More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3997 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  77.66 
 
 
396 aa  644    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  78.28 
 
 
396 aa  649    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  77.53 
 
 
395 aa  637    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  79.08 
 
 
394 aa  634    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  79.08 
 
 
394 aa  634    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  78.28 
 
 
396 aa  649    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  76.77 
 
 
396 aa  641    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  78.83 
 
 
394 aa  645    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  76.38 
 
 
400 aa  635    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1054  translation elongation factor Tu  87.56 
 
 
394 aa  688    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  78.17 
 
 
396 aa  645    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0190  translation elongation factor Tu  87.56 
 
 
394 aa  688    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  76.77 
 
 
396 aa  638    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  78.28 
 
 
396 aa  649    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  76.07 
 
 
397 aa  634    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  77.41 
 
 
396 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  78.28 
 
 
396 aa  649    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  78.73 
 
 
396 aa  642    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  78.17 
 
 
396 aa  647    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  78.17 
 
 
396 aa  647    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  77.41 
 
 
396 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  78.83 
 
 
394 aa  645    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  77.02 
 
 
396 aa  641    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  77.92 
 
 
396 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  77.97 
 
 
395 aa  646    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3997  translation elongation factor Tu  100 
 
 
394 aa  799    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  76.77 
 
 
396 aa  641    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  78.17 
 
 
396 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  78.17 
 
 
396 aa  648    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  78.43 
 
 
396 aa  647    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  77.66 
 
 
396 aa  644    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  77.78 
 
 
396 aa  645    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  76.77 
 
 
396 aa  638    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  78.83 
 
 
394 aa  645    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  78.83 
 
 
394 aa  645    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  77.02 
 
 
396 aa  641    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  76.65 
 
 
396 aa  633  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  76.65 
 
 
396 aa  633  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06090  elongation factor Tu  77.22 
 
 
397 aa  631  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.878067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06230  elongation factor Tu  77.22 
 
 
397 aa  631  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141067  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  78.83 
 
 
394 aa  631  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  78.83 
 
 
394 aa  632  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  77.72 
 
 
397 aa  629  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  76.07 
 
 
399 aa  630  1e-179  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  76.9 
 
 
396 aa  629  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  75.82 
 
 
399 aa  628  1e-179  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  77.72 
 
 
397 aa  629  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  75.63 
 
 
396 aa  628  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  75.63 
 
 
396 aa  628  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  75.38 
 
 
396 aa  628  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  75.38 
 
 
396 aa  628  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  77.89 
 
 
400 aa  629  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  78.54 
 
 
396 aa  627  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  78.54 
 
 
396 aa  627  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  76.9 
 
 
396 aa  629  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  75.25 
 
 
400 aa  628  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  75.25 
 
 
400 aa  629  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0678  elongation factor Tu  79.44 
 
 
396 aa  625  1e-178  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.596975  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  76.4 
 
 
396 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0734  elongation factor Tu  76.77 
 
 
391 aa  627  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.481957  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0665  elongation factor Tu  79.44 
 
 
396 aa  625  1e-178  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.835908  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  76.65 
 
 
396 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  76.65 
 
 
396 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  76.65 
 
 
396 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  76.4 
 
 
396 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  76.65 
 
 
396 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  76.65 
 
 
396 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  75.82 
 
 
397 aa  626  1e-178  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  74.49 
 
 
394 aa  626  1e-178  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  76.65 
 
 
396 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3911  elongation factor Tu  75.44 
 
 
397 aa  624  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0156728  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  76.4 
 
 
396 aa  626  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  76.4 
 
 
396 aa  626  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  76.4 
 
 
396 aa  627  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000150336  hitchhiker  0.00000130036 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  76.65 
 
 
396 aa  626  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  76.65 
 
 
396 aa  626  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  76.4 
 
 
396 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  76.65 
 
 
396 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  76.4 
 
 
396 aa  627  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000015318  hitchhiker  0.0000000000310582 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  76.65 
 
 
396 aa  625  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000135478  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  75.19 
 
 
399 aa  625  1e-178  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  76.14 
 
 
396 aa  625  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  76.14 
 
 
396 aa  625  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  74.87 
 
 
396 aa  625  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  76.65 
 
 
396 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  76.4 
 
 
396 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  76.4 
 
 
396 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  76.4 
 
 
396 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  76.4 
 
 
396 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  76.65 
 
 
396 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  76.65 
 
 
396 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0756  elongation factor Tu  76.77 
 
 
391 aa  627  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.097757  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  74.87 
 
 
396 aa  625  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  76.65 
 
 
396 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  76.65 
 
 
396 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  76.4 
 
 
396 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  76.4 
 
 
396 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  76.4 
 
 
396 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  76.4 
 
 
396 aa  627  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  76.4 
 
 
396 aa  627  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>