More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0884 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_17111  elongation factor Tu  79.71 
 
 		 399 aa  662    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19491  elongation factor Tu  78.73 
 
 		 399 aa  652    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16881  elongation factor Tu  78.97 
 
 		 399 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16311  elongation factor Tu  79.22 
 
 		 399 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0662  translation elongation factor Tu  80.93 
 
 		 409 aa  665    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0150791  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16991  elongation factor Tu  79.71 
 
 		 399 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1074  elongation factor Tu  78.48 
 
 		 399 aa  652    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1287  elongation factor Tu  80.93 
 
 		 409 aa  656    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1561  elongation factor Tu  84.6 
 
 		 409 aa  683    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.052718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  78.73 
 
 		 399 aa  656    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1600  elongation factor Tu  79.71 
 
 		 399 aa  661    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0884  elongation factor Tu  100 
 
 		 409 aa  828    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.669879  hitchhiker  0.000241501 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0049  elongation factor Tu  85.37 
 
 		 410 aa  691    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1536  elongation factor Tu  84.6 
 
 		 409 aa  683    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23641  elongation factor Tu  78.48 
 
 		 399 aa  653    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0476  elongation factor Tu  85.57 
 
 		 409 aa  694    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.596173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0708  elongation factor Tu  80.93 
 
 		 409 aa  654    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2022  elongation factor Tu  77.51 
 
 		 399 aa  629  1e-179  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.466852  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  72.86 
 
 		 399 aa  622  1e-177  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  73.77 
 
 		 399 aa  622  1e-177  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2909  translation elongation factor Tu  75.61 
 
 		 405 aa  618  1e-176  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.124736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  74.39 
 
 		 395 aa  620  1e-176  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2690  translation elongation factor Tu  75.61 
 
 		 405 aa  618  1e-176  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000740208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  73.9 
 
 		 400 aa  618  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  73.41 
 
 		 400 aa  615  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  71.15 
 
 		 399 aa  609  1e-173  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  71.15 
 
 		 399 aa  609  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  71.57 
 
 		 399 aa  609  1e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  72.93 
 
 		 400 aa  608  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  71.81 
 
 		 399 aa  608  1e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  71.15 
 
 		 399 aa  609  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  73.84 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  73.84 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  73.53 
 
 		 400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  73.35 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  71.46 
 
 		 400 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  73.11 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  73.11 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  73.84 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000015318  hitchhiker  0.0000000000310582 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  71.46 
 
 		 400 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  74.02 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000135478  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  73.53 
 
 		 400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  73.28 
 
 		 400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  73.84 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  73.84 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  73.59 
 
 		 396 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  73.59 
 
 		 396 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  73.84 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  73.84 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  73.35 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  72.44 
 
 		 400 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  73.59 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  73.59 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  73.35 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  73.35 
 
 		 396 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  73.35 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  73.84 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  73.84 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  73.28 
 
 		 400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  73.84 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  73.84 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  74.02 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252436  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  73.35 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  73.35 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  73.84 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  73.84 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  73.84 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000150336  hitchhiker  0.00000130036 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  73.84 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  73.84 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  71.64 
 
 		 397 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  71.64 
 
 		 397 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2621  translation elongation factor Tu  71.46 
 
 		 405 aa  599  1e-170  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  72.37 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  72.37 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  73.35 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  73.35 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  71.78 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  71.78 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  71.88 
 
 		 396 aa  597  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1184  translation elongation factor Tu  71.71 
 
 		 405 aa  600  1e-170  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000189456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  71.88 
 
 		 396 aa  597  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  72.26 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  73.84 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  72.37 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  73.59 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  72.02 
 
 		 396 aa  594  1e-169  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  72.62 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  72.44 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  72.62 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  73.53 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  73.53 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  72.62 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  72.62 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  72.62 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  72.62 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  72.62 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  72.62 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  72.62 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  72.37 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  72.62 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>