More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1054 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1054  translation elongation factor Tu  100 
 
 		 394 aa  795    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  76.01 
 
 		 396 aa  635    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  76.01 
 
 		 396 aa  635    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  76.46 
 
 		 395 aa  638    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  76.01 
 
 		 396 aa  635    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3997  translation elongation factor Tu  87.56 
 
 		 394 aa  691    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  76.01 
 
 		 396 aa  635    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0190  translation elongation factor Tu  100 
 
 		 394 aa  795    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  75.5 
 
 		 400 aa  628  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  75.76 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  75.76 
 
 		 396 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  75.76 
 
 		 396 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  75.76 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  74.75 
 
 		 396 aa  627  1e-178  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  74.75 
 
 		 396 aa  627  1e-178  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  75 
 
 		 396 aa  625  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  75.76 
 
 		 396 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 396 aa  624  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  75 
 
 		 396 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  75 
 
 		 396 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  74.74 
 
 		 394 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  74.74 
 
 		 394 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  74.74 
 
 		 394 aa  622  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  74.74 
 
 		 394 aa  622  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  74.24 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  73.3 
 
 		 397 aa  619  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  74.75 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  74.24 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  72.19 
 
 		 394 aa  618  1e-176  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  73.05 
 
 		 397 aa  616  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  73.99 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  73.99 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  75 
 
 		 400 aa  617  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  72.04 
 
 		 399 aa  615  1e-175  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  73 
 
 		 400 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 395 aa  611  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 396 aa  610  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 396 aa  610  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  73 
 
 		 400 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  73.99 
 
 		 396 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  75 
 
 		 394 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  75 
 
 		 394 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3911  elongation factor Tu  73.55 
 
 		 397 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0156728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06090  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 397 aa  612  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.878067  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  74.37 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06230  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 397 aa  612  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141067  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  73.12 
 
 		 399 aa  614  9.999999999999999e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  76.26 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  76.26 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  73.99 
 
 		 396 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  74.49 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  74.75 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  72.86 
 
 		 399 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  72.75 
 
 		 400 aa  611  9.999999999999999e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  72.75 
 
 		 400 aa  612  9.999999999999999e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  75.7 
 
 		 395 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  75.7 
 
 		 395 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3923  elongation factor Tu  73.55 
 
 		 397 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.375909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3827  translation elongation factor Tu  75.51 
 
 		 394 aa  607  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000173466  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  72.73 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  72.73 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  74 
 
 		 400 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  73.3 
 
 		 397 aa  610  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  74 
 
 		 400 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  72.84 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0199  elongation factor Tu  76.65 
 
 		 394 aa  608  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000563397  hitchhiker  0.000127621 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  73.48 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  73.3 
 
 		 397 aa  610  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  73.35 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  72 
 
 		 400 aa  608  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  73.35 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0198  translation elongation factor Tu  75.51 
 
 		 394 aa  607  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000964902  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0211  elongation factor Tu  76.65 
 
 		 394 aa  608  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000453651  unclonable  0.00000937964 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0678  elongation factor Tu  77.02 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.596975  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0195  elongation factor Tu  75.77 
 
 		 394 aa  608  1e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000854566  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1644  elongation factor Tu  75.77 
 
 		 394 aa  608  1e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.416574  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  74.74 
 
 		 394 aa  608  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  74.74 
 
 		 394 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  72.98 
 
 		 396 aa  607  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  72.84 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0665  elongation factor Tu  77.02 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.835908  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4045  elongation factor Tu  75.26 
 
 		 394 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000276048  hitchhiker  0.00334828 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2871  elongation factor Tu  76.01 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.373737  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0278  elongation factor Tu  75.26 
 
 		 394 aa  605  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000412884  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  72.73 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  72.73 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  72.73 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  73.99 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  72.61 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  72.73 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  72.73 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  72.73 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4428  elongation factor Tu  75.26 
 
 		 394 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000375004  hitchhiker  0.00000974336 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0254  elongation factor Tu  72.84 
 
 		 396 aa  606  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000130058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4449  elongation factor Tu  72.84 
 
 		 396 aa  606  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000257017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0170  elongation factor Tu  75.77 
 
 		 394 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000210333  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  72.73 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3674  elongation factor Tu  75.26 
 
 		 394 aa  605  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219951  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>