More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_23641 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1074  elongation factor Tu  91.98 
 
 
399 aa  750    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19491  elongation factor Tu  92.48 
 
 
399 aa  753    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2022  elongation factor Tu  93.73 
 
 
399 aa  750    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.466852  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  94.49 
 
 
399 aa  772    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23641  elongation factor Tu  100 
 
 
399 aa  810    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1600  elongation factor Tu  91.48 
 
 
399 aa  754    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16311  elongation factor Tu  90.23 
 
 
399 aa  747    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16881  elongation factor Tu  91.73 
 
 
399 aa  754    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17111  elongation factor Tu  91.48 
 
 
399 aa  753    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16991  elongation factor Tu  91.48 
 
 
399 aa  754    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0884  elongation factor Tu  78.48 
 
 
409 aa  626  1e-178  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.669879  hitchhiker  0.000241501 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  74 
 
 
395 aa  621  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0662  translation elongation factor Tu  76.04 
 
 
409 aa  618  1e-176  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0150791  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0476  elongation factor Tu  77.02 
 
 
409 aa  619  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.596173  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  73.62 
 
 
394 aa  620  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  73.62 
 
 
394 aa  620  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  73.62 
 
 
394 aa  619  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  73.62 
 
 
394 aa  619  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0708  elongation factor Tu  77.26 
 
 
409 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495117  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0049  elongation factor Tu  76.83 
 
 
410 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  73.87 
 
 
394 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  73.87 
 
 
394 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  73.37 
 
 
394 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  73.62 
 
 
394 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1536  elongation factor Tu  76.28 
 
 
409 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  73.68 
 
 
395 aa  610  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  73.68 
 
 
395 aa  610  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1561  elongation factor Tu  76.28 
 
 
409 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.052718  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1287  elongation factor Tu  76.53 
 
 
409 aa  606  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  72.21 
 
 
399 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  71.46 
 
 
399 aa  597  1e-170  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  71.61 
 
 
394 aa  600  1e-170  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  70.79 
 
 
399 aa  598  1e-170  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  71.04 
 
 
399 aa  597  1e-169  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  71.89 
 
 
397 aa  595  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  71.89 
 
 
397 aa  595  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  71.04 
 
 
399 aa  597  1e-169  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  71.04 
 
 
399 aa  597  1e-169  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  70.72 
 
 
399 aa  593  1e-168  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  72.32 
 
 
396 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4319  elongation factor Tu  73.37 
 
 
394 aa  592  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000023337  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4704  elongation factor Tu  73.12 
 
 
394 aa  592  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000392421  hitchhiker  0.000039393 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  72.32 
 
 
396 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  72.32 
 
 
396 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  72.32 
 
 
396 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  72.17 
 
 
400 aa  591  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3773  elongation factor Tu  73.12 
 
 
394 aa  589  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000180335  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3761  elongation factor Tu  73.12 
 
 
394 aa  589  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000788214  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0611  elongation factor Tu  70.45 
 
 
394 aa  588  1e-167  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.016281  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4509  translation elongation factor Tu  73.88 
 
 
397 aa  588  1e-167  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4764  elongation factor Tu  72.36 
 
 
394 aa  588  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4780  elongation factor Tu  72.36 
 
 
394 aa  588  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253052  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  73.13 
 
 
396 aa  590  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4692  elongation factor Tu  72.61 
 
 
394 aa  589  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  unclonable  0.0000000372179 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  72.1 
 
 
400 aa  590  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  72.1 
 
 
400 aa  588  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  71.07 
 
 
396 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  71.43 
 
 
396 aa  588  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  73.13 
 
 
396 aa  590  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  71.64 
 
 
397 aa  590  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  71.07 
 
 
396 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  71.32 
 
 
396 aa  585  1e-166  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  71.57 
 
 
396 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0182  elongation factor Tu  72.86 
 
 
394 aa  586  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000366988  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  71.57 
 
 
396 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  72.46 
 
 
400 aa  584  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  71.32 
 
 
396 aa  584  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  71.57 
 
 
396 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  72.46 
 
 
400 aa  584  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0168  elongation factor Tu  72.86 
 
 
394 aa  586  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000100576  n/a   
 
 
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  71.32 
 
 
396 aa  585  1e-166  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0625  translation elongation factor Tu  68.97 
 
 
401 aa  586  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0170  elongation factor Tu  72.86 
 
 
394 aa  586  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000210333  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0134  elongation factor Tu  72.86 
 
 
394 aa  585  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000637762  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  73.25 
 
 
395 aa  585  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0144  elongation factor Tu  73.12 
 
 
394 aa  587  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195175  normal  0.039031 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  72.1 
 
 
400 aa  587  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0199  elongation factor Tu  73.3 
 
 
394 aa  586  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000563397  hitchhiker  0.000127621 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0211  elongation factor Tu  73.3 
 
 
394 aa  586  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000453651  unclonable  0.00000937964 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0156  elongation factor Tu  72.86 
 
 
394 aa  585  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000313949  decreased coverage  0.000051786 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  70.57 
 
 
396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  71.25 
 
 
396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  70.57 
 
 
396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  70.57 
 
 
396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  71.32 
 
 
396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  71.32 
 
 
396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  70.57 
 
 
396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  71.32 
 
 
396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  70.57 
 
 
396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  71.32 
 
 
396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  71.78 
 
 
396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  71.78 
 
 
396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  69.08 
 
 
397 aa  581  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  71.25 
 
 
396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  71.25 
 
 
396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0495  elongation factor Tu  68.42 
 
 
394 aa  582  1.0000000000000001e-165  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  69.08 
 
 
397 aa  581  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  70.57 
 
 
396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  70.57 
 
 
396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  70.57 
 
 
396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>