More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2170 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  76.5 
 
 		 396 aa  634    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  76.5 
 
 		 396 aa  634    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  76.5 
 
 		 396 aa  634    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2157  elongation factor Tu  100 
 
 		 400 aa  810    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2170  elongation factor Tu  100 
 
 		 400 aa  810    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0151946  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  76.5 
 
 		 396 aa  634    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  75.5 
 
 		 396 aa  628  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  75.5 
 
 		 396 aa  628  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  76.5 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  76.5 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  79.16 
 
 		 397 aa  629  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  79.16 
 
 		 397 aa  629  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  75 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  75 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  75.75 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  75.75 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  74.75 
 
 		 396 aa  623  1e-177  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  75.75 
 
 		 396 aa  623  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  75.75 
 
 		 396 aa  623  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  74.75 
 
 		 396 aa  623  1e-177  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  74.06 
 
 		 397 aa  619  1e-176  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  74.06 
 
 		 397 aa  619  1e-176  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  74.06 
 
 		 397 aa  619  1e-176  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  74.06 
 
 		 397 aa  619  1e-176  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  77 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  77 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  74.5 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  74.5 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3343  elongation factor Tu  78.55 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311584 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0495  elongation factor Tu  74.75 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0610373  hitchhiker  0.00000000794033 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0918  elongation factor Tu  78.8 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0325  elongation factor Tu  74.75 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.275223  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0311  elongation factor Tu  74.75 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  74.5 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  74.5 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  74.5 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0483  elongation factor Tu  74.75 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000918892  hitchhiker  0.00000259901 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  74.5 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  74.5 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  74.5 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3330  elongation factor Tu  78.55 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.91579e-16 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  74.5 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  74.5 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  74 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  73.25 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  73.25 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  72.5 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000705932  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  73.25 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  74.75 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  73.07 
 
 		 397 aa  611  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  73 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  73 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  73.25 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  73.5 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  73.25 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  73.25 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  73 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  74 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1053  elongation factor Tu  77.81 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0848244  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  73.25 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1066  elongation factor Tu  77.81 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093515  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  74.5 
 
 		 400 aa  609  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  74.5 
 
 		 400 aa  610  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  73.5 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000150336  hitchhiker  0.00000130036 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0665  elongation factor Tu  77.81 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.835908  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  72.5 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  73.5 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  74.25 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  74.25 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  73.75 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  73.75 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  73.5 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000015318  hitchhiker  0.0000000000310582 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 400 aa  608  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0678  elongation factor Tu  77.81 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.596975  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2859  elongation factor Tu  76.81 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2871  elongation factor Tu  76.81 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.373737  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  73 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06090  elongation factor Tu  73.82 
 
 		 397 aa  606  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.878067  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 394 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  72.82 
 
 		 397 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  73.18 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000135478  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0035  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775684  hitchhiker  0.000000000148389 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  73 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  73.18 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252436  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  73.25 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 397 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  74.94 
 
 		 394 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 394 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  75.19 
 
 		 394 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06230  elongation factor Tu  73.82 
 
 		 397 aa  606  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141067  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  71.75 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  72.75 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  72.75 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0380  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0403  elongation factor Tu  74.75 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000926456  normal  0.170531 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  72.75 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  72.75 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  72.75 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  71.75 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>