More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0625 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0585  translation elongation factor Tu  88.28 
 
 		 396 aa  716    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344387  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  77.61 
 
 		 397 aa  651    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4509  translation elongation factor Tu  80.6 
 
 		 397 aa  640    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  80.35 
 
 		 396 aa  662    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2661  translation elongation factor Tu  84.08 
 
 		 397 aa  684    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23870  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  84.29 
 
 		 395 aa  694    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1015  elongation factor Tu  79.1 
 
 		 396 aa  634    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.345465 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0625  translation elongation factor Tu  100 
 
 		 401 aa  816    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17200  elongation factor Tu  83.79 
 
 		 396 aa  657    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232418  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1119  translation elongation factor Tu  81.34 
 
 		 396 aa  642    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3145  elongation factor Tu  86.5 
 
 		 396 aa  702    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  77.56 
 
 		 397 aa  644    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  79.35 
 
 		 397 aa  659    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0987  elongation factor Tu  79.1 
 
 		 396 aa  634    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29780  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  88.28 
 
 		 396 aa  716    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.573725 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2692  elongation factor Tu  86.03 
 
 		 396 aa  701    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  80.55 
 
 		 396 aa  659    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2979  elongation factor Tu  86.03 
 
 		 396 aa  703    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.990994  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5075  elongation factor Tu  78.86 
 
 		 396 aa  634    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602594  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1005  elongation factor Tu  79.1 
 
 		 396 aa  634    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  79.6 
 
 		 396 aa  654    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  76.12 
 
 		 397 aa  633  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  76.43 
 
 		 397 aa  634  1e-180  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1183  translation elongation factor Tu  76.62 
 
 		 397 aa  627  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0924  translation elongation factor Tu  78.11 
 
 		 397 aa  624  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0489446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  75.87 
 
 		 397 aa  625  1e-178  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10699  elongation factor Tu  78.86 
 
 		 396 aa  620  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0580  elongation factor Tu  78.61 
 
 		 397 aa  622  1e-177  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.700966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0685  elongation factor Tu  78.36 
 
 		 397 aa  620  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6616  translation elongation factor Tu  77.61 
 
 		 397 aa  620  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0560  translation elongation factor Tu  76.37 
 
 		 397 aa  620  1e-176  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4323  translation elongation factor Tu  76.12 
 
 		 397 aa  617  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1084  elongation factor Tu  77.11 
 
 		 397 aa  616  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4317  elongation factor Tu  77.86 
 
 		 397 aa  614  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3925  elongation factor Tu  77.86 
 
 		 397 aa  616  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  72.07 
 
 		 400 aa  605  9.999999999999999e-173  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6051  elongation factor Tu  77.36 
 
 		 397 aa  605  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198403  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  72.25 
 
 		 394 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  72.25 
 
 		 394 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1094  elongation factor Tu domain protein  74.26 
 
 		 399 aa  603  1.0000000000000001e-171  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  72 
 
 		 394 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  72 
 
 		 394 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  72.5 
 
 		 394 aa  598  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  72.14 
 
 		 395 aa  597  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  72.5 
 
 		 394 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  72.25 
 
 		 394 aa  596  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  72.25 
 
 		 394 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2133  translation elongation factor Tu  74.81 
 
 		 400 aa  589  1e-167  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000733128  normal  0.725841 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0396  translation elongation factor Tu  74.31 
 
 		 395 aa  590  1e-167  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  69.95 
 
 		 399 aa  586  1e-166  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09710  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  73.57 
 
 		 400 aa  584  1e-166  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000220871  hitchhiker  0.00000138274 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  68.97 
 
 		 399 aa  585  1e-166  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0852  elongation factor Tu  74.26 
 
 		 399 aa  587  1e-166  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  70.83 
 
 		 400 aa  584  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0611  elongation factor Tu  71.36 
 
 		 394 aa  585  1e-166  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.016281  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23641  elongation factor Tu  68.97 
 
 		 399 aa  586  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  70.97 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  69.5 
 
 		 395 aa  582  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  69.5 
 
 		 395 aa  582  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  69.8 
 
 		 397 aa  581  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2157  elongation factor Tu  71.46 
 
 		 400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2170  elongation factor Tu  71.46 
 
 		 400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0151946  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  71.29 
 
 		 397 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  71.29 
 
 		 397 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  69.38 
 
 		 399 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0238  elongation factor Tu  69.98 
 
 		 397 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602877  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  70.72 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  70.47 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  70.72 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  70.22 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  70.22 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  69.14 
 
 		 399 aa  578  1e-164  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  70.47 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  70.47 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  70.47 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  70.97 
 
 		 396 aa  581  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0495  elongation factor Tu  69.08 
 
 		 394 aa  581  1e-164  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  69.9 
 
 		 397 aa  578  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  70.47 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3761  elongation factor Tu  72.25 
 
 		 394 aa  577  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000788214  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  70.22 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3773  elongation factor Tu  72.25 
 
 		 394 aa  577  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000180335  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  68.47 
 
 		 399 aa  577  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  69.48 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  69.48 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  69.48 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  68.49 
 
 		 396 aa  574  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  68.49 
 
 		 396 aa  574  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2022  elongation factor Tu  69.95 
 
 		 399 aa  574  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.466852  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1600  elongation factor Tu  67.98 
 
 		 399 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3738  elongation factor Tu  72.5 
 
 		 394 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00744191  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  69.48 
 
 		 396 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  69.48 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  69.14 
 
 		 399 aa  576  1.0000000000000001e-163  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  69.48 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  69.48 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  68.47 
 
 		 399 aa  577  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  69.23 
 
 		 396 aa  574  1.0000000000000001e-163  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17111  elongation factor Tu  67.98 
 
 		 399 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16881  elongation factor Tu  68.23 
 
 		 399 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>