More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1600 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_16991  elongation factor Tu  99.75 
 
 		 399 aa  808    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16881  elongation factor Tu  97.99 
 
 		 399 aa  799    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17111  elongation factor Tu  99.25 
 
 		 399 aa  805    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1074  elongation factor Tu  93.98 
 
 		 399 aa  770    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2022  elongation factor Tu  92.23 
 
 		 399 aa  737    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.466852  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  92.98 
 
 		 399 aa  766    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1600  elongation factor Tu  100 
 
 		 399 aa  810    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0884  elongation factor Tu  79.71 
 
 		 409 aa  634    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.669879  hitchhiker  0.000241501 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16311  elongation factor Tu  94.24 
 
 		 399 aa  773    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23641  elongation factor Tu  91.48 
 
 		 399 aa  754    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19491  elongation factor Tu  93.98 
 
 		 399 aa  769    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0662  translation elongation factor Tu  78 
 
 		 409 aa  626  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0150791  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0476  elongation factor Tu  78.48 
 
 		 409 aa  627  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.596173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  74.75 
 
 		 395 aa  621  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0708  elongation factor Tu  78.97 
 
 		 409 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1536  elongation factor Tu  78.73 
 
 		 409 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1561  elongation factor Tu  78.73 
 
 		 409 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.052718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1287  elongation factor Tu  78.73 
 
 		 409 aa  615  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0049  elongation factor Tu  77.56 
 
 		 410 aa  616  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  73.12 
 
 		 394 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  73.12 
 
 		 394 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  73.12 
 
 		 394 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  73.12 
 
 		 394 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  72.86 
 
 		 394 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  72.86 
 
 		 394 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  73.12 
 
 		 394 aa  606  9.999999999999999e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  73.12 
 
 		 394 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  73.12 
 
 		 394 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 395 aa  602  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 395 aa  602  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  71.53 
 
 		 399 aa  599  1e-170  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  72.21 
 
 		 399 aa  600  1e-170  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  71.96 
 
 		 399 aa  596  1e-169  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  70.05 
 
 		 399 aa  591  1e-168  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  72.82 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  72.57 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  70.05 
 
 		 399 aa  591  1e-168  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  71.22 
 
 		 399 aa  592  1e-168  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  72.57 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  72.32 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  70.05 
 
 		 399 aa  591  1e-168  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  72.57 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  72.57 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  72.82 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  73.13 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  71.64 
 
 		 397 aa  591  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  71.64 
 
 		 397 aa  591  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  71.07 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  71.07 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  71.64 
 
 		 397 aa  588  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  73.13 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  70.32 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  70.32 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  70.65 
 
 		 397 aa  586  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4509  translation elongation factor Tu  73.13 
 
 		 397 aa  584  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  71.57 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  71.57 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0611  elongation factor Tu  70.71 
 
 		 394 aa  584  1e-166  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.016281  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  71.07 
 
 		 397 aa  585  1e-166  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  72.07 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  71.57 
 
 		 396 aa  584  1e-166  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 396 aa  584  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3864  elongation factor Tu  71.25 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3773  elongation factor Tu  72.36 
 
 		 394 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000180335  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3761  elongation factor Tu  72.36 
 
 		 394 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000788214  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  70.57 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  70.57 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  71.75 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  71.75 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  70.57 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  70.57 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  70.57 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  70.57 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  70.57 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  69.83 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  71.6 
 
 		 400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  70.57 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  70.57 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  71.36 
 
 		 400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  71.57 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  70.57 
 
 		 396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3874  elongation factor Tu  71.25 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  71.07 
 
 		 396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  70.57 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  71.75 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  71.75 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  71.36 
 
 		 400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  71.5 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  70.57 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  71.57 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  71.57 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  71.07 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  71.57 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  71.57 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  71.57 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  70.57 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0199  elongation factor Tu  73.3 
 
 		 394 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000563397  hitchhiker  0.000127621 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0211  elongation factor Tu  73.3 
 
 		 394 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000453651  unclonable  0.00000937964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>