More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1287 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_16311  elongation factor Tu  76.77 
 
 
399 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0049  elongation factor Tu  80.73 
 
 
410 aa  659    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1536  elongation factor Tu  82.4 
 
 
409 aa  671    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1561  elongation factor Tu  82.4 
 
 
409 aa  671    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.052718  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16881  elongation factor Tu  78.24 
 
 
399 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1074  elongation factor Tu  78 
 
 
399 aa  641    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1287  elongation factor Tu  100 
 
 
409 aa  829    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  76.53 
 
 
399 aa  637    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1600  elongation factor Tu  78.73 
 
 
399 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0884  elongation factor Tu  80.93 
 
 
409 aa  662    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.669879  hitchhiker  0.000241501 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17111  elongation factor Tu  78.73 
 
 
399 aa  647    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0708  elongation factor Tu  88.26 
 
 
409 aa  711    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495117  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0662  translation elongation factor Tu  90.22 
 
 
409 aa  739    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0150791  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23641  elongation factor Tu  76.53 
 
 
399 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0476  elongation factor Tu  80.44 
 
 
409 aa  662    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.596173  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19491  elongation factor Tu  78.24 
 
 
399 aa  641    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16991  elongation factor Tu  78.73 
 
 
399 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2621  translation elongation factor Tu  72.2 
 
 
405 aa  612  9.999999999999999e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169473  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2022  elongation factor Tu  75.79 
 
 
399 aa  613  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.466852  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2690  translation elongation factor Tu  72.44 
 
 
405 aa  612  9.999999999999999e-175  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000740208  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2909  translation elongation factor Tu  72.44 
 
 
405 aa  612  9.999999999999999e-175  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.124736  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1184  translation elongation factor Tu  71.95 
 
 
405 aa  610  1e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000189456  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  72.2 
 
 
400 aa  605  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  72.86 
 
 
397 aa  605  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  72.86 
 
 
397 aa  605  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  72.3 
 
 
400 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  71.46 
 
 
400 aa  604  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  71.95 
 
 
400 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  72.3 
 
 
400 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  69.02 
 
 
405 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  69.02 
 
 
405 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  71.64 
 
 
399 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  72.06 
 
 
399 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  72.55 
 
 
400 aa  599  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  71.71 
 
 
395 aa  600  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  72.55 
 
 
400 aa  599  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  70.76 
 
 
394 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  70.76 
 
 
394 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  70.76 
 
 
394 aa  595  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  70.76 
 
 
394 aa  595  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  71.08 
 
 
399 aa  592  1e-168  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  69.51 
 
 
400 aa  591  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  71.22 
 
 
400 aa  591  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  69.93 
 
 
399 aa  590  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  69.93 
 
 
399 aa  590  1e-167  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  70.59 
 
 
394 aa  588  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  71.15 
 
 
396 aa  589  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  70.42 
 
 
396 aa  587  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  70.42 
 
 
396 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  70.42 
 
 
396 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  70.56 
 
 
395 aa  590  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  70.56 
 
 
395 aa  590  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  69.93 
 
 
399 aa  590  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  70.59 
 
 
394 aa  588  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  71.15 
 
 
396 aa  589  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  70.76 
 
 
394 aa  587  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  69.44 
 
 
397 aa  585  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  68.78 
 
 
400 aa  585  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  69.44 
 
 
399 aa  585  1e-166  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  70.42 
 
 
396 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  70.17 
 
 
396 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  70.17 
 
 
396 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  70.42 
 
 
396 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  70.59 
 
 
394 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  68.78 
 
 
400 aa  585  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  70.27 
 
 
396 aa  584  1e-166  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3874  elongation factor Tu  70.59 
 
 
396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  70.83 
 
 
400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0646  elongation factor Tu  72.68 
 
 
405 aa  583  1.0000000000000001e-165  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.237274  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1869  elongation factor Tu  72.68 
 
 
405 aa  583  1.0000000000000001e-165  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0220689  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  70.83 
 
 
399 aa  584  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3864  elongation factor Tu  70.59 
 
 
396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  68.63 
 
 
400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  68.63 
 
 
400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  69.59 
 
 
396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  69.04 
 
 
397 aa  581  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  70.42 
 
 
396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  69.68 
 
 
396 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  70.66 
 
 
395 aa  578  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  69.44 
 
 
396 aa  580  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  69.44 
 
 
396 aa  580  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  69.68 
 
 
396 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  68.46 
 
 
396 aa  579  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  69.27 
 
 
395 aa  578  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0495  elongation factor Tu  68.22 
 
 
394 aa  580  1e-164  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  69.93 
 
 
396 aa  578  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  69.93 
 
 
396 aa  578  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  69.68 
 
 
396 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  69.68 
 
 
396 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  69.68 
 
 
396 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  69.68 
 
 
396 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  70.17 
 
 
396 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  69.19 
 
 
396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1672  elongation factor Tu  71.08 
 
 
399 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000990168  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  70.42 
 
 
396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  70.42 
 
 
396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  69.19 
 
 
396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  69.68 
 
 
396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  68.46 
 
 
396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  70.1 
 
 
396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>