More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4317 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4317  elongation factor Tu  100 
 
 		 397 aa  808    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1015  elongation factor Tu  80.86 
 
 		 396 aa  652    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.345465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  83.12 
 
 		 396 aa  681    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3925  elongation factor Tu  98.99 
 
 		 397 aa  802    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4509  translation elongation factor Tu  86.4 
 
 		 397 aa  691    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  83.38 
 
 		 397 aa  700    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6616  translation elongation factor Tu  84.63 
 
 		 397 aa  683    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  82.12 
 
 		 397 aa  681    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2692  elongation factor Tu  80.86 
 
 		 396 aa  656    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1183  translation elongation factor Tu  84.38 
 
 		 397 aa  702    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  83.33 
 
 		 396 aa  683    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  83.38 
 
 		 397 aa  693    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0560  translation elongation factor Tu  82.62 
 
 		 397 aa  666    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0924  translation elongation factor Tu  87.15 
 
 		 397 aa  696    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0489446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0580  elongation factor Tu  84.89 
 
 		 397 aa  684    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.700966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  81.06 
 
 		 397 aa  679    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5075  elongation factor Tu  82.12 
 
 		 396 aa  664    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602594  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6051  elongation factor Tu  84.63 
 
 		 397 aa  671    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198403  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0685  elongation factor Tu  83.12 
 
 		 397 aa  656    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29780  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  78.84 
 
 		 396 aa  649    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.573725 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0585  translation elongation factor Tu  76.83 
 
 		 396 aa  641    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344387  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0625  translation elongation factor Tu  77.86 
 
 		 401 aa  646    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1084  elongation factor Tu  85.14 
 
 		 397 aa  676    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0987  elongation factor Tu  80.86 
 
 		 396 aa  652    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2661  translation elongation factor Tu  82.37 
 
 		 397 aa  682    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10699  elongation factor Tu  82.62 
 
 		 396 aa  649    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3145  elongation factor Tu  81.82 
 
 		 396 aa  668    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2979  elongation factor Tu  80.6 
 
 		 396 aa  654    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.990994  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  82.87 
 
 		 397 aa  691    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4323  translation elongation factor Tu  82.87 
 
 		 397 aa  673    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  84.89 
 
 		 397 aa  699    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1005  elongation factor Tu  80.86 
 
 		 396 aa  652    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  81.61 
 
 		 396 aa  675    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1119  translation elongation factor Tu  80.35 
 
 		 396 aa  637    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23870  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  76.32 
 
 		 395 aa  628  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  75.57 
 
 		 395 aa  624  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17200  elongation factor Tu  79.6 
 
 		 396 aa  617  1e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232418  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  73.27 
 
 		 400 aa  616  1e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  74.5 
 
 		 397 aa  608  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 394 aa  608  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 394 aa  608  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 394 aa  610  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 394 aa  610  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  73.68 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  73.68 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  73.93 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  74.62 
 
 		 397 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  73.93 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  73.93 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  73.93 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0396  translation elongation factor Tu  76.07 
 
 		 395 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  72.18 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  72.18 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  71.64 
 
 		 400 aa  600  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 394 aa  597  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  73 
 
 		 397 aa  599  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  73.93 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0495  elongation factor Tu  71.79 
 
 		 394 aa  600  1e-170  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  73 
 
 		 397 aa  599  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  72.22 
 
 		 394 aa  596  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  70.53 
 
 		 395 aa  595  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  71.93 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  71.93 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  74.06 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  72.36 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  71.93 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  594  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 394 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 394 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  72.18 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  71.93 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  74.06 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0238  elongation factor Tu  71.36 
 
 		 397 aa  593  1e-168  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602877  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  71.39 
 
 		 400 aa  591  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  72.7 
 
 		 400 aa  593  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  70.43 
 
 		 396 aa  594  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  70.43 
 
 		 396 aa  594  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  72.14 
 
 		 400 aa  592  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  70.45 
 
 		 394 aa  593  1e-168  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  73.18 
 
 		 396 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  71.89 
 
 		 400 aa  594  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  73.18 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  71.72 
 
 		 395 aa  592  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  71.72 
 
 		 395 aa  592  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0734  elongation factor Tu  73.18 
 
 		 391 aa  592  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.481957  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0756  elongation factor Tu  73.18 
 
 		 391 aa  592  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.097757  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2952  elongation factor Tu  71.29 
 
 		 402 aa  592  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00124181  hitchhiker  0.00000107296 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  71.93 
 
 		 396 aa  594  1e-168  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000705932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>