More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4509 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6051  elongation factor Tu  89.17 
 
 		 397 aa  696    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198403  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2692  elongation factor Tu  80.1 
 
 		 396 aa  656    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1084  elongation factor Tu  87.15 
 
 		 397 aa  689    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  78.2 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  86.87 
 
 		 396 aa  712    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  76.83 
 
 		 395 aa  635    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  78.2 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  85.89 
 
 		 397 aa  715    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5075  elongation factor Tu  85.89 
 
 		 396 aa  687    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602594  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0560  translation elongation factor Tu  83.88 
 
 		 397 aa  678    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4509  translation elongation factor Tu  100 
 
 		 397 aa  806    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1015  elongation factor Tu  85.14 
 
 		 396 aa  680    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.345465 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  78.2 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  78.2 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  84.38 
 
 		 397 aa  707    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4317  elongation factor Tu  86.4 
 
 		 397 aa  681    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0580  elongation factor Tu  90.18 
 
 		 397 aa  713    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.700966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1119  translation elongation factor Tu  83.38 
 
 		 396 aa  659    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0625  translation elongation factor Tu  80.6 
 
 		 401 aa  663    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  85.89 
 
 		 396 aa  701    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29780  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  80.86 
 
 		 396 aa  664    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.573725 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0585  translation elongation factor Tu  78.59 
 
 		 396 aa  655    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344387  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  85.61 
 
 		 397 aa  715    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  78.2 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  78.2 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0987  elongation factor Tu  85.14 
 
 		 396 aa  680    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3145  elongation factor Tu  80.3 
 
 		 396 aa  660    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3925  elongation factor Tu  86.4 
 
 		 397 aa  682    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0924  translation elongation factor Tu  87.91 
 
 		 397 aa  699    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0489446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2661  translation elongation factor Tu  82.62 
 
 		 397 aa  677    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  78.2 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  85.89 
 
 		 397 aa  708    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  78.2 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6616  translation elongation factor Tu  87.15 
 
 		 397 aa  696    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  78.2 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  78.2 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0685  elongation factor Tu  88.16 
 
 		 397 aa  709    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10699  elongation factor Tu  86.15 
 
 		 396 aa  678    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2979  elongation factor Tu  80.35 
 
 		 396 aa  659    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.990994  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  78.2 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  78.2 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  86.65 
 
 		 397 aa  712    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1183  translation elongation factor Tu  82.87 
 
 		 397 aa  687    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  86.4 
 
 		 397 aa  715    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1005  elongation factor Tu  85.14 
 
 		 396 aa  680    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  86.15 
 
 		 396 aa  707    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4323  translation elongation factor Tu  84.63 
 
 		 397 aa  684    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0396  translation elongation factor Tu  80.35 
 
 		 395 aa  634    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  76.69 
 
 		 396 aa  633  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  76.69 
 
 		 396 aa  633  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  77.19 
 
 		 396 aa  632  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000015318  hitchhiker  0.0000000000310582 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  77.39 
 
 		 396 aa  630  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  77.39 
 
 		 396 aa  630  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  77.69 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  77.69 
 
 		 396 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  77.44 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  77.69 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  76.94 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  76.94 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  77.44 
 
 		 396 aa  634  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  77.44 
 
 		 396 aa  634  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23870  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  75.82 
 
 		 395 aa  632  1e-180  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  77.19 
 
 		 396 aa  632  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000150336  hitchhiker  0.00000130036 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  76.44 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  76.44 
 
 		 396 aa  628  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  77.94 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  75.94 
 
 		 396 aa  627  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  75.94 
 
 		 396 aa  627  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  77.94 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  77.94 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  77.69 
 
 		 396 aa  628  1e-179  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  77.14 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  77.14 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0495  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 394 aa  627  1e-179  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3299  elongation factor Tu  75.99 
 
 		 402 aa  627  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00521718  hitchhiker  0.000291329 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  76.69 
 
 		 396 aa  625  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  76.19 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  76.19 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  76.19 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  76.19 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  76.19 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  76.19 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  75.12 
 
 		 400 aa  625  1e-178  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  76.19 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  76.19 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  76.19 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  76.19 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  76.19 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  77.44 
 
 		 396 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  77.44 
 
 		 396 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  77.44 
 
 		 396 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  76.19 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  76.19 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 394 aa  625  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 394 aa  625  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  72.73 
 
 		 394 aa  625  1e-178  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  77.44 
 
 		 396 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  76.19 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  76.19 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  76.19 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>