More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2979 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  83.38 
 
 		 396 aa  681    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  82.58 
 
 		 396 aa  667    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  82.62 
 
 		 397 aa  680    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1015  elongation factor Tu  83.63 
 
 		 396 aa  665    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.345465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10699  elongation factor Tu  82.62 
 
 		 396 aa  647    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0560  translation elongation factor Tu  79.6 
 
 		 397 aa  634    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3145  elongation factor Tu  90.13 
 
 		 396 aa  735    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  78.59 
 
 		 397 aa  648    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1119  translation elongation factor Tu  82.87 
 
 		 396 aa  654    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23870  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  87.12 
 
 		 395 aa  721    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2661  translation elongation factor Tu  87.66 
 
 		 397 aa  706    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17200  elongation factor Tu  94.19 
 
 		 396 aa  736    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232418  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5075  elongation factor Tu  83.88 
 
 		 396 aa  671    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602594  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  77.33 
 
 		 397 aa  638    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0585  translation elongation factor Tu  85.86 
 
 		 396 aa  706    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344387  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29780  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  88.13 
 
 		 396 aa  722    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.573725 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4509  translation elongation factor Tu  80.35 
 
 		 397 aa  637    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0987  elongation factor Tu  83.63 
 
 		 396 aa  665    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2692  elongation factor Tu  99.24 
 
 		 396 aa  803    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1183  translation elongation factor Tu  79.09 
 
 		 397 aa  647    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2979  elongation factor Tu  100 
 
 		 396 aa  809    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.990994  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  78.59 
 
 		 397 aa  645    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  78.28 
 
 		 397 aa  645    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  78.84 
 
 		 397 aa  639    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1005  elongation factor Tu  83.63 
 
 		 396 aa  665    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  84.13 
 
 		 396 aa  689    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0625  translation elongation factor Tu  86.03 
 
 		 401 aa  703    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0924  translation elongation factor Tu  79.85 
 
 		 397 aa  630  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0489446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0580  elongation factor Tu  79.35 
 
 		 397 aa  626  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.700966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1084  elongation factor Tu  78.09 
 
 		 397 aa  621  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4317  elongation factor Tu  80.6 
 
 		 397 aa  623  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0685  elongation factor Tu  80.1 
 
 		 397 aa  624  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6616  translation elongation factor Tu  78.84 
 
 		 397 aa  624  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3925  elongation factor Tu  80.6 
 
 		 397 aa  623  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4323  translation elongation factor Tu  77.64 
 
 		 397 aa  622  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1094  elongation factor Tu domain protein  75.69 
 
 		 399 aa  620  1e-176  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6051  elongation factor Tu  78.09 
 
 		 397 aa  608  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198403  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0852  elongation factor Tu  76.19 
 
 		 399 aa  604  9.999999999999999e-173  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  73.55 
 
 		 395 aa  600  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  72.91 
 
 		 394 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  72.91 
 
 		 394 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  73.16 
 
 		 394 aa  600  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  73.16 
 
 		 394 aa  600  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  73.16 
 
 		 394 aa  592  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  73.42 
 
 		 394 aa  593  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  73.42 
 
 		 394 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0396  translation elongation factor Tu  75.76 
 
 		 395 aa  592  1e-168  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  73.16 
 
 		 394 aa  589  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  69.88 
 
 		 400 aa  587  1e-167  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  71.93 
 
 		 397 aa  577  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  69.33 
 
 		 399 aa  579  1e-164  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  70.38 
 
 		 395 aa  580  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  70.38 
 
 		 395 aa  580  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2157  elongation factor Tu  71.5 
 
 		 400 aa  577  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2170  elongation factor Tu  71.5 
 
 		 400 aa  577  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0151946  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  71.93 
 
 		 397 aa  577  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  70.07 
 
 		 399 aa  580  1e-164  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  70.94 
 
 		 400 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  69.35 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  69.35 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl621  elongation factor Tu  69.62 
 
 		 394 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1074  elongation factor Tu  69.08 
 
 		 399 aa  571  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  70.6 
 
 		 396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  69.35 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  69.35 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3761  elongation factor Tu  73.16 
 
 		 394 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000788214  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3773  elongation factor Tu  73.16 
 
 		 394 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000180335  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf525  elongation factor Tu  69.67 
 
 		 397 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  70.6 
 
 		 396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23641  elongation factor Tu  68.58 
 
 		 399 aa  574  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  69 
 
 		 399 aa  571  1.0000000000000001e-162  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0611  elongation factor Tu  70.23 
 
 		 394 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.016281  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  69.25 
 
 		 399 aa  572  1.0000000000000001e-162  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19491  elongation factor Tu  68.58 
 
 		 399 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  70.4 
 
 		 396 aa  567  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3997  translation elongation factor Tu  72.22 
 
 		 394 aa  567  1e-161  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0134  elongation factor Tu  72.91 
 
 		 394 aa  570  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000637762  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0146  elongation factor Tu  72.91 
 
 		 394 aa  570  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000378684  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  69 
 
 		 399 aa  570  1e-161  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  70.85 
 
 		 396 aa  567  1e-160  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09710  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  72 
 
 		 400 aa  564  1e-160  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000220871  hitchhiker  0.00000138274 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  68.08 
 
 		 399 aa  565  1e-160  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06090  elongation factor Tu  69.42 
 
 		 397 aa  566  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.878067  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  68.08 
 
 		 399 aa  565  1e-160  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  66.84 
 
 		 394 aa  564  1e-160  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16991  elongation factor Tu  68.33 
 
 		 399 aa  567  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  69.67 
 
 		 397 aa  565  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0168  elongation factor Tu  72.66 
 
 		 394 aa  566  1e-160  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000100576  n/a   
 
 
 
NC_009439  Pmen_3911  elongation factor Tu  68.42 
 
 		 397 aa  567  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0156728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  69.1 
 
 		 396 aa  565  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3923  elongation factor Tu  68.42 
 
 		 397 aa  567  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.375909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  70.85 
 
 		 396 aa  567  1e-160  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06230  elongation factor Tu  69.42 
 
 		 397 aa  566  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141067  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  70.1 
 
 		 396 aa  565  1e-160  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  70.1 
 
 		 396 aa  564  1e-160  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000705932  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  70.03 
 
 		 397 aa  567  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>