More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1178 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1178  translation elongation factor Tu  100 
 
 		 401 aa  825    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000242479  unclonable  0.0000000292333 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  76.79 
 
 		 400 aa  640    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2133  translation elongation factor Tu  75.8 
 
 		 400 aa  607  9.999999999999999e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000733128  normal  0.725841 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09710  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  74.32 
 
 		 400 aa  600  1e-170  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000220871  hitchhiker  0.00000138274 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  70.9 
 
 		 395 aa  597  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  70.22 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  70.25 
 
 		 395 aa  587  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  70.25 
 
 		 395 aa  587  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  70.22 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  70.22 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  70.22 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  69.73 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  69.73 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  69.33 
 
 		 399 aa  583  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  70.5 
 
 		 397 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl621  elongation factor Tu  69.75 
 
 		 394 aa  577  1e-164  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  69.73 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  69.73 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  69.73 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  69.73 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  68.91 
 
 		 396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  69.23 
 
 		 397 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  70.07 
 
 		 396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  70.07 
 
 		 396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  70.02 
 
 		 400 aa  574  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  69.23 
 
 		 396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  69.23 
 
 		 396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  69.48 
 
 		 396 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  68.91 
 
 		 396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  69.23 
 
 		 396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16881  elongation factor Tu  69.58 
 
 		 399 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  68.98 
 
 		 396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  68.41 
 
 		 397 aa  574  1.0000000000000001e-163  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0792  elongation factor Tu  70.1 
 
 		 396 aa  574  1.0000000000000001e-163  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.476652  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  70.02 
 
 		 400 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  69.23 
 
 		 397 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  69.48 
 
 		 396 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16311  elongation factor Tu  68.58 
 
 		 399 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3997  translation elongation factor Tu  71.18 
 
 		 394 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  68.41 
 
 		 397 aa  571  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1074  elongation factor Tu  68.58 
 
 		 399 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  68.49 
 
 		 396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1600  elongation factor Tu  68.58 
 
 		 399 aa  571  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  69.58 
 
 		 395 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23641  elongation factor Tu  68.58 
 
 		 399 aa  574  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  70.47 
 
 		 396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  70.47 
 
 		 396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19491  elongation factor Tu  68.33 
 
 		 399 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17111  elongation factor Tu  68.58 
 
 		 399 aa  571  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16991  elongation factor Tu  68.58 
 
 		 399 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  68.81 
 
 		 397 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  67.41 
 
 		 397 aa  570  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  68.24 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06230  elongation factor Tu  69.55 
 
 		 397 aa  569  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141067  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0238  elongation factor Tu  70.4 
 
 		 397 aa  570  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602877  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  68.56 
 
 		 397 aa  568  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2549  elongation factor Tu  68.41 
 
 		 391 aa  568  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.812394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2536  elongation factor Tu  68.41 
 
 		 391 aa  568  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2157  elongation factor Tu  67.65 
 
 		 400 aa  568  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2170  elongation factor Tu  67.65 
 
 		 400 aa  568  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0151946  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  68.24 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  69.55 
 
 		 397 aa  570  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06090  elongation factor Tu  69.55 
 
 		 397 aa  569  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.878067  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  69.55 
 
 		 397 aa  570  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  67.41 
 
 		 397 aa  567  1e-161  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  68.64 
 
 		 399 aa  568  1e-161  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  67.74 
 
 		 396 aa  567  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  67.74 
 
 		 396 aa  567  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  68.24 
 
 		 396 aa  565  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  68.24 
 
 		 396 aa  565  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  68.33 
 
 		 394 aa  566  1e-160  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1054  translation elongation factor Tu  70.57 
 
 		 394 aa  567  1e-160  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  68.15 
 
 		 399 aa  566  1e-160  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  70.02 
 
 		 400 aa  567  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  68.98 
 
 		 396 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1707  elongation factor Tu  68.41 
 
 		 391 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1714  elongation factor Tu  68.41 
 
 		 391 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  68.49 
 
 		 396 aa  566  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  68.49 
 
 		 396 aa  566  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  68.24 
 
 		 396 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  68.08 
 
 		 396 aa  565  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0495  elongation factor Tu  68.08 
 
 		 394 aa  564  1e-160  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  68.49 
 
 		 396 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0345  elongation factor Tu  68.41 
 
 		 391 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  0.827994 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0331  elongation factor Tu  68.41 
 
 		 391 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.386625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  68.75 
 
 		 394 aa  566  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  68.75 
 
 		 394 aa  566  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  66.67 
 
 		 395 aa  564  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0359  elongation factor Tu  68.41 
 
 		 391 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  68.75 
 
 		 394 aa  566  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  68.75 
 
 		 394 aa  566  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  67.9 
 
 		 399 aa  565  1e-160  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  68.98 
 
 		 396 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0190  translation elongation factor Tu  70.57 
 
 		 394 aa  567  1e-160  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  68.49 
 
 		 396 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  67.25 
 
 		 396 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2909  translation elongation factor Tu  67.64 
 
 		 405 aa  561  1.0000000000000001e-159  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.124736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  68.73 
 
 		 396 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  68.73 
 
 		 396 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  67.99 
 
 		 396 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000150336  hitchhiker  0.00000130036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>