More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3456 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3456  elongation factor Tu  100 
 
 		 395 aa  805    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0019954  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_002950  PG0387  elongation factor Tu  79.75 
 
 		 395 aa  661    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  88.32 
 
 		 395 aa  719    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1936  elongation factor Tu  81.52 
 
 		 395 aa  665    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4484  translation elongation factor Tu  92.91 
 
 		 395 aa  755    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000251988  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00060  translation elongation factor Tu  80 
 
 		 395 aa  639    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.937819  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3175  elongation factor Tu  88.07 
 
 		 395 aa  715    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1212  elongation factor Tu  81.01 
 
 		 395 aa  638    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1403  elongation factor Tu  82.03 
 
 		 395 aa  676    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1700  translation elongation factor Tu  79.7 
 
 		 395 aa  624  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  74.18 
 
 		 394 aa  612  9.999999999999999e-175  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl621  elongation factor Tu  72.52 
 
 		 394 aa  606  9.999999999999999e-173  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  72.08 
 
 		 395 aa  606  9.999999999999999e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  74.37 
 
 		 397 aa  600  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  74.37 
 
 		 397 aa  600  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  70.48 
 
 		 395 aa  596  1e-169  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  72.91 
 
 		 395 aa  595  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  72.91 
 
 		 395 aa  595  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  71.97 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  72.29 
 
 		 397 aa  593  1e-168  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  72.29 
 
 		 397 aa  593  1e-168  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  71.97 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  71 
 
 		 400 aa  591  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  71.97 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  71.97 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  71.54 
 
 		 396 aa  587  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  71.46 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  72.29 
 
 		 396 aa  590  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  72.29 
 
 		 396 aa  590  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  71.21 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  71.61 
 
 		 400 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  71.21 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0254  elongation factor Tu  71.21 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000130058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4449  elongation factor Tu  71.21 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000257017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  72.04 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  72.04 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3864  elongation factor Tu  71.72 
 
 		 396 aa  589  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  71.46 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  70.1 
 
 		 400 aa  588  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3874  elongation factor Tu  71.72 
 
 		 396 aa  589  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  71.79 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  70.43 
 
 		 399 aa  590  1e-167  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  71.61 
 
 		 400 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  71.28 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  70.57 
 
 		 400 aa  586  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3599  elongation factor Tu  70.96 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0100711  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3797  elongation factor Tu  70.71 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000312567  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  71.46 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  71.57 
 
 		 394 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  72.04 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  71.57 
 
 		 394 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  70.1 
 
 		 400 aa  587  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  70.48 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  72.04 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1101  translation elongation factor Tu  76.88 
 
 		 398 aa  585  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000113146  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0840  translation elongation factor Tu  76.88 
 
 		 398 aa  586  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  70.28 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  70.28 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  71.9 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  70.71 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  70.89 
 
 		 397 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  70.28 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  70.53 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  69 
 
 		 400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  70.85 
 
 		 399 aa  582  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  69.83 
 
 		 399 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  71.03 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  70.53 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  71.03 
 
 		 396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  71.9 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  70.28 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  71.32 
 
 		 394 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  71.32 
 
 		 394 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  70.71 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  70.53 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  69.27 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  69.27 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  70.71 
 
 		 396 aa  577  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252436  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  71.32 
 
 		 394 aa  579  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  71.32 
 
 		 394 aa  577  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  69.83 
 
 		 399 aa  578  1e-164  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  69.33 
 
 		 400 aa  578  1e-164  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  69.33 
 
 		 400 aa  578  1e-164  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  67.41 
 
 		 405 aa  578  1e-164  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  68.5 
 
 		 400 aa  578  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2952  elongation factor Tu  70.07 
 
 		 402 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00124181  hitchhiker  0.00000107296 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  69.58 
 
 		 399 aa  580  1e-164  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  69.75 
 
 		 400 aa  580  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  70.1 
 
 		 397 aa  580  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  70.03 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  70.03 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  70.71 
 
 		 396 aa  577  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000135478  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  67.41 
 
 		 405 aa  578  1e-164  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  70.53 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  70.53 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  70.85 
 
 		 400 aa  580  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3299  elongation factor Tu  70.32 
 
 		 402 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00521718  hitchhiker  0.000291329 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2054  elongation factor Tu  71.76 
 
 		 395 aa  577  1e-164  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00228831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>