More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1074 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_23641  elongation factor Tu  91.98 
 
 		 399 aa  750    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19491  elongation factor Tu  99.5 
 
 		 399 aa  802    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16881  elongation factor Tu  94.74 
 
 		 399 aa  772    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1074  elongation factor Tu  100 
 
 		 399 aa  803    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16311  elongation factor Tu  92.48 
 
 		 399 aa  763    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2022  elongation factor Tu  92.48 
 
 		 399 aa  731    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.466852  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  92.73 
 
 		 399 aa  757    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17111  elongation factor Tu  93.48 
 
 		 399 aa  765    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1600  elongation factor Tu  93.98 
 
 		 399 aa  770    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16991  elongation factor Tu  93.73 
 
 		 399 aa  768    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0476  elongation factor Tu  78.24 
 
 		 409 aa  627  1e-179  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.596173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0884  elongation factor Tu  78.48 
 
 		 409 aa  625  1e-178  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.669879  hitchhiker  0.000241501 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0708  elongation factor Tu  78 
 
 		 409 aa  618  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0662  translation elongation factor Tu  76.53 
 
 		 409 aa  617  1e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0150791  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  73.25 
 
 		 395 aa  611  9.999999999999999e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  73.62 
 
 		 394 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  73.62 
 
 		 394 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0049  elongation factor Tu  77.32 
 
 		 410 aa  611  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  73.62 
 
 		 394 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  73.62 
 
 		 394 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1536  elongation factor Tu  77.02 
 
 		 409 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1287  elongation factor Tu  78 
 
 		 409 aa  608  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1561  elongation factor Tu  77.02 
 
 		 409 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.052718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  74.44 
 
 		 395 aa  606  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  74.44 
 
 		 395 aa  606  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  73.87 
 
 		 394 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  73.87 
 
 		 394 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  73.37 
 
 		 394 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  73.62 
 
 		 394 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  71.43 
 
 		 394 aa  599  1e-170  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  72.46 
 
 		 399 aa  599  1e-170  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  71.53 
 
 		 399 aa  596  1e-169  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  72.39 
 
 		 397 aa  591  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  72.39 
 
 		 397 aa  591  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  70.05 
 
 		 399 aa  587  1e-167  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  71.46 
 
 		 399 aa  590  1e-167  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  70.05 
 
 		 399 aa  587  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  70.05 
 
 		 399 aa  587  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  70.82 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  70.82 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  70.72 
 
 		 399 aa  586  1e-166  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  71.85 
 
 		 400 aa  584  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  72.1 
 
 		 400 aa  585  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  72.57 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  71.64 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  71.64 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0495  elongation factor Tu  69.17 
 
 		 394 aa  585  1e-166  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0611  elongation factor Tu  71.46 
 
 		 394 aa  586  1e-166  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.016281  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  72.57 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  71.5 
 
 		 397 aa  585  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  71.85 
 
 		 400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4509  translation elongation factor Tu  73.13 
 
 		 397 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  69.83 
 
 		 397 aa  582  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  71.6 
 
 		 400 aa  581  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  71.89 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  71.89 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  69.83 
 
 		 397 aa  582  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  69.8 
 
 		 396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4704  elongation factor Tu  73.12 
 
 		 394 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000392421  hitchhiker  0.000039393 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  69.83 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  69.83 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  70.65 
 
 		 397 aa  583  1.0000000000000001e-165  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  73.5 
 
 		 395 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  70.82 
 
 		 396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  70.82 
 
 		 396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  73.25 
 
 		 395 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  71.07 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  69.83 
 
 		 397 aa  582  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3761  elongation factor Tu  73.12 
 
 		 394 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000788214  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3773  elongation factor Tu  73.12 
 
 		 394 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000180335  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  71.64 
 
 		 396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  72.14 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  70.32 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  71.64 
 
 		 397 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  70.32 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  69.83 
 
 		 397 aa  582  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  70.82 
 
 		 396 aa  577  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  70.65 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  70.12 
 
 		 400 aa  580  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  71.07 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0102  elongation factor Tu  74.25 
 
 		 395 aa  578  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000129876  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  70.15 
 
 		 397 aa  580  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  70.57 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  70.57 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  70.65 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  68.15 
 
 		 400 aa  578  1e-164  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0144  elongation factor Tu  72.86 
 
 		 394 aa  577  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195175  normal  0.039031 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  70.82 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  70.15 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  70.82 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  70.82 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0665  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.835908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0678  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.596975  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  71.64 
 
 		 397 aa  580  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0211  elongation factor Tu  73.43 
 
 		 394 aa  579  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000453651  unclonable  0.00000937964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>