More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6051 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0585  translation elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  647    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344387  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0560  translation elongation factor Tu  81.61 
 
 		 397 aa  660    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10699  elongation factor Tu  81.61 
 
 		 396 aa  641    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1119  translation elongation factor Tu  82.12 
 
 		 396 aa  642    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  86.15 
 
 		 397 aa  716    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5075  elongation factor Tu  81.11 
 
 		 396 aa  654    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602594  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  81.61 
 
 		 397 aa  680    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  81.11 
 
 		 396 aa  663    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4509  translation elongation factor Tu  89.17 
 
 		 397 aa  707    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4323  translation elongation factor Tu  84.89 
 
 		 397 aa  681    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6616  translation elongation factor Tu  86.65 
 
 		 397 aa  689    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  82.58 
 
 		 397 aa  693    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29780  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  79.35 
 
 		 396 aa  651    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.573725 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0580  elongation factor Tu  96.73 
 
 		 397 aa  761    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.700966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1015  elongation factor Tu  81.36 
 
 		 396 aa  650    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.345465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1183  translation elongation factor Tu  80.6 
 
 		 397 aa  673    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2661  translation elongation factor Tu  80.1 
 
 		 397 aa  663    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  81.31 
 
 		 396 aa  671    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  86.9 
 
 		 397 aa  715    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0987  elongation factor Tu  81.36 
 
 		 396 aa  650    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6051  elongation factor Tu  100 
 
 		 397 aa  802    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198403  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3925  elongation factor Tu  84.13 
 
 		 397 aa  669    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2692  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  637    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4317  elongation factor Tu  84.63 
 
 		 397 aa  672    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3145  elongation factor Tu  79.55 
 
 		 396 aa  654    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2979  elongation factor Tu  78.09 
 
 		 396 aa  638    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.990994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0924  translation elongation factor Tu  89.92 
 
 		 397 aa  711    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0489446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  85.89 
 
 		 397 aa  708    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  83.38 
 
 		 397 aa  692    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1005  elongation factor Tu  81.36 
 
 		 396 aa  650    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  81.61 
 
 		 396 aa  671    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0685  elongation factor Tu  84.13 
 
 		 397 aa  674    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1084  elongation factor Tu  86.15 
 
 		 397 aa  676    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0625  translation elongation factor Tu  77.36 
 
 		 401 aa  637    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0396  translation elongation factor Tu  79.85 
 
 		 395 aa  628  1e-179  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  77.44 
 
 		 396 aa  625  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  77.44 
 
 		 396 aa  625  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  76.32 
 
 		 395 aa  625  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  75.94 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  75.94 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  77.19 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23870  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  74.81 
 
 		 395 aa  617  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  76.69 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  76.69 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  75.38 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  76.44 
 
 		 396 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  76.44 
 
 		 396 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  76.44 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  75.44 
 
 		 396 aa  616  1e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  73.02 
 
 		 400 aa  614  1e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  75.94 
 
 		 396 aa  617  1e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  75.5 
 
 		 397 aa  612  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  75.94 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  75.44 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  73.93 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  73.93 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  75.94 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  75.44 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000705932  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  75.94 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  75.44 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  76.32 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  75.63 
 
 		 397 aa  611  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  73.38 
 
 		 399 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  75.5 
 
 		 397 aa  612  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  73.99 
 
 		 394 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  73.99 
 
 		 394 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  75.25 
 
 		 397 aa  610  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  76.32 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  74.69 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  76.57 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  76.57 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  73.07 
 
 		 399 aa  607  1e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  73.74 
 
 		 394 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  73.74 
 
 		 394 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  73.07 
 
 		 399 aa  608  1e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  74.69 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  72.39 
 
 		 399 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  74.24 
 
 		 394 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  74.49 
 
 		 394 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  73.63 
 
 		 400 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  73.32 
 
 		 399 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  72.89 
 
 		 399 aa  605  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  73.68 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  73.68 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  72.39 
 
 		 399 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  75.57 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0495  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 394 aa  607  9.999999999999999e-173  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  74.49 
 
 		 395 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  74.49 
 
 		 395 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  72.39 
 
 		 399 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  74.87 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>