More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0651 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0651  elongation factor Tu  100 
 
 		 396 aa  796    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000337363  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0792  elongation factor Tu  86.36 
 
 		 396 aa  706    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.476652  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  85.86 
 
 		 396 aa  698    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0627  elongation factor Tu  79.9 
 
 		 395 aa  630  1e-179  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0129162  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  75.51 
 
 		 395 aa  625  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  73.37 
 
 		 400 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2054  elongation factor Tu  76.21 
 
 		 395 aa  607  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00228831  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  72.86 
 
 		 400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  72.59 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  72.59 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  75.32 
 
 		 395 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  72.59 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  72.59 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  75.32 
 
 		 395 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0762  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 398 aa  600  1e-170  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000170202  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0102  elongation factor Tu  75.32 
 
 		 395 aa  596  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000129876  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  70.74 
 
 		 394 aa  596  1e-169  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0524  elongation factor Tu  75.89 
 
 		 398 aa  597  1e-169  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00168014  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  71.07 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  71.61 
 
 		 400 aa  591  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  71.07 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  70.96 
 
 		 397 aa  592  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  70.74 
 
 		 396 aa  590  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  72.36 
 
 		 400 aa  585  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  69.6 
 
 		 400 aa  585  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  69.73 
 
 		 405 aa  587  1e-166  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  70.85 
 
 		 400 aa  586  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  72.36 
 
 		 400 aa  585  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  71.39 
 
 		 397 aa  585  1e-166  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  71.39 
 
 		 397 aa  585  1e-166  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  70.81 
 
 		 397 aa  587  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  69.64 
 
 		 394 aa  584  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  69.64 
 
 		 394 aa  584  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  69.73 
 
 		 405 aa  587  1e-166  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  70.2 
 
 		 400 aa  585  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  70.41 
 
 		 395 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  70.89 
 
 		 396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  71.57 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  71.57 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  72.73 
 
 		 397 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  70.89 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  70.89 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  70.71 
 
 		 400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  70.71 
 
 		 400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2952  elongation factor Tu  69.92 
 
 		 402 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00124181  hitchhiker  0.00000107296 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3299  elongation factor Tu  69.92 
 
 		 402 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00521718  hitchhiker  0.000291329 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  70.89 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  70.89 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  69.95 
 
 		 400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  72.73 
 
 		 397 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  71.14 
 
 		 396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  71.46 
 
 		 400 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  71.46 
 
 		 400 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  69.64 
 
 		 394 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  69.64 
 
 		 394 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4484  translation elongation factor Tu  70.48 
 
 		 395 aa  581  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000251988  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  70.81 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  70.81 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  69.87 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  69.87 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  69.87 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  69.87 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  70.03 
 
 		 399 aa  578  1e-164  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  70.63 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000015318  hitchhiker  0.0000000000310582 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3864  elongation factor Tu  70.56 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  69.62 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  69.62 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  69.87 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  69.87 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  70.38 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  69.87 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  69.87 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  69.87 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  69.87 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  69.87 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  70.38 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3874  elongation factor Tu  70.56 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  69.87 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  69.87 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  69.87 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  69.87 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  69.87 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  72.59 
 
 		 396 aa  577  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  72.59 
 
 		 396 aa  577  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  70.38 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  70.89 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  69.87 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0254  elongation factor Tu  70.05 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000130058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4449  elongation factor Tu  70.05 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000257017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  70.63 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000150336  hitchhiker  0.00000130036 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  70.99 
 
 		 395 aa  579  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  69.87 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  70.38 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1403  elongation factor Tu  70.23 
 
 		 395 aa  577  1e-164  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3175  elongation factor Tu  70.15 
 
 		 395 aa  580  1e-164  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  70.89 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  70.13 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  70.28 
 
 		 399 aa  578  1e-164  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  69.87 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  70.38 
 
 		 396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>