More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0320 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_16991  elongation factor Tu  92.98 
 
 		 399 aa  766    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1074  elongation factor Tu  92.73 
 
 		 399 aa  757    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17111  elongation factor Tu  92.98 
 
 		 399 aa  765    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2022  elongation factor Tu  96.74 
 
 		 399 aa  769    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.466852  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  100 
 
 		 399 aa  810    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1600  elongation factor Tu  92.98 
 
 		 399 aa  766    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23641  elongation factor Tu  94.49 
 
 		 399 aa  772    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19491  elongation factor Tu  92.73 
 
 		 399 aa  756    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16311  elongation factor Tu  91.73 
 
 		 399 aa  755    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16881  elongation factor Tu  92.98 
 
 		 399 aa  767    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  74.87 
 
 		 394 aa  630  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  74.87 
 
 		 394 aa  630  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0884  elongation factor Tu  78.73 
 
 		 409 aa  629  1e-179  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.669879  hitchhiker  0.000241501 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  74.62 
 
 		 394 aa  628  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  74.62 
 
 		 394 aa  628  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  74 
 
 		 395 aa  625  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0476  elongation factor Tu  78.48 
 
 		 409 aa  627  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.596173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  75.13 
 
 		 394 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  74.37 
 
 		 394 aa  617  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  74.62 
 
 		 394 aa  619  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  74.87 
 
 		 394 aa  620  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  73.18 
 
 		 394 aa  616  1e-175  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0662  translation elongation factor Tu  76.53 
 
 		 409 aa  617  1e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0150791  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0708  elongation factor Tu  77.02 
 
 		 409 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  73.45 
 
 		 399 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0049  elongation factor Tu  76.1 
 
 		 410 aa  609  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1536  elongation factor Tu  75.55 
 
 		 409 aa  608  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1561  elongation factor Tu  75.55 
 
 		 409 aa  608  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.052718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  71.78 
 
 		 399 aa  608  1e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  73.43 
 
 		 395 aa  610  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  73.43 
 
 		 395 aa  610  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  73.63 
 
 		 397 aa  605  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  71.78 
 
 		 399 aa  604  9.999999999999999e-173  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  71.78 
 
 		 399 aa  604  9.999999999999999e-173  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1287  elongation factor Tu  76.53 
 
 		 409 aa  605  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  72.7 
 
 		 399 aa  606  9.999999999999999e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  71.78 
 
 		 399 aa  604  9.999999999999999e-173  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  73.63 
 
 		 397 aa  605  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  73.18 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  73.32 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  73.32 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  73.32 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4704  elongation factor Tu  74.62 
 
 		 394 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000392421  hitchhiker  0.000039393 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  73.32 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  73.32 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  73.32 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  71.71 
 
 		 399 aa  600  1e-170  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4509  translation elongation factor Tu  74.88 
 
 		 397 aa  598  1e-170  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0144  elongation factor Tu  74.62 
 
 		 394 aa  599  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195175  normal  0.039031 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0211  elongation factor Tu  74.69 
 
 		 394 aa  598  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000453651  unclonable  0.00000937964 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4319  elongation factor Tu  74.12 
 
 		 394 aa  599  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000023337  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  73.63 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0199  elongation factor Tu  74.69 
 
 		 394 aa  598  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000563397  hitchhiker  0.000127621 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  72.07 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  72.07 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3761  elongation factor Tu  74.12 
 
 		 394 aa  600  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000788214  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  73.63 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  72.52 
 
 		 396 aa  597  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3773  elongation factor Tu  74.12 
 
 		 394 aa  600  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000180335  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  73.32 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  73.32 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  72.5 
 
 		 397 aa  599  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  72.57 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4692  elongation factor Tu  73.87 
 
 		 394 aa  597  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  unclonable  0.0000000372179 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  73.07 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  72.32 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  72.32 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  71.14 
 
 		 397 aa  596  1e-169  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0611  elongation factor Tu  71.97 
 
 		 394 aa  597  1e-169  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.016281  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4548  elongation factor Tu  75.13 
 
 		 394 aa  596  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312961  normal  0.015065 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 396 aa  594  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  73.07 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  73.07 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1331  elongation factor Tu  75.81 
 
 		 396 aa  594  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0012019  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1344  elongation factor Tu  75.81 
 
 		 396 aa  594  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.536684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  73.07 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0102  elongation factor Tu  75.5 
 
 		 395 aa  596  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000129876  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  73.07 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  73.07 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  73.07 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0678  elongation factor Tu  76.56 
 
 		 396 aa  594  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.596975  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  73.07 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  73.07 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0156  elongation factor Tu  74.37 
 
 		 394 aa  597  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000313949  decreased coverage  0.000051786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>