More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3466 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2661  translation elongation factor Tu  83.84 
 
 		 397 aa  687    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1183  translation elongation factor Tu  80.56 
 
 		 397 aa  664    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  81.82 
 
 		 397 aa  676    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4509  translation elongation factor Tu  86.87 
 
 		 397 aa  689    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10699  elongation factor Tu  90.63 
 
 		 396 aa  709    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29780  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  80.81 
 
 		 396 aa  661    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.573725 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6616  translation elongation factor Tu  82.58 
 
 		 397 aa  659    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1119  translation elongation factor Tu  85.82 
 
 		 396 aa  687    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0625  translation elongation factor Tu  80.55 
 
 		 401 aa  659    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1084  elongation factor Tu  83.59 
 
 		 397 aa  667    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0560  translation elongation factor Tu  82.07 
 
 		 397 aa  660    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  100 
 
 		 396 aa  806    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5075  elongation factor Tu  90.63 
 
 		 396 aa  721    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602594  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0580  elongation factor Tu  81.82 
 
 		 397 aa  652    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.700966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  85.86 
 
 		 397 aa  705    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6051  elongation factor Tu  81.31 
 
 		 397 aa  637    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198403  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4317  elongation factor Tu  83.33 
 
 		 397 aa  652    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23870  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  79.44 
 
 		 395 aa  659    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  92.39 
 
 		 396 aa  749    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0987  elongation factor Tu  89.59 
 
 		 396 aa  715    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0685  elongation factor Tu  82.07 
 
 		 397 aa  656    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1015  elongation factor Tu  89.59 
 
 		 396 aa  715    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.345465 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  80.56 
 
 		 397 aa  671    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3145  elongation factor Tu  81.61 
 
 		 396 aa  667    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2979  elongation factor Tu  82.58 
 
 		 396 aa  667    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.990994  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  80.56 
 
 		 397 aa  668    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  80.81 
 
 		 397 aa  673    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4323  translation elongation factor Tu  83.08 
 
 		 397 aa  669    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0585  translation elongation factor Tu  81.06 
 
 		 396 aa  670    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344387  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  84.3 
 
 		 397 aa  692    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0924  translation elongation factor Tu  82.03 
 
 		 397 aa  653    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0489446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2692  elongation factor Tu  82.83 
 
 		 396 aa  668    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1005  elongation factor Tu  89.59 
 
 		 396 aa  715    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  90.63 
 
 		 396 aa  738    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3925  elongation factor Tu  82.83 
 
 		 397 aa  650    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17200  elongation factor Tu  81.52 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  75.51 
 
 		 395 aa  619  1e-176  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1094  elongation factor Tu domain protein  73.75 
 
 		 399 aa  609  1e-173  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0396  translation elongation factor Tu  77.27 
 
 		 395 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  73.87 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  71.36 
 
 		 400 aa  601  1.0000000000000001e-171  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  73.87 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  75.38 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  73.87 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  73.87 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  73.87 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  73.87 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  73.87 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  72.8 
 
 		 394 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  72.8 
 
 		 394 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  73.87 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  73.87 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  73.87 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  73.87 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  72.8 
 
 		 394 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  72.8 
 
 		 394 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  73.87 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  72.86 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000150336  hitchhiker  0.00000130036 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  72.86 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  73.62 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  73.37 
 
 		 396 aa  597  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0254  elongation factor Tu  73.43 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000130058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4449  elongation factor Tu  73.43 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000257017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  74.62 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  74.62 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0495  elongation factor Tu  72.22 
 
 		 394 aa  598  1e-170  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  73.62 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  72.86 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000015318  hitchhiker  0.0000000000310582 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  73.43 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  73.43 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  73.62 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3299  elongation factor Tu  72.46 
 
 		 402 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00521718  hitchhiker  0.000291329 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  74.37 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  74.37 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  72.86 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  73.37 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  73.37 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  73.12 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  72.86 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  73.62 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  73.62 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3599  elongation factor Tu  73.18 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0100711  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3797  elongation factor Tu  72.93 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000312567  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  72.86 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  72.86 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  73.37 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  73.37 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3874  elongation factor Tu  73.18 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  72.86 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>