More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0560 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1084  elongation factor Tu  88.16 
 
 		 397 aa  697    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5075  elongation factor Tu  81.11 
 
 		 396 aa  661    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602594  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  85.89 
 
 		 397 aa  712    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0625  translation elongation factor Tu  76.37 
 
 		 401 aa  643    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4317  elongation factor Tu  82.62 
 
 		 397 aa  657    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1015  elongation factor Tu  80.1 
 
 		 396 aa  655    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.345465 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1119  translation elongation factor Tu  80.86 
 
 		 396 aa  645    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0685  elongation factor Tu  83.12 
 
 		 397 aa  667    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6616  translation elongation factor Tu  84.13 
 
 		 397 aa  680    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0580  elongation factor Tu  82.87 
 
 		 397 aa  668    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.700966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  81.61 
 
 		 396 aa  682    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4323  translation elongation factor Tu  88.41 
 
 		 397 aa  702    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  81.31 
 
 		 397 aa  682    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10699  elongation factor Tu  80.86 
 
 		 396 aa  641    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4509  translation elongation factor Tu  83.88 
 
 		 397 aa  677    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2692  elongation factor Tu  79.6 
 
 		 396 aa  655    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0987  elongation factor Tu  80.1 
 
 		 396 aa  655    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1183  translation elongation factor Tu  80.86 
 
 		 397 aa  680    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2661  translation elongation factor Tu  79.6 
 
 		 397 aa  671    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3145  elongation factor Tu  78.28 
 
 		 396 aa  655    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  83.63 
 
 		 397 aa  693    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0560  translation elongation factor Tu  100 
 
 		 397 aa  811    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  85.14 
 
 		 397 aa  702    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2979  elongation factor Tu  79.6 
 
 		 396 aa  654    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.990994  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  82.07 
 
 		 396 aa  682    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  84.89 
 
 		 397 aa  703    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29780  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  77.33 
 
 		 396 aa  648    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.573725 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  80.86 
 
 		 397 aa  681    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1005  elongation factor Tu  80.1 
 
 		 396 aa  655    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  80.6 
 
 		 396 aa  672    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3925  elongation factor Tu  82.87 
 
 		 397 aa  659    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0924  translation elongation factor Tu  83.88 
 
 		 397 aa  675    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0489446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6051  elongation factor Tu  81.61 
 
 		 397 aa  650    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198403  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0585  translation elongation factor Tu  76.83 
 
 		 396 aa  646    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344387  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23870  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  74.81 
 
 		 395 aa  630  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17200  elongation factor Tu  78.34 
 
 		 396 aa  621  1e-177  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  73.55 
 
 		 395 aa  613  9.999999999999999e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0396  translation elongation factor Tu  77.08 
 
 		 395 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0840  translation elongation factor Tu  77.58 
 
 		 398 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  71.97 
 
 		 394 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  71.97 
 
 		 394 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  71.97 
 
 		 394 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  71.97 
 
 		 394 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1101  translation elongation factor Tu  77.33 
 
 		 398 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000113146  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 395 aa  597  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  70.57 
 
 		 400 aa  597  1e-170  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  72.68 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  75.31 
 
 		 395 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  72.68 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  72.18 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  72.18 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  71.72 
 
 		 394 aa  594  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  72.14 
 
 		 400 aa  595  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  72.24 
 
 		 400 aa  596  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  72.22 
 
 		 395 aa  597  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  72.22 
 
 		 395 aa  597  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  72.24 
 
 		 400 aa  596  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  71.43 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  71.43 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  73.68 
 
 		 396 aa  594  1e-169  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  71.43 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  71.43 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  70.9 
 
 		 400 aa  594  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  71.97 
 
 		 394 aa  594  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  71.43 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000705932  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  72.89 
 
 		 397 aa  593  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  72.89 
 
 		 397 aa  593  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  71.43 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  70.9 
 
 		 400 aa  593  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  72.22 
 
 		 394 aa  593  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  72.22 
 
 		 394 aa  594  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  73.62 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0238  elongation factor Tu  70.85 
 
 		 397 aa  588  1e-167  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602877  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  72.57 
 
 		 400 aa  588  1e-167  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  70.18 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  70.18 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  69.9 
 
 		 399 aa  589  1e-167  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  70.93 
 
 		 396 aa  589  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  70.93 
 
 		 396 aa  589  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  71.39 
 
 		 400 aa  590  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  72.57 
 
 		 400 aa  588  1e-167  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  70.53 
 
 		 395 aa  589  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  71.5 
 
 		 397 aa  590  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  70.93 
 
 		 397 aa  589  1e-167  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  71.25 
 
 		 397 aa  588  1e-167  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0495  elongation factor Tu  70.53 
 
 		 394 aa  588  1e-167  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2157  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 400 aa  588  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2170  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 400 aa  588  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0151946  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  70.93 
 
 		 397 aa  589  1e-167  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  71.25 
 
 		 397 aa  588  1e-167  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  71.25 
 
 		 397 aa  588  1e-167  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  71.25 
 
 		 397 aa  588  1e-167  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  70.18 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  70.18 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  70.93 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  70.93 
 
 		 396 aa  584  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  70.68 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  70.68 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  71.18 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  71.18 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>