More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2133 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_09710  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  89.25 
 
 		 400 aa  720    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000220871  hitchhiker  0.00000138274 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1178  translation elongation factor Tu  75.8 
 
 		 401 aa  635    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000242479  unclonable  0.0000000292333 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  90.25 
 
 		 400 aa  747    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2133  translation elongation factor Tu  100 
 
 		 400 aa  821    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000733128  normal  0.725841 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  78.8 
 
 		 395 aa  650    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 397 aa  632  1e-180  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 397 aa  628  1e-179  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  76.92 
 
 		 397 aa  628  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  76.92 
 
 		 397 aa  628  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  73.63 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  74.63 
 
 		 396 aa  624  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  73.63 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  73.63 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  73.63 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  74.63 
 
 		 396 aa  620  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  74.63 
 
 		 396 aa  620  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  75.62 
 
 		 396 aa  620  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  74.63 
 
 		 396 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  74.63 
 
 		 396 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  74.63 
 
 		 396 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  74.25 
 
 		 397 aa  620  1e-177  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0238  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 397 aa  620  1e-176  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602877  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3874  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3864  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  73.63 
 
 		 396 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  73.63 
 
 		 396 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0625  translation elongation factor Tu  74.81 
 
 		 401 aa  620  1e-176  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 397 aa  619  1e-176  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  73.51 
 
 		 397 aa  619  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  74.14 
 
 		 400 aa  616  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  74.88 
 
 		 400 aa  616  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  74.13 
 
 		 396 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  74.14 
 
 		 400 aa  615  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  75 
 
 		 400 aa  617  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  75 
 
 		 400 aa  617  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  72.77 
 
 		 399 aa  611  9.999999999999999e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  74.63 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  73.18 
 
 		 394 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  73.18 
 
 		 394 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  73.07 
 
 		 397 aa  611  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  73.51 
 
 		 400 aa  611  9.999999999999999e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  73.51 
 
 		 400 aa  612  9.999999999999999e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  73.18 
 
 		 394 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  73.18 
 
 		 394 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  73.32 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  73.32 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  74 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  74.63 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  74.63 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  72.46 
 
 		 397 aa  609  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  72.77 
 
 		 399 aa  608  1e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  71.57 
 
 		 397 aa  609  1e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  74.38 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  74.38 
 
 		 400 aa  609  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  73.38 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  73.38 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3599  elongation factor Tu  73.07 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0100711  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3797  elongation factor Tu  72.82 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000312567  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  74.63 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  74.26 
 
 		 400 aa  608  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  75.31 
 
 		 395 aa  608  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  72.03 
 
 		 399 aa  609  1e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  71.57 
 
 		 397 aa  609  1e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  72.64 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  72.64 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2661  translation elongation factor Tu  74.31 
 
 		 397 aa  610  1e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  72.14 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  72.14 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1183  translation elongation factor Tu  73.07 
 
 		 397 aa  606  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  73.68 
 
 		 394 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 395 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  74.26 
 
 		 400 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  73.25 
 
 		 396 aa  606  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  70.4 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  70.4 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0580  elongation factor Tu  75 
 
 		 397 aa  606  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.700966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  72.39 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  72.97 
 
 		 400 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  71.43 
 
 		 394 aa  607  9.999999999999999e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  72.89 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4509  translation elongation factor Tu  75.06 
 
 		 397 aa  607  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  72.39 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  73.68 
 
 		 394 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  73.88 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  73.88 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  73.88 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  71.46 
 
 		 397 aa  604  1.0000000000000001e-171  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  71.11 
 
 		 399 aa  603  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0254  elongation factor Tu  72.57 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000130058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4449  elongation factor Tu  72.57 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000257017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  71.11 
 
 		 399 aa  601  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  73.57 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  73.57 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  70.43 
 
 		 395 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  70.43 
 
 		 395 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  71.46 
 
 		 397 aa  604  1.0000000000000001e-171  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  73.88 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1331  elongation factor Tu  75.62 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0012019  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  73.88 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  71.11 
 
 		 399 aa  601  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>