More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0396 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4509  translation elongation factor Tu  80.35 
 
 		 397 aa  640    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  78.09 
 
 		 397 aa  646    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  76.77 
 
 		 395 aa  635    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  76.57 
 
 		 397 aa  646    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0396  translation elongation factor Tu  100 
 
 		 395 aa  802    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  80.6 
 
 		 397 aa  664    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  77.08 
 
 		 397 aa  644    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  77.27 
 
 		 396 aa  632  1e-180  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0580  elongation factor Tu  79.85 
 
 		 397 aa  632  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.700966  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  75.31 
 
 		 397 aa  628  1e-179  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6051  elongation factor Tu  79.85 
 
 		 397 aa  627  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198403  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  76.83 
 
 		 396 aa  627  1e-179  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1183  translation elongation factor Tu  75.82 
 
 		 397 aa  627  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  76.83 
 
 		 396 aa  628  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  74.24 
 
 		 397 aa  630  1e-179  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2692  elongation factor Tu  75.76 
 
 		 396 aa  624  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0924  translation elongation factor Tu  78.09 
 
 		 397 aa  627  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0489446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 396 aa  621  1e-177  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 396 aa  621  1e-177  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6616  translation elongation factor Tu  77.08 
 
 		 397 aa  621  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  76.71 
 
 		 396 aa  622  1e-177  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  75.13 
 
 		 394 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  75.13 
 
 		 394 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2979  elongation factor Tu  75.76 
 
 		 396 aa  622  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.990994  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  75.13 
 
 		 394 aa  622  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  75.13 
 
 		 394 aa  622  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  75.31 
 
 		 396 aa  620  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  75.31 
 
 		 396 aa  620  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  75.57 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  75.57 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3145  elongation factor Tu  74.43 
 
 		 396 aa  620  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  74.06 
 
 		 396 aa  616  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  75.38 
 
 		 394 aa  614  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 396 aa  617  1e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5075  elongation factor Tu  75.57 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602594  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  75.13 
 
 		 397 aa  614  1e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  74.19 
 
 		 399 aa  617  1e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 396 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 396 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000705932  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 396 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 396 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 396 aa  616  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29780  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  74.81 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.573725 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0625  translation elongation factor Tu  74.31 
 
 		 401 aa  617  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  74.62 
 
 		 395 aa  615  1e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  74.62 
 
 		 395 aa  615  1e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0560  translation elongation factor Tu  77.08 
 
 		 397 aa  614  1e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2661  translation elongation factor Tu  74.31 
 
 		 397 aa  616  1e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  73.68 
 
 		 399 aa  616  1e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 396 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  74.06 
 
 		 396 aa  616  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  75.13 
 
 		 397 aa  614  1e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  74.49 
 
 		 396 aa  610  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  75.13 
 
 		 394 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4323  translation elongation factor Tu  76.83 
 
 		 397 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0987  elongation factor Tu  75.82 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  73.3 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  73.3 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  75.38 
 
 		 394 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  75.38 
 
 		 394 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1015  elongation factor Tu  75.82 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.345465 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  73.18 
 
 		 399 aa  611  9.999999999999999e-175  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1005  elongation factor Tu  75.82 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  71.25 
 
 		 400 aa  613  9.999999999999999e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  73.87 
 
 		 397 aa  609  1e-173  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  73.87 
 
 		 397 aa  609  1e-173  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1084  elongation factor Tu  76.57 
 
 		 397 aa  608  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0685  elongation factor Tu  76.57 
 
 		 397 aa  609  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3599  elongation factor Tu  72.98 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0100711  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3797  elongation factor Tu  72.73 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000312567  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0495  elongation factor Tu  74.18 
 
 		 394 aa  608  1e-173  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  73.55 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  73.3 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>