More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6616 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29780  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  79.6 
 
 		 396 aa  658    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.573725 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  84.13 
 
 		 397 aa  707    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1119  translation elongation factor Tu  81.61 
 
 		 396 aa  645    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  84.63 
 
 		 397 aa  715    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3925  elongation factor Tu  84.63 
 
 		 397 aa  674    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6051  elongation factor Tu  86.65 
 
 		 397 aa  679    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198403  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  83.38 
 
 		 396 aa  683    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1084  elongation factor Tu  85.14 
 
 		 397 aa  676    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0625  translation elongation factor Tu  77.61 
 
 		 401 aa  643    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  82.58 
 
 		 396 aa  682    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0580  elongation factor Tu  87.41 
 
 		 397 aa  696    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.700966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0685  elongation factor Tu  85.14 
 
 		 397 aa  681    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4317  elongation factor Tu  84.63 
 
 		 397 aa  673    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5075  elongation factor Tu  82.12 
 
 		 396 aa  664    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602594  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3145  elongation factor Tu  81.06 
 
 		 396 aa  669    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0924  translation elongation factor Tu  86.15 
 
 		 397 aa  694    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0489446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  83.88 
 
 		 397 aa  700    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  83.08 
 
 		 397 aa  694    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0987  elongation factor Tu  83.12 
 
 		 396 aa  671    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1183  translation elongation factor Tu  82.12 
 
 		 397 aa  690    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4323  translation elongation factor Tu  83.88 
 
 		 397 aa  686    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1015  elongation factor Tu  83.12 
 
 		 396 aa  671    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.345465 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0585  translation elongation factor Tu  77.58 
 
 		 396 aa  649    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344387  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2661  translation elongation factor Tu  80.6 
 
 		 397 aa  673    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0560  translation elongation factor Tu  84.13 
 
 		 397 aa  680    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2692  elongation factor Tu  78.59 
 
 		 396 aa  644    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4509  translation elongation factor Tu  87.15 
 
 		 397 aa  694    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2979  elongation factor Tu  78.84 
 
 		 396 aa  644    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.990994  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  82.62 
 
 		 397 aa  692    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6616  translation elongation factor Tu  100 
 
 		 397 aa  806    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  84.63 
 
 		 397 aa  711    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10699  elongation factor Tu  83.12 
 
 		 396 aa  658    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1005  elongation factor Tu  83.12 
 
 		 396 aa  671    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  82.62 
 
 		 396 aa  680    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23870  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  76.83 
 
 		 395 aa  634  1e-180  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  73.3 
 
 		 395 aa  616  1e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0396  translation elongation factor Tu  77.08 
 
 		 395 aa  614  1e-175  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  73.27 
 
 		 400 aa  614  1e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17200  elongation factor Tu  78.09 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232418  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  73.43 
 
 		 396 aa  607  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  73.43 
 
 		 396 aa  607  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  73.43 
 
 		 396 aa  607  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 394 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 394 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  73.43 
 
 		 396 aa  607  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 394 aa  608  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 394 aa  608  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  72.93 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  72.93 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  72.5 
 
 		 397 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  72.73 
 
 		 395 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  72.73 
 
 		 395 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  73.68 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  73.68 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  72.61 
 
 		 397 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  73.68 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 394 aa  598  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  73.68 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  73.43 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  73.43 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  72.18 
 
 		 396 aa  597  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  73.18 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  73.18 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  72.18 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  72.25 
 
 		 397 aa  599  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  72.18 
 
 		 396 aa  597  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  73.43 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  73.48 
 
 		 394 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  73.48 
 
 		 394 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  72.25 
 
 		 397 aa  599  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  72.18 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1066  elongation factor Tu  75.94 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093515  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  594  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1053  elongation factor Tu  75.94 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0848244  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  71.39 
 
 		 400 aa  596  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  72.98 
 
 		 394 aa  597  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  72.93 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0495  elongation factor Tu  71.03 
 
 		 394 aa  595  1e-169  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0665  elongation factor Tu  76.19 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.835908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0678  elongation factor Tu  76.19 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.596975  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  70.2 
 
 		 394 aa  597  1e-169  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2952  elongation factor Tu  71.78 
 
 		 402 aa  594  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00124181  hitchhiker  0.00000107296 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  594  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>