More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0524 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0762  elongation factor Tu  94.97 
 
 		 398 aa  741    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000170202  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  76.01 
 
 		 395 aa  635    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2054  elongation factor Tu  82.16 
 
 		 395 aa  649    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00228831  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  77.66 
 
 		 396 aa  635    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0524  elongation factor Tu  100 
 
 		 398 aa  801    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00168014  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0792  elongation factor Tu  76.96 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.476652  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  73.37 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  73.37 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  73.37 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  73.37 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  72.57 
 
 		 400 aa  610  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  72.57 
 
 		 400 aa  609  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 394 aa  607  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 394 aa  607  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  72.22 
 
 		 394 aa  607  9.999999999999999e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  72.8 
 
 		 395 aa  604  9.999999999999999e-173  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  71.57 
 
 		 400 aa  605  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  70.96 
 
 		 397 aa  604  9.999999999999999e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 394 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 394 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  72.46 
 
 		 399 aa  604  9.999999999999999e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  73.93 
 
 		 397 aa  601  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  72.86 
 
 		 394 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  72.86 
 
 		 394 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  75.51 
 
 		 395 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  72.11 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  72.82 
 
 		 399 aa  603  1.0000000000000001e-171  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0102  elongation factor Tu  76.01 
 
 		 395 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000129876  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  72.11 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  72.21 
 
 		 399 aa  601  1.0000000000000001e-171  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  73.93 
 
 		 397 aa  601  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0627  elongation factor Tu  75.82 
 
 		 395 aa  603  1.0000000000000001e-171  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0129162  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 395 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  72.32 
 
 		 400 aa  598  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  72.32 
 
 		 400 aa  598  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  72.36 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  70.96 
 
 		 397 aa  598  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl621  elongation factor Tu  73.05 
 
 		 394 aa  600  1e-170  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  71.93 
 
 		 400 aa  598  1e-170  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0651  elongation factor Tu  75.89 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000337363  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  72.86 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  71.57 
 
 		 400 aa  597  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  71.46 
 
 		 400 aa  599  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 394 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 394 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  70.82 
 
 		 400 aa  598  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4484  translation elongation factor Tu  72.73 
 
 		 395 aa  598  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000251988  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  70.32 
 
 		 400 aa  595  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  68.47 
 
 		 405 aa  595  1e-169  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3456  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 395 aa  595  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0019954  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0189  elongation factor Tu  75.76 
 
 		 394 aa  595  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000120666  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  68.47 
 
 		 405 aa  595  1e-169  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  71.36 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  71.36 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  70.45 
 
 		 397 aa  594  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 395 aa  597  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  70.6 
 
 		 395 aa  594  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  70.6 
 
 		 395 aa  594  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_002950  PG0387  elongation factor Tu  71.21 
 
 		 395 aa  594  1e-168  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  71.36 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  71.36 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  72.68 
 
 		 400 aa  593  1e-168  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  72.32 
 
 		 400 aa  593  1e-168  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0571  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 394 aa  591  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000209792  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  72.25 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  73.62 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  73.62 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  72.11 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1101  translation elongation factor Tu  75 
 
 		 398 aa  592  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000113146  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  70.5 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0585  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 394 aa  591  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546317  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  70.5 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  71.07 
 
 		 399 aa  592  1e-168  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0238  elongation factor Tu  71.03 
 
 		 397 aa  592  1e-168  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602877  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0840  translation elongation factor Tu  74.75 
 
 		 398 aa  591  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  69.7 
 
 		 397 aa  591  1e-168  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0108  elongation factor Tu  74.49 
 
 		 395 aa  588  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000077853  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  71.07 
 
 		 399 aa  588  1e-167  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0108  elongation factor Tu  74.24 
 
 		 395 aa  588  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000780653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0104  elongation factor Tu  74.24 
 
 		 395 aa  588  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.21711e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0102  elongation factor Tu  74.24 
 
 		 395 aa  588  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000109965  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  71.86 
 
 		 396 aa  590  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  71.07 
 
 		 399 aa  588  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0139  elongation factor Tu  74.49 
 
 		 395 aa  588  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0129  elongation factor Tu  74.24 
 
 		 395 aa  588  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000035963  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  71.07 
 
 		 399 aa  588  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2952  elongation factor Tu  70.72 
 
 		 402 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00124181  hitchhiker  0.00000107296 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  70.57 
 
 		 399 aa  588  1e-167  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0108  elongation factor Tu  74.24 
 
 		 395 aa  588  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000587402  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  70.5 
 
 		 396 aa  590  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  71.11 
 
 		 396 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  71.86 
 
 		 396 aa  590  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  71.61 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  71.61 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1672  elongation factor Tu  72.57 
 
 		 399 aa  590  1e-167  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000990168  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0120  elongation factor Tu  74.24 
 
 		 395 aa  588  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.73817e-61 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3175  elongation factor Tu  71.72 
 
 		 395 aa  588  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  70.5 
 
 		 396 aa  590  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5197  elongation factor Tu  73.99 
 
 		 395 aa  587  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000100424  unclonable  4.51566e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>