More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_03960 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0585  translation elongation factor Tu  80.1 
 
 		 396 aa  669    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344387  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2661  translation elongation factor Tu  82.62 
 
 		 397 aa  686    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6616  translation elongation factor Tu  83.88 
 
 		 397 aa  678    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1015  elongation factor Tu  86.65 
 
 		 396 aa  702    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.345465 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  82.62 
 
 		 397 aa  685    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0625  translation elongation factor Tu  79.35 
 
 		 401 aa  659    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3145  elongation factor Tu  81.57 
 
 		 396 aa  674    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0924  translation elongation factor Tu  82.87 
 
 		 397 aa  661    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0489446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23870  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  78.59 
 
 		 395 aa  658    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4317  elongation factor Tu  82.12 
 
 		 397 aa  649    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5075  elongation factor Tu  87.66 
 
 		 396 aa  710    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602594  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  85.86 
 
 		 396 aa  705    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0580  elongation factor Tu  81.36 
 
 		 397 aa  659    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.700966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1183  translation elongation factor Tu  80.35 
 
 		 397 aa  672    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2692  elongation factor Tu  82.37 
 
 		 396 aa  678    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0685  elongation factor Tu  83.38 
 
 		 397 aa  672    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4323  translation elongation factor Tu  82.87 
 
 		 397 aa  667    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  100 
 
 		 397 aa  808    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  81.06 
 
 		 397 aa  685    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6051  elongation factor Tu  81.61 
 
 		 397 aa  648    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198403  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0987  elongation factor Tu  86.65 
 
 		 396 aa  702    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  84.89 
 
 		 396 aa  705    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29780  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  81.36 
 
 		 396 aa  676    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.573725 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10699  elongation factor Tu  86.65 
 
 		 396 aa  689    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1084  elongation factor Tu  84.13 
 
 		 397 aa  671    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2979  elongation factor Tu  82.62 
 
 		 396 aa  680    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.990994  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  81.36 
 
 		 397 aa  681    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4509  translation elongation factor Tu  84.38 
 
 		 397 aa  683    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  81.86 
 
 		 397 aa  681    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  81.61 
 
 		 397 aa  680    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1005  elongation factor Tu  86.65 
 
 		 396 aa  702    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  87.15 
 
 		 396 aa  721    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0560  translation elongation factor Tu  85.14 
 
 		 397 aa  681    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17200  elongation factor Tu  81.11 
 
 		 396 aa  640    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232418  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3925  elongation factor Tu  82.37 
 
 		 397 aa  652    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1119  translation elongation factor Tu  83.12 
 
 		 396 aa  660    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  74.81 
 
 		 395 aa  621  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0396  translation elongation factor Tu  76.57 
 
 		 395 aa  619  1e-176  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  72.93 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  72.93 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  73.43 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  71.72 
 
 		 394 aa  605  9.999999999999999e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  72.73 
 
 		 395 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  72.73 
 
 		 395 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  73.43 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  71.64 
 
 		 400 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  71.64 
 
 		 400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  72.57 
 
 		 400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2157  elongation factor Tu  73.32 
 
 		 400 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2170  elongation factor Tu  73.32 
 
 		 400 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0151946  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 394 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 394 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 394 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 394 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  72.29 
 
 		 395 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  71.93 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  71.18 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  71.18 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0238  elongation factor Tu  71.28 
 
 		 397 aa  598  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602877  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  72.25 
 
 		 397 aa  599  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  71.93 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  72.18 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  72.25 
 
 		 397 aa  595  1e-169  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  72.73 
 
 		 394 aa  594  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  72.98 
 
 		 394 aa  596  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2621  translation elongation factor Tu  72.24 
 
 		 405 aa  594  1e-169  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  72.25 
 
 		 397 aa  595  1e-169  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  70.93 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  70.93 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  72.18 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1184  translation elongation factor Tu  72.48 
 
 		 405 aa  595  1e-169  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000189456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  70.9 
 
 		 400 aa  597  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  72.25 
 
 		 397 aa  595  1e-169  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  72.36 
 
 		 397 aa  597  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  70.9 
 
 		 400 aa  596  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1094  elongation factor Tu domain protein  72.25 
 
 		 399 aa  596  1e-169  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  71.64 
 
 		 400 aa  595  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  71.89 
 
 		 400 aa  595  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  73.43 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  73.37 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  72.25 
 
 		 397 aa  595  1e-169  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  72.11 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252436  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  70.57 
 
 		 399 aa  591  1e-168  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  72.18 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  71.18 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  71.18 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  72.36 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  72.36 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>