More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1183 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4323  translation elongation factor Tu  81.61 
 
 		 397 aa  669    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3145  elongation factor Tu  80.56 
 
 		 396 aa  662    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1015  elongation factor Tu  81.36 
 
 		 396 aa  658    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.345465 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0685  elongation factor Tu  81.61 
 
 		 397 aa  650    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  81.86 
 
 		 397 aa  688    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  80.56 
 
 		 396 aa  664    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5075  elongation factor Tu  82.12 
 
 		 396 aa  664    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602594  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6616  translation elongation factor Tu  82.12 
 
 		 397 aa  669    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0585  translation elongation factor Tu  77.33 
 
 		 396 aa  640    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344387  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  82.32 
 
 		 397 aa  686    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0580  elongation factor Tu  82.62 
 
 		 397 aa  665    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.700966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6051  elongation factor Tu  80.6 
 
 		 397 aa  645    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198403  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  81.86 
 
 		 396 aa  667    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29780  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  78.59 
 
 		 396 aa  647    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.573725 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2692  elongation factor Tu  79.09 
 
 		 396 aa  647    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0987  elongation factor Tu  81.36 
 
 		 396 aa  658    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  80.35 
 
 		 397 aa  672    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4317  elongation factor Tu  84.38 
 
 		 397 aa  672    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0924  translation elongation factor Tu  83.38 
 
 		 397 aa  668    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0489446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  83.38 
 
 		 397 aa  694    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2661  translation elongation factor Tu  82.12 
 
 		 397 aa  678    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1183  translation elongation factor Tu  100 
 
 		 397 aa  807    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0560  translation elongation factor Tu  80.86 
 
 		 397 aa  658    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4509  translation elongation factor Tu  82.87 
 
 		 397 aa  666    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2979  elongation factor Tu  79.09 
 
 		 396 aa  647    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.990994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1084  elongation factor Tu  82.12 
 
 		 397 aa  659    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  80.86 
 
 		 397 aa  669    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3925  elongation factor Tu  84.13 
 
 		 397 aa  671    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  82.37 
 
 		 397 aa  686    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10699  elongation factor Tu  81.86 
 
 		 396 aa  644    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1005  elongation factor Tu  81.36 
 
 		 396 aa  658    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  81.36 
 
 		 396 aa  669    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23870  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  76.83 
 
 		 395 aa  633  1e-180  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0625  translation elongation factor Tu  76.62 
 
 		 401 aa  627  1e-179  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1119  translation elongation factor Tu  78.09 
 
 		 396 aa  621  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17200  elongation factor Tu  78.34 
 
 		 396 aa  610  9.999999999999999e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  74.06 
 
 		 395 aa  609  1e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  72.82 
 
 		 400 aa  605  9.999999999999999e-173  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0396  translation elongation factor Tu  75.82 
 
 		 395 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  74 
 
 		 397 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  74 
 
 		 397 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  72.68 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  72.68 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  71.18 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  71.18 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  71.46 
 
 		 394 aa  591  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  71.46 
 
 		 394 aa  591  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1094  elongation factor Tu domain protein  73 
 
 		 399 aa  590  1e-167  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  72.18 
 
 		 396 aa  590  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  70.82 
 
 		 399 aa  588  1e-167  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  71.25 
 
 		 397 aa  587  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  72.18 
 
 		 396 aa  590  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  70.9 
 
 		 400 aa  588  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  70.82 
 
 		 399 aa  588  1e-167  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  70.96 
 
 		 395 aa  589  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  70.96 
 
 		 395 aa  589  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  71.46 
 
 		 394 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  71.46 
 
 		 394 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0238  elongation factor Tu  70.28 
 
 		 397 aa  586  1e-166  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602877  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  71.18 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  71.21 
 
 		 394 aa  584  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  71.36 
 
 		 397 aa  585  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  72.14 
 
 		 400 aa  586  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  71.46 
 
 		 394 aa  584  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  71.46 
 
 		 394 aa  584  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  72.36 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  71.93 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  69.44 
 
 		 394 aa  586  1e-166  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  69.58 
 
 		 399 aa  586  1e-166  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  71.18 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  71.18 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  71.18 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  70.43 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03570  elongation factor Tu  74.49 
 
 		 394 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000218481  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  71.21 
 
 		 394 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  69.17 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  69.17 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  73.3 
 
 		 395 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  69.15 
 
 		 399 aa  583  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  70.43 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  70.43 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0835  elongation factor Tu  71.25 
 
 		 397 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.010413  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0822  elongation factor Tu  71.25 
 
 		 400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0296542  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  69.15 
 
 		 399 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06230  elongation factor Tu  71.5 
 
 		 397 aa  583  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06090  elongation factor Tu  71.5 
 
 		 397 aa  583  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.878067  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  71.86 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  71.86 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2952  elongation factor Tu  71.29 
 
 		 402 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00124181  hitchhiker  0.00000107296 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>