More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0627 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0792  elongation factor Tu  82.19 
 
 		 396 aa  672    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.476652  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  77.1 
 
 		 396 aa  636    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0627  elongation factor Tu  100 
 
 		 395 aa  792    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0129162  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  76.34 
 
 		 395 aa  632  1e-180  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0651  elongation factor Tu  79.9 
 
 		 396 aa  625  1e-178  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000337363  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2054  elongation factor Tu  77.66 
 
 		 395 aa  612  9.999999999999999e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00228831  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  74.12 
 
 		 400 aa  609  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  73.62 
 
 		 400 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  72.73 
 
 		 397 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  73.42 
 
 		 396 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  73.42 
 
 		 396 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  73.37 
 
 		 400 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  73.42 
 
 		 396 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  72.5 
 
 		 400 aa  605  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  73.42 
 
 		 396 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  71.86 
 
 		 397 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  72.86 
 
 		 400 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  72.5 
 
 		 400 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  72.5 
 
 		 400 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  72.25 
 
 		 400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  72.86 
 
 		 400 aa  599  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  72.5 
 
 		 400 aa  599  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  74.75 
 
 		 397 aa  597  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  72.15 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  72.93 
 
 		 400 aa  598  1e-170  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 400 aa  599  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  74.75 
 
 		 397 aa  597  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  72.15 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  72.15 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  71.25 
 
 		 394 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  71.25 
 
 		 394 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0524  elongation factor Tu  75.82 
 
 		 398 aa  598  1e-170  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00168014  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  71.25 
 
 		 394 aa  597  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  71.25 
 
 		 394 aa  597  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0762  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 398 aa  597  1e-169  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000170202  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl621  elongation factor Tu  72.08 
 
 		 394 aa  594  1e-169  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  72.66 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  72.41 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  70.63 
 
 		 394 aa  595  1e-169  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  71.9 
 
 		 396 aa  594  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  71.9 
 
 		 396 aa  594  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  72.66 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4484  translation elongation factor Tu  71.14 
 
 		 395 aa  597  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000251988  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 395 aa  595  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3456  elongation factor Tu  70.63 
 
 		 395 aa  594  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0019954  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  72.41 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  71.9 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  71.9 
 
 		 396 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  72.15 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0102  elongation factor Tu  75.32 
 
 		 395 aa  592  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000129876  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  74.55 
 
 		 395 aa  592  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  70.78 
 
 		 397 aa  589  1e-167  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  71.25 
 
 		 394 aa  589  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  71.25 
 
 		 394 aa  587  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  71.28 
 
 		 396 aa  589  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  71 
 
 		 400 aa  590  1e-167  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  70.78 
 
 		 397 aa  589  1e-167  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  71 
 
 		 400 aa  590  1e-167  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  70.89 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  70.89 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  72.91 
 
 		 396 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  72.91 
 
 		 396 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0238  elongation factor Tu  71.65 
 
 		 397 aa  588  1e-167  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602877  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0495  elongation factor Tu  70.23 
 
 		 394 aa  590  1e-167  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3175  elongation factor Tu  69.72 
 
 		 395 aa  587  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  71.79 
 
 		 397 aa  588  1e-167  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  71.25 
 
 		 394 aa  587  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  71.28 
 
 		 396 aa  589  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  70.38 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  70.38 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06090  elongation factor Tu  70.2 
 
 		 397 aa  585  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.878067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06230  elongation factor Tu  70.2 
 
 		 397 aa  585  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141067  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  70.38 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  70.38 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  71.9 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  70.68 
 
 		 399 aa  587  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  71.11 
 
 		 400 aa  584  1e-166  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  70.78 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  70.81 
 
 		 395 aa  584  1e-166  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  71.39 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  71.14 
 
 		 396 aa  584  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  70.68 
 
 		 400 aa  586  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  70.78 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  71.25 
 
 		 394 aa  586  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2859  elongation factor Tu  74.68 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2871  elongation factor Tu  74.68 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.373737  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1338  translation elongation factor Tu  74.81 
 
 		 394 aa  584  1.0000000000000001e-165  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1066  elongation factor Tu  74.43 
 
 		 396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093515  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1053  elongation factor Tu  74.43 
 
 		 396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0848244  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  69.72 
 
 		 395 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  70.63 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  70.63 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2730  elongation factor Tu  72.36 
 
 		 400 aa  578  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  69.95 
 
 		 397 aa  580  1e-164  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  70.63 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  70.63 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  70.63 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1403  elongation factor Tu  69.62 
 
 		 395 aa  578  1e-164  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  70.3 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  69.95 
 
 		 397 aa  580  1e-164  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>