More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0585 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1015  elongation factor Tu  81.01 
 
 		 396 aa  653    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.345465 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  75.82 
 
 		 397 aa  642    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  80.1 
 
 		 397 aa  669    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  81.27 
 
 		 396 aa  670    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2661  translation elongation factor Tu  85.89 
 
 		 397 aa  700    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5075  elongation factor Tu  80.6 
 
 		 396 aa  654    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602594  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23870  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  86.29 
 
 		 395 aa  701    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0585  translation elongation factor Tu  100 
 
 		 396 aa  809    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344387  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29780  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  92.42 
 
 		 396 aa  755    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.573725 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0625  translation elongation factor Tu  88.28 
 
 		 401 aa  716    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  77.33 
 
 		 397 aa  646    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1183  translation elongation factor Tu  77.33 
 
 		 397 aa  640    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  81.06 
 
 		 396 aa  670    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0987  elongation factor Tu  81.01 
 
 		 396 aa  653    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3145  elongation factor Tu  86.58 
 
 		 396 aa  713    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2692  elongation factor Tu  86.11 
 
 		 396 aa  707    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2979  elongation factor Tu  85.86 
 
 		 396 aa  706    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.990994  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10699  elongation factor Tu  80.86 
 
 		 396 aa  638    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  77.58 
 
 		 397 aa  646    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  77.72 
 
 		 397 aa  645    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1005  elongation factor Tu  81.01 
 
 		 396 aa  653    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  81.11 
 
 		 396 aa  673    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17200  elongation factor Tu  84.77 
 
 		 396 aa  661    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232418  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  75.06 
 
 		 397 aa  634  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4509  translation elongation factor Tu  78.59 
 
 		 397 aa  632  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4323  translation elongation factor Tu  77.33 
 
 		 397 aa  632  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1094  elongation factor Tu domain protein  75.94 
 
 		 399 aa  633  1e-180  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1119  translation elongation factor Tu  79.6 
 
 		 396 aa  632  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0580  elongation factor Tu  78.34 
 
 		 397 aa  627  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.700966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6616  translation elongation factor Tu  77.58 
 
 		 397 aa  626  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0852  elongation factor Tu  77.69 
 
 		 399 aa  625  1e-178  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0560  translation elongation factor Tu  76.83 
 
 		 397 aa  623  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0924  translation elongation factor Tu  77.47 
 
 		 397 aa  617  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0489446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1084  elongation factor Tu  77.08 
 
 		 397 aa  617  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0685  elongation factor Tu  76.83 
 
 		 397 aa  616  1e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6051  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 397 aa  616  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198403  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3925  elongation factor Tu  76.83 
 
 		 397 aa  611  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4317  elongation factor Tu  76.83 
 
 		 397 aa  609  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  71.28 
 
 		 395 aa  590  1e-167  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  70 
 
 		 400 aa  587  1e-166  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2157  elongation factor Tu  71 
 
 		 400 aa  587  1e-166  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2170  elongation factor Tu  71 
 
 		 400 aa  587  1e-166  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0151946  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  69.17 
 
 		 396 aa  577  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0396  translation elongation factor Tu  73.05 
 
 		 395 aa  579  1e-164  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  69.17 
 
 		 396 aa  577  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  70.35 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  70.35 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  70.35 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  70.35 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  68.92 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  68.92 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  70.35 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  70.35 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  70.35 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  70.35 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  70.35 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  70.1 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  70.35 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  70.35 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  70.35 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  70.18 
 
 		 396 aa  574  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  70.18 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  70.35 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  69.11 
 
 		 394 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  69.11 
 
 		 394 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  70.35 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0238  elongation factor Tu  69.02 
 
 		 397 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  70.35 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  70.1 
 
 		 396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  70.35 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  69.67 
 
 		 396 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000150336  hitchhiker  0.00000130036 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  70.18 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  68.42 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  68.42 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  69.98 
 
 		 400 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  70.18 
 
 		 396 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  69.92 
 
 		 396 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  69.92 
 
 		 396 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  70.18 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  70.18 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  70.43 
 
 		 396 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  70.43 
 
 		 396 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  69.67 
 
 		 396 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  69.67 
 
 		 396 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  70.18 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  68.18 
 
 		 395 aa  571  1.0000000000000001e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  70.18 
 
 		 396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  70.18 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  70.18 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  69.67 
 
 		 396 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000015318  hitchhiker  0.0000000000310582 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  70.18 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  70.18 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  68.86 
 
 		 394 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  68.86 
 
 		 394 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>