More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3925 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0585  translation elongation factor Tu  76.83 
 
 		 396 aa  643    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344387  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5075  elongation factor Tu  82.12 
 
 		 396 aa  663    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602594  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1015  elongation factor Tu  80.86 
 
 		 396 aa  651    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.345465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0560  translation elongation factor Tu  82.87 
 
 		 397 aa  669    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10699  elongation factor Tu  82.37 
 
 		 396 aa  647    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  83.88 
 
 		 397 aa  703    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3145  elongation factor Tu  81.82 
 
 		 396 aa  670    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0625  translation elongation factor Tu  77.86 
 
 		 401 aa  648    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1084  elongation factor Tu  85.14 
 
 		 397 aa  677    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2692  elongation factor Tu  80.86 
 
 		 396 aa  655    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4323  translation elongation factor Tu  82.87 
 
 		 397 aa  672    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  82.37 
 
 		 397 aa  684    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6616  translation elongation factor Tu  84.63 
 
 		 397 aa  685    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0580  elongation factor Tu  84.89 
 
 		 397 aa  686    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.700966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1183  translation elongation factor Tu  84.13 
 
 		 397 aa  701    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29780  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  78.59 
 
 		 396 aa  651    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.573725 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  82.83 
 
 		 396 aa  681    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4317  elongation factor Tu  98.99 
 
 		 397 aa  802    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2661  translation elongation factor Tu  82.62 
 
 		 397 aa  684    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0987  elongation factor Tu  80.86 
 
 		 396 aa  651    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0924  translation elongation factor Tu  87.15 
 
 		 397 aa  694    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0489446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0685  elongation factor Tu  83.38 
 
 		 397 aa  659    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3925  elongation factor Tu  100 
 
 		 397 aa  808    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  82.62 
 
 		 396 aa  680    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  81.57 
 
 		 397 aa  684    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2979  elongation factor Tu  80.6 
 
 		 396 aa  654    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.990994  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  83.12 
 
 		 397 aa  691    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1119  translation elongation factor Tu  80.35 
 
 		 396 aa  636    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4509  translation elongation factor Tu  86.4 
 
 		 397 aa  692    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  84.38 
 
 		 397 aa  698    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1005  elongation factor Tu  80.86 
 
 		 396 aa  651    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  81.11 
 
 		 396 aa  673    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  83.38 
 
 		 397 aa  694    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6051  elongation factor Tu  84.13 
 
 		 397 aa  669    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198403  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23870  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  76.07 
 
 		 395 aa  629  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  75.06 
 
 		 395 aa  620  1e-176  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17200  elongation factor Tu  79.6 
 
 		 396 aa  617  1e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232418  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  73.32 
 
 		 400 aa  614  1e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 394 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 394 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 394 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 394 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  74 
 
 		 397 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  74.12 
 
 		 397 aa  604  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  71.93 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  71.93 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  73.68 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  73.43 
 
 		 396 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  73.43 
 
 		 396 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  73.68 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  73.68 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  73.68 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0495  elongation factor Tu  72.04 
 
 		 394 aa  602  1.0000000000000001e-171  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  72.75 
 
 		 397 aa  598  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  72.22 
 
 		 394 aa  597  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 394 aa  599  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  73.43 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 394 aa  597  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  72.75 
 
 		 397 aa  598  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0396  translation elongation factor Tu  75.82 
 
 		 395 aa  600  1e-170  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0401  elongation factor Tu  75.76 
 
 		 394 aa  595  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000273455  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  71.39 
 
 		 400 aa  597  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  70.18 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  70.18 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  71.18 
 
 		 396 aa  594  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  71.18 
 
 		 396 aa  594  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3738  elongation factor Tu  75.76 
 
 		 394 aa  595  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00744191  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3918  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 394 aa  594  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  7.13111e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  594  1e-169  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000705932  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  72.95 
 
 		 400 aa  595  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 394 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3674  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 394 aa  594  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  71.93 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  72.68 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  72.68 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0278  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 394 aa  594  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000412884  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03856  protein chain elongation factor EF-Tu (duplicate of tufA)  74.81 
 
 		 394 aa  592  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000229508  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  72.18 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  71.93 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  71.93 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4045  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 394 aa  592  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000276048  hitchhiker  0.00334828 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4548  elongation factor Tu  74.49 
 
 		 394 aa  592  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312961  normal  0.015065 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0270  elongation factor Tu  74.49 
 
 		 394 aa  591  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276369  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0374  elongation factor Tu  75 
 
 		 394 aa  592  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00309992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  71.97 
 
 		 395 aa  593  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  71.97 
 
 		 395 aa  593  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  71.93 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  71.93 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>