More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_09710 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  86.5 
 
 		 400 aa  723    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09710  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  100 
 
 		 400 aa  814    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000220871  hitchhiker  0.00000138274 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  77.56 
 
 		 395 aa  646    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2133  translation elongation factor Tu  89.25 
 
 		 400 aa  720    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000733128  normal  0.725841 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  75.31 
 
 		 397 aa  631  1e-180  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  74.38 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1178  translation elongation factor Tu  74.32 
 
 		 401 aa  628  1e-179  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000242479  unclonable  0.0000000292333 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  74.38 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  74.31 
 
 		 397 aa  630  1e-179  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  74.38 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  74.38 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  74.31 
 
 		 397 aa  630  1e-179  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  75.62 
 
 		 396 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  75.62 
 
 		 396 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  75.93 
 
 		 397 aa  624  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  73.38 
 
 		 396 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  75.12 
 
 		 396 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  75.12 
 
 		 396 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  74.88 
 
 		 396 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  74.88 
 
 		 396 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  75.93 
 
 		 397 aa  624  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  73.38 
 
 		 396 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  73.57 
 
 		 397 aa  622  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 397 aa  619  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  74.63 
 
 		 396 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  74.63 
 
 		 396 aa  617  1e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  73.5 
 
 		 397 aa  616  1e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0625  translation elongation factor Tu  73.57 
 
 		 401 aa  615  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  73.51 
 
 		 397 aa  616  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  74.63 
 
 		 396 aa  616  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  73.45 
 
 		 397 aa  617  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  73.93 
 
 		 394 aa  616  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  73.93 
 
 		 394 aa  616  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0238  elongation factor Tu  73.82 
 
 		 397 aa  615  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602877  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  73.93 
 
 		 394 aa  615  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  73.93 
 
 		 394 aa  615  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  73.13 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  73.32 
 
 		 397 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  76.81 
 
 		 395 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  73.13 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  74.88 
 
 		 400 aa  613  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  73.4 
 
 		 400 aa  611  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  73.4 
 
 		 400 aa  611  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  75 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2661  translation elongation factor Tu  74.31 
 
 		 397 aa  612  9.999999999999999e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  72.64 
 
 		 396 aa  607  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  72.64 
 
 		 396 aa  607  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  72.1 
 
 		 399 aa  607  1e-173  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  77.06 
 
 		 395 aa  610  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  74.13 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  74.13 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  73.46 
 
 		 400 aa  607  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  72.1 
 
 		 399 aa  607  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  72.52 
 
 		 399 aa  609  1e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  72.64 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  73.27 
 
 		 400 aa  608  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  73.27 
 
 		 400 aa  607  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  72.64 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  72.52 
 
 		 399 aa  609  1e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  72.28 
 
 		 399 aa  608  1e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0665  elongation factor Tu  76.12 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.835908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0678  elongation factor Tu  76.12 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.596975  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  72.1 
 
 		 399 aa  607  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4323  translation elongation factor Tu  75.56 
 
 		 397 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  72.39 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  72.39 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  71.85 
 
 		 399 aa  604  9.999999999999999e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  73.4 
 
 		 400 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  72.77 
 
 		 400 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  71.93 
 
 		 395 aa  605  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  71.93 
 
 		 395 aa  605  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  73.13 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  72.77 
 
 		 400 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0734  elongation factor Tu  73.63 
 
 		 391 aa  607  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.481957  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0756  elongation factor Tu  73.63 
 
 		 391 aa  607  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.097757  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  73.07 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  73.93 
 
 		 394 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  72.7 
 
 		 397 aa  603  1.0000000000000001e-171  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  73.07 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  71.82 
 
 		 397 aa  602  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  71.64 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4509  translation elongation factor Tu  74.31 
 
 		 397 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  72.89 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  72.77 
 
 		 400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  72.7 
 
 		 397 aa  603  1.0000000000000001e-171  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  72.7 
 
 		 397 aa  603  1.0000000000000001e-171  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0254  elongation factor Tu  72.32 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000130058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4449  elongation factor Tu  72.32 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000257017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  72.7 
 
 		 397 aa  603  1.0000000000000001e-171  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  72.77 
 
 		 400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  72.25 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  72.39 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  73.93 
 
 		 394 aa  600  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  72.14 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  72.64 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  72.39 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  72.39 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  72.07 
 
 		 396 aa  597  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>