More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3145 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_23870  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  86.8 
 
 		 395 aa  717    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2661  translation elongation factor Tu  88.89 
 
 		 397 aa  723    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10699  elongation factor Tu  81.31 
 
 		 396 aa  641    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  79.29 
 
 		 397 aa  661    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0924  translation elongation factor Tu  81.27 
 
 		 397 aa  642    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0489446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  79.04 
 
 		 397 aa  654    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6616  translation elongation factor Tu  81.06 
 
 		 397 aa  647    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1119  translation elongation factor Tu  83.84 
 
 		 396 aa  655    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4317  elongation factor Tu  81.82 
 
 		 397 aa  637    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5075  elongation factor Tu  81.06 
 
 		 396 aa  654    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602594  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  79.04 
 
 		 397 aa  653    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0580  elongation factor Tu  81.06 
 
 		 397 aa  641    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.700966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1015  elongation factor Tu  82.03 
 
 		 396 aa  659    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.345465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29780  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  89.37 
 
 		 396 aa  729    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.573725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4323  translation elongation factor Tu  79.29 
 
 		 397 aa  639    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  83.04 
 
 		 396 aa  684    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0625  translation elongation factor Tu  86.5 
 
 		 401 aa  702    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4509  translation elongation factor Tu  80.3 
 
 		 397 aa  636    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0987  elongation factor Tu  82.03 
 
 		 396 aa  659    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1183  translation elongation factor Tu  80.56 
 
 		 397 aa  662    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2979  elongation factor Tu  90.13 
 
 		 396 aa  735    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.990994  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17200  elongation factor Tu  88.58 
 
 		 396 aa  689    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232418  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  78.54 
 
 		 397 aa  654    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  81.61 
 
 		 396 aa  667    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2692  elongation factor Tu  90.38 
 
 		 396 aa  736    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  80.76 
 
 		 397 aa  662    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3145  elongation factor Tu  100 
 
 		 396 aa  811    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  81.57 
 
 		 397 aa  674    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1005  elongation factor Tu  82.03 
 
 		 396 aa  659    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  81.31 
 
 		 396 aa  670    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0585  translation elongation factor Tu  86.58 
 
 		 396 aa  713    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344387  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3925  elongation factor Tu  81.82 
 
 		 397 aa  639    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0560  translation elongation factor Tu  78.28 
 
 		 397 aa  633  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0685  elongation factor Tu  79.29 
 
 		 397 aa  625  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1094  elongation factor Tu domain protein  76.5 
 
 		 399 aa  624  1e-177  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1084  elongation factor Tu  78.54 
 
 		 397 aa  623  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6051  elongation factor Tu  79.55 
 
 		 397 aa  622  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198403  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0852  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 399 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0396  translation elongation factor Tu  74.43 
 
 		 395 aa  593  1e-168  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  71.14 
 
 		 400 aa  592  1e-168  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  72.73 
 
 		 395 aa  592  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  71.46 
 
 		 394 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  71.46 
 
 		 394 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  71.46 
 
 		 394 aa  587  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  71.46 
 
 		 394 aa  587  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  71.46 
 
 		 394 aa  578  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  71.46 
 
 		 394 aa  578  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  71.46 
 
 		 394 aa  577  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  70.6 
 
 		 397 aa  574  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23641  elongation factor Tu  69 
 
 		 399 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  70.65 
 
 		 400 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  68.18 
 
 		 395 aa  576  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  68.18 
 
 		 395 aa  576  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  71.46 
 
 		 394 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  69.02 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  69.02 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  69.08 
 
 		 399 aa  572  1.0000000000000001e-162  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  68.33 
 
 		 399 aa  570  1e-161  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  68.75 
 
 		 399 aa  569  1e-161  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1184  translation elongation factor Tu  69.14 
 
 		 405 aa  567  1e-161  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000189456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2157  elongation factor Tu  69.42 
 
 		 400 aa  570  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2170  elongation factor Tu  69.42 
 
 		 400 aa  570  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0151946  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  70.28 
 
 		 397 aa  570  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  68.26 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  68.26 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  70.6 
 
 		 397 aa  568  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  70.6 
 
 		 397 aa  568  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  69.02 
 
 		 396 aa  565  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  69.1 
 
 		 397 aa  565  1e-160  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  69.77 
 
 		 396 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  69.27 
 
 		 396 aa  565  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3911  elongation factor Tu  68.09 
 
 		 397 aa  564  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0156728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  67.25 
 
 		 396 aa  566  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  67.25 
 
 		 396 aa  566  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2621  translation elongation factor Tu  69.14 
 
 		 405 aa  567  1e-160  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  69.27 
 
 		 396 aa  565  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  69.77 
 
 		 396 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  68.01 
 
 		 396 aa  565  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  68.01 
 
 		 396 aa  565  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  69.02 
 
 		 396 aa  565  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06090  elongation factor Tu  69.35 
 
 		 397 aa  567  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.878067  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  69.77 
 
 		 396 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  69.77 
 
 		 396 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3923  elongation factor Tu  68.09 
 
 		 397 aa  564  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.375909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16991  elongation factor Tu  68.75 
 
 		 399 aa  564  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  69.52 
 
 		 396 aa  564  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  69.52 
 
 		 396 aa  564  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  70.03 
 
 		 396 aa  565  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  69.1 
 
 		 397 aa  565  1e-160  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  70.35 
 
 		 396 aa  565  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06230  elongation factor Tu  69.35 
 
 		 397 aa  567  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141067  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  67.83 
 
 		 399 aa  564  1e-160  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  69.08 
 
 		 400 aa  565  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3997  translation elongation factor Tu  71.83 
 
 		 394 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  70.03 
 
 		 396 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2133  translation elongation factor Tu  72.43 
 
 		 400 aa  563  1.0000000000000001e-159  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000733128  normal  0.725841 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  69.52 
 
 		 396 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0822  elongation factor Tu  68.34 
 
 		 400 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0296542  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09710  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  71.93 
 
 		 400 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000220871  hitchhiker  0.00000138274 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0238  elongation factor Tu  68.67 
 
 		 397 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>