More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0842 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4484  translation elongation factor Tu  88.07 
 
 		 395 aa  718    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000251988  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_002950  PG0387  elongation factor Tu  78.68 
 
 		 395 aa  652    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3456  elongation factor Tu  88.32 
 
 		 395 aa  719    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0019954  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  100 
 
 		 395 aa  806    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1403  elongation factor Tu  80.46 
 
 		 395 aa  663    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1936  elongation factor Tu  81.52 
 
 		 395 aa  664    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3175  elongation factor Tu  86.84 
 
 		 395 aa  711    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00060  translation elongation factor Tu  79.95 
 
 		 395 aa  639    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.937819  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1212  elongation factor Tu  80.46 
 
 		 395 aa  634  1e-180  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  74.43 
 
 		 395 aa  630  1e-179  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1700  translation elongation factor Tu  78.73 
 
 		 395 aa  621  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  74.62 
 
 		 394 aa  618  1e-176  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 397 aa  612  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  73 
 
 		 400 aa  611  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 397 aa  612  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  72.8 
 
 		 397 aa  608  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 399 aa  608  1e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  71.86 
 
 		 400 aa  608  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  72.5 
 
 		 399 aa  604  9.999999999999999e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  72.8 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  72.8 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  71.86 
 
 		 400 aa  606  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  73.48 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  70.75 
 
 		 400 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 399 aa  604  1.0000000000000001e-171  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  71.86 
 
 		 400 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  73.48 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  74.43 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  74.18 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  74.18 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0254  elongation factor Tu  72.98 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000130058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4449  elongation factor Tu  72.98 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000257017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  72.29 
 
 		 397 aa  601  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  72.61 
 
 		 397 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  71.86 
 
 		 400 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0840  translation elongation factor Tu  77.58 
 
 		 398 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  73.67 
 
 		 395 aa  601  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  73.67 
 
 		 395 aa  601  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  72.34 
 
 		 394 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  72.34 
 
 		 394 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1101  translation elongation factor Tu  77.58 
 
 		 398 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000113146  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  74.43 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  72 
 
 		 399 aa  600  1e-170  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  72.8 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000150336  hitchhiker  0.00000130036 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3874  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  72.54 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  72.54 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  72 
 
 		 399 aa  600  1e-170  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  70.25 
 
 		 400 aa  598  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  72.73 
 
 		 397 aa  599  1e-170  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000135478  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  72.73 
 
 		 397 aa  599  1e-170  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  71.28 
 
 		 397 aa  599  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3299  elongation factor Tu  72.39 
 
 		 402 aa  599  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00521718  hitchhiker  0.000291329 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  72 
 
 		 399 aa  600  1e-170  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  72.29 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2952  elongation factor Tu  71.89 
 
 		 402 aa  597  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00124181  hitchhiker  0.00000107296 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252436  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  72.8 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000015318  hitchhiker  0.0000000000310582 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 399 aa  599  1e-170  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3864  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3599  elongation factor Tu  72.98 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0100711  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3797  elongation factor Tu  72.73 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000312567  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  72.54 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  72.54 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  72.54 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  70.53 
 
 		 397 aa  600  1e-170  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  72.29 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  72.54 
 
 		 396 aa  597  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  71.03 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  71.03 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  71.03 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  71.03 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  72.34 
 
 		 394 aa  600  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  72.34 
 
 		 394 aa  600  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0035  elongation factor Tu  72.73 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775684  hitchhiker  0.000000000148389 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  72.36 
 
 		 399 aa  597  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  72.54 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  72.54 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  72.54 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  72.54 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  72.98 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  72.98 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  72.36 
 
 		 400 aa  595  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  72.29 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  72.29 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  71.28 
 
 		 396 aa  594  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  71.79 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  72.29 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  72.29 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  70.75 
 
 		 400 aa  596  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  72.54 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  72.54 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  72.04 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  72.29 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  72.29 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  72.54 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  71.03 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  72.54 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  72.54 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>