More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0840 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1101  translation elongation factor Tu  99.75 
 
 
398 aa  804    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000113146  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0840  translation elongation factor Tu  100 
 
 
398 aa  805    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  78.09 
 
 
395 aa  642    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  77.58 
 
 
395 aa  636    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  77.58 
 
 
397 aa  633  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  77.33 
 
 
395 aa  631  1e-180  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  77.33 
 
 
395 aa  631  1e-180  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  76.83 
 
 
397 aa  632  1e-180  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  76.77 
 
 
397 aa  632  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  76.32 
 
 
397 aa  628  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  75.37 
 
 
399 aa  628  1e-179  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  75.62 
 
 
399 aa  630  1e-179  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  75.12 
 
 
399 aa  629  1e-179  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0387  elongation factor Tu  75.38 
 
 
395 aa  625  1e-178  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1403  elongation factor Tu  76.88 
 
 
395 aa  625  1e-178  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4484  translation elongation factor Tu  76.88 
 
 
395 aa  625  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000251988  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  76.32 
 
 
397 aa  623  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  74.63 
 
 
399 aa  622  1e-177  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  77.31 
 
 
397 aa  617  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3456  elongation factor Tu  76.88 
 
 
395 aa  620  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0019954  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  73.37 
 
 
397 aa  620  1e-176  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  77.31 
 
 
397 aa  617  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  74.25 
 
 
397 aa  614  1e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  75.68 
 
 
400 aa  615  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  77.89 
 
 
395 aa  614  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  74.25 
 
 
397 aa  614  1e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3175  elongation factor Tu  76.07 
 
 
395 aa  614  1e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0560  translation elongation factor Tu  77.58 
 
 
397 aa  614  1e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4509  translation elongation factor Tu  76.83 
 
 
397 aa  612  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  74.81 
 
 
394 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  74.81 
 
 
394 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  74.81 
 
 
394 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  74.81 
 
 
394 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  75.31 
 
 
396 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  77.14 
 
 
395 aa  610  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  72.89 
 
 
399 aa  610  1e-173  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  74.56 
 
 
394 aa  609  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  72.89 
 
 
399 aa  610  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  72.89 
 
 
399 aa  610  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4323  translation elongation factor Tu  77.33 
 
 
397 aa  608  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  74.19 
 
 
396 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  74.81 
 
 
400 aa  608  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  74.19 
 
 
396 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  74.31 
 
 
396 aa  609  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  73.82 
 
 
397 aa  607  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  74.37 
 
 
394 aa  610  1e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  74.19 
 
 
396 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  74.19 
 
 
396 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  74.81 
 
 
400 aa  608  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  74.56 
 
 
394 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1183  translation elongation factor Tu  73.3 
 
 
397 aa  606  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  73.99 
 
 
396 aa  605  9.999999999999999e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  74.75 
 
 
400 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  74.75 
 
 
400 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2157  elongation factor Tu  73.57 
 
 
400 aa  605  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2170  elongation factor Tu  73.57 
 
 
400 aa  605  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0151946  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2909  translation elongation factor Tu  75 
 
 
405 aa  604  9.999999999999999e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.124736  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2690  translation elongation factor Tu  75 
 
 
405 aa  604  9.999999999999999e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000740208  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  74.56 
 
 
394 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  74.56 
 
 
394 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0924  translation elongation factor Tu  77.02 
 
 
397 aa  604  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0489446  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5075  elongation factor Tu  75.82 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602594  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  73.25 
 
 
396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  73.25 
 
 
396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  72.3 
 
 
405 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1936  elongation factor Tu  73.87 
 
 
395 aa  603  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  73.5 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  73.5 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  75.93 
 
 
400 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  74.19 
 
 
396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  72.3 
 
 
405 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  73.18 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  73.18 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  73.93 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  73.93 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  74.19 
 
 
396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  73.43 
 
 
397 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  75.93 
 
 
400 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  74 
 
 
396 aa  600  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1672  elongation factor Tu  73.13 
 
 
399 aa  597  1e-170  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000990168  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  72.21 
 
 
400 aa  599  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2549  elongation factor Tu  73.18 
 
 
391 aa  599  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.812394  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2536  elongation factor Tu  73.18 
 
 
391 aa  599  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148431  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  72.21 
 
 
400 aa  598  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1015  elongation factor Tu  75.76 
 
 
396 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.345465 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  74 
 
 
396 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0987  elongation factor Tu  75.76 
 
 
396 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  74 
 
 
396 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  71.25 
 
 
400 aa  600  1e-170  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0792  elongation factor Tu  72.98 
 
 
396 aa  599  1e-170  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.476652  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1005  elongation factor Tu  75.76 
 
 
396 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  73.5 
 
 
396 aa  597  1e-169  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  74.25 
 
 
396 aa  596  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  74.25 
 
 
396 aa  596  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0345  translation elongation factor Tu  74.38 
 
 
399 aa  594  1e-169  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000850527  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  74.25 
 
 
396 aa  597  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  74.25 
 
 
396 aa  597  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0495  elongation factor Tu  72.36 
 
 
394 aa  595  1e-169  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0359  elongation factor Tu  72.68 
 
 
391 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0524  elongation factor Tu  74.75 
 
 
398 aa  597  1e-169  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00168014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>