More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29780 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_5075  elongation factor Tu  81.36 
 
 		 396 aa  657    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602594  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17200  elongation factor Tu  86.36 
 
 		 396 aa  674    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232418  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23870  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  85.86 
 
 		 395 aa  702    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  76.83 
 
 		 397 aa  645    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2692  elongation factor Tu  87.88 
 
 		 396 aa  721    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6616  translation elongation factor Tu  79.6 
 
 		 397 aa  636    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1015  elongation factor Tu  81.11 
 
 		 396 aa  654    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.345465 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0585  translation elongation factor Tu  92.42 
 
 		 396 aa  755    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344387  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  83.12 
 
 		 396 aa  680    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29780  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  100 
 
 		 396 aa  803    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.573725 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  77.08 
 
 		 397 aa  639    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0580  elongation factor Tu  80.35 
 
 		 397 aa  638    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.700966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10699  elongation factor Tu  82.12 
 
 		 396 aa  648    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  81.36 
 
 		 397 aa  676    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  80.81 
 
 		 396 aa  661    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  77.53 
 
 		 397 aa  642    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0987  elongation factor Tu  81.11 
 
 		 396 aa  654    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1119  translation elongation factor Tu  82.12 
 
 		 396 aa  646    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0625  translation elongation factor Tu  88.28 
 
 		 401 aa  716    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2979  elongation factor Tu  88.13 
 
 		 396 aa  722    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.990994  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4509  translation elongation factor Tu  80.86 
 
 		 397 aa  641    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  78.59 
 
 		 397 aa  652    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3145  elongation factor Tu  89.37 
 
 		 396 aa  729    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1183  translation elongation factor Tu  78.59 
 
 		 397 aa  647    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2661  translation elongation factor Tu  87.41 
 
 		 397 aa  711    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  78.09 
 
 		 397 aa  641    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1005  elongation factor Tu  81.11 
 
 		 396 aa  654    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  81.86 
 
 		 396 aa  676    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1094  elongation factor Tu domain protein  76.69 
 
 		 399 aa  633  1e-180  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0560  translation elongation factor Tu  77.33 
 
 		 397 aa  626  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0685  elongation factor Tu  79.35 
 
 		 397 aa  627  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0924  translation elongation factor Tu  79.09 
 
 		 397 aa  627  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0489446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1084  elongation factor Tu  78.34 
 
 		 397 aa  621  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0852  elongation factor Tu  77.69 
 
 		 399 aa  622  1e-177  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4323  translation elongation factor Tu  77.08 
 
 		 397 aa  623  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3925  elongation factor Tu  78.59 
 
 		 397 aa  620  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6051  elongation factor Tu  79.35 
 
 		 397 aa  620  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198403  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4317  elongation factor Tu  78.84 
 
 		 397 aa  618  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  73.05 
 
 		 395 aa  596  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0396  translation elongation factor Tu  74.81 
 
 		 395 aa  590  1e-167  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  71 
 
 		 400 aa  590  1e-167  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  69.67 
 
 		 396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  69.67 
 
 		 396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2157  elongation factor Tu  70.75 
 
 		 400 aa  578  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2170  elongation factor Tu  70.75 
 
 		 400 aa  578  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0151946  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  70.43 
 
 		 397 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  69.19 
 
 		 395 aa  577  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  69.19 
 
 		 395 aa  577  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  70.78 
 
 		 397 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  68.41 
 
 		 399 aa  571  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  70.22 
 
 		 400 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  70.2 
 
 		 394 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  70.2 
 
 		 394 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0611  elongation factor Tu  70.23 
 
 		 394 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.016281  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  69.95 
 
 		 394 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  69.95 
 
 		 394 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  69.6 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  69.6 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23641  elongation factor Tu  67.83 
 
 		 399 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  68.67 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  70.28 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  70.28 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0238  elongation factor Tu  68.51 
 
 		 397 aa  570  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602877  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2133  translation elongation factor Tu  73 
 
 		 400 aa  569  1e-161  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000733128  normal  0.725841 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  69.33 
 
 		 399 aa  567  1e-161  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09710  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  72.25 
 
 		 400 aa  567  1e-161  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000220871  hitchhiker  0.00000138274 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  70.28 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  70.28 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  68.67 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  70.5 
 
 		 397 aa  570  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  69.35 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  69.35 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  70.5 
 
 		 397 aa  570  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2952  elongation factor Tu  69.55 
 
 		 402 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00124181  hitchhiker  0.00000107296 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  69.95 
 
 		 394 aa  564  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  67.42 
 
 		 396 aa  567  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  67.42 
 
 		 396 aa  567  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  69.67 
 
 		 396 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  69.67 
 
 		 396 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  69.67 
 
 		 396 aa  565  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  69.67 
 
 		 396 aa  565  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  69.67 
 
 		 396 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>