More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2054 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0762  elongation factor Tu  82.91 
 
 		 398 aa  649    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000170202  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  77.61 
 
 		 395 aa  652    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2054  elongation factor Tu  100 
 
 		 395 aa  795    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00228831  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0792  elongation factor Tu  78.52 
 
 		 396 aa  636    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.476652  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0524  elongation factor Tu  82.16 
 
 		 398 aa  643    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00168014  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  76.21 
 
 		 396 aa  628  1e-179  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl621  elongation factor Tu  74.11 
 
 		 394 aa  614  1e-175  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  72.36 
 
 		 400 aa  615  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  72.36 
 
 		 400 aa  615  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0627  elongation factor Tu  77.66 
 
 		 395 aa  612  9.999999999999999e-175  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0129162  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  73.25 
 
 		 399 aa  608  1e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  72.34 
 
 		 395 aa  610  1e-173  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  74.49 
 
 		 397 aa  610  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  74.49 
 
 		 397 aa  610  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  72.91 
 
 		 394 aa  608  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  72.91 
 
 		 394 aa  608  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  72.91 
 
 		 394 aa  607  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  72.91 
 
 		 394 aa  607  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  72.84 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  72.5 
 
 		 400 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 400 aa  604  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 400 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  72.41 
 
 		 396 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  75.57 
 
 		 395 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  72.93 
 
 		 400 aa  605  9.999999999999999e-173  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  71.61 
 
 		 400 aa  605  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  72.84 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 400 aa  604  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  72.41 
 
 		 396 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  72.41 
 
 		 396 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  73.54 
 
 		 395 aa  607  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  72.86 
 
 		 399 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  72.41 
 
 		 396 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  73.16 
 
 		 394 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1403  elongation factor Tu  73.28 
 
 		 395 aa  601  1.0000000000000001e-171  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0651  elongation factor Tu  76.21 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000337363  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 395 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 395 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  75.32 
 
 		 395 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  73.16 
 
 		 400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  73.16 
 
 		 400 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  71.75 
 
 		 399 aa  601  1.0000000000000001e-171  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3456  elongation factor Tu  71.76 
 
 		 395 aa  598  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0019954  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  73.16 
 
 		 394 aa  600  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  72.66 
 
 		 397 aa  599  1e-170  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  72.15 
 
 		 397 aa  598  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4484  translation elongation factor Tu  72.01 
 
 		 395 aa  598  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000251988  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0102  elongation factor Tu  76.08 
 
 		 395 aa  599  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000129876  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  72.91 
 
 		 394 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  72.91 
 
 		 394 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  71.36 
 
 		 400 aa  599  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0387  elongation factor Tu  71.76 
 
 		 395 aa  597  1e-169  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  70.63 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  70.63 
 
 		 397 aa  594  1e-169  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  70.63 
 
 		 397 aa  594  1e-169  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  70.63 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  72.15 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  69.92 
 
 		 400 aa  595  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  70.85 
 
 		 399 aa  593  1e-168  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  70.43 
 
 		 400 aa  592  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3175  elongation factor Tu  70.74 
 
 		 395 aa  593  1e-168  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3997  translation elongation factor Tu  74.55 
 
 		 394 aa  592  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  69.92 
 
 		 400 aa  593  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0120  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 395 aa  589  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.73817e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0108  elongation factor Tu  75.32 
 
 		 395 aa  590  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000077853  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  70.35 
 
 		 399 aa  587  1e-167  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0108  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 395 aa  589  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000780653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0104  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 395 aa  589  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.21711e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0102  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 395 aa  589  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000109965  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0190  translation elongation factor Tu  73.28 
 
 		 394 aa  587  1e-167  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  70.35 
 
 		 399 aa  587  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0238  elongation factor Tu  70.89 
 
 		 397 aa  590  1e-167  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602877  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  71.11 
 
 		 399 aa  589  1e-167  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0108  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 395 aa  589  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000587402  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  70.93 
 
 		 399 aa  587  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  70.23 
 
 		 394 aa  587  1e-167  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  70.35 
 
 		 399 aa  587  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5197  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 395 aa  589  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000100424  unclonable  4.51566e-25 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1672  elongation factor Tu  73.12 
 
 		 399 aa  590  1e-167  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000990168  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1054  translation elongation factor Tu  73.28 
 
 		 394 aa  587  1e-167  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0129  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 395 aa  589  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000035963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0103  elongation factor Tu  74.43 
 
 		 396 aa  587  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0139  elongation factor Tu  75.32 
 
 		 395 aa  590  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  69.87 
 
 		 397 aa  590  1e-167  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  67.74 
 
 		 405 aa  586  1e-166  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  67.74 
 
 		 405 aa  586  1e-166  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2723  elongation factor Tu  74.68 
 
 		 394 aa  584  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000408037  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2774  elongation factor Tu  74.68 
 
 		 394 aa  584  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000437207  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0585  elongation factor Tu  75.32 
 
 		 394 aa  585  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546317  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0571  elongation factor Tu  75.32 
 
 		 394 aa  585  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000209792  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  70.93 
 
 		 400 aa  586  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  70.89 
 
 		 396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0144  elongation factor Tu  74.18 
 
 		 394 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195175  normal  0.039031 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  70.13 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  69.37 
 
 		 397 aa  581  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0318  elongation factor Tu  70.18 
 
 		 400 aa  581  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000823048  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  71.14 
 
 		 396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  72.41 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  70.13 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  71.14 
 
 		 396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>