 
 		 397 aa  615  1e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  72.52 
 
 		 397 aa  614  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  72.52 
 
 		 399 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0924  translation elongation factor Tu  74.5 
 
 		 397 aa  610  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0489446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  73.28 
 
 		 400 aa  611  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  72.59 
 
 		 397 aa  612  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  72.64 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  72.64 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  72.52 
 
 		 399 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  72.64 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  72.64 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0238  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 397 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602877  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  73.13 
 
 		 396 aa  607  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 394 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 394 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  70.97 
 
 		 397 aa  608  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 394 aa  609  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 394 aa  609  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  71.29 
 
 		 399 aa  608  1e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  72.64 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  72.64 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  70.9 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  70.9 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  72.89 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  72.89 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  73.18 
 
 		 394 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  72.77 
 
 		 400 aa  604  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 395 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  73.13 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1183  translation elongation factor Tu  72.82 
 
 		 397 aa  605  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  72.66 
 
 		 400 aa  607  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  72.89 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  72.89 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  72.39 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0625  translation elongation factor Tu  72.07 
 
 		 401 aa  605  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  73.38 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  72.91 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2661  translation elongation factor Tu  72.07 
 
 		 397 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  71.11 
 
 		 399 aa  603  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 394 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  71.36 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  72.77 
 
 		 400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3864  elongation factor Tu  72.57 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  72.57 
 
 		 397 aa  603  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  70.62 
 
 		 399 aa  603  1.0000000000000001e-171  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  70.82 
 
 		 397 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  72.52 
 
 		 400 aa  601  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  70.32 
 
 		 397 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0318  elongation factor Tu  71.5 
 
 		 400 aa  601  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000823048  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  72.89 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  74.06 
 
 		 395 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  70.32 
 
 		 397 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  72.52 
 
 		 400 aa  601  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  71.11 
 
 		 399 aa  603  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3874  elongation factor Tu  72.57 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  72.93 
 
 		 394 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  72.93 
 
 		 394 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2730  elongation factor Tu  73.71 
 
 		 400 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  71.11 
 
 		 399 aa  603  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 394 aa  603  1.0000000000000001e-171  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  72.64 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  72.64 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  72.64 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  72.82 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  72.82 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  72.64 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  72.64 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  72.64 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  72.64 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  72.64 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  72.64 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0580  elongation factor Tu  72.52 
 
 		 397 aa  598  1e-170  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.700966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3599  elongation factor Tu  71.57 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0100711  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3797  elongation factor Tu  71.32 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000312567  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  72.82 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  72.82 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  72.64 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  71.29 
 
 		 400 aa  600  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  71.29 
 
 		 400 aa  600  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  72.17 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  71.07 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  71.07 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>