More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1290 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  76.85 
 
 
405 aa  644    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1140  elongation factor Tu  87 
 
 
400 aa  717    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000019246  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  76.81 
 
 
400 aa  642    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1290  elongation factor Tu  100 
 
 
400 aa  807    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000272484  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  76.85 
 
 
405 aa  644    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1396  elongation factor Tu  100 
 
 
400 aa  807    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.147055  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  76.81 
 
 
400 aa  642    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  76.81 
 
 
400 aa  646    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0792  elongation factor Tu  80.25 
 
 
399 aa  658    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.640379  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  85 
 
 
400 aa  706    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  77.25 
 
 
397 aa  631  1e-180  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  77.25 
 
 
397 aa  631  1e-180  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  77 
 
 
396 aa  630  1e-179  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  77 
 
 
396 aa  630  1e-179  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  76.56 
 
 
400 aa  627  1e-179  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  76.31 
 
 
400 aa  627  1e-178  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  72.32 
 
 
400 aa  609  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0250  elongation factor Tu  73.83 
 
 
405 aa  609  1e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0263  elongation factor Tu  73.83 
 
 
405 aa  609  1e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516793  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  71.82 
 
 
400 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1479  elongation factor Tu  75.87 
 
 
401 aa  607  9.999999999999999e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.008881  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  73.07 
 
 
400 aa  604  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3026  elongation factor Tu  75.87 
 
 
401 aa  607  9.999999999999999e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  73.18 
 
 
399 aa  604  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  73.5 
 
 
397 aa  604  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  73.5 
 
 
397 aa  604  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  72.5 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  72.5 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  73.18 
 
 
400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  72.5 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  72.75 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  72.75 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  72.5 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1187  elongation factor Tu  75.37 
 
 
401 aa  599  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.294431  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4028  elongation factor Tu  75.37 
 
 
401 aa  598  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  hitchhiker  0.00000974612 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  71.75 
 
 
397 aa  595  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  71 
 
 
395 aa  595  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  72.82 
 
 
400 aa  596  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  72.57 
 
 
400 aa  593  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  70.82 
 
 
400 aa  588  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  70.93 
 
 
400 aa  588  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0118  elongation factor Tu  72.5 
 
 
400 aa  590  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0332354  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  71.5 
 
 
397 aa  590  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4913  elongation factor Tu  72.5 
 
 
400 aa  590  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00837266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4323  elongation factor Tu  74.63 
 
 
401 aa  585  1e-166  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0230065  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3323  elongation factor Tu  74.63 
 
 
401 aa  586  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000360341  normal  0.122485 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  70 
 
 
397 aa  585  1e-166  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  70 
 
 
397 aa  585  1e-166  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  70 
 
 
397 aa  585  1e-166  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  70 
 
 
397 aa  585  1e-166  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  72.5 
 
 
396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  72.5 
 
 
396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0792  elongation factor Tu  71.97 
 
 
396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.476652  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0447  elongation factor Tu  72.25 
 
 
397 aa  580  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0387  elongation factor Tu  69.75 
 
 
395 aa  580  1e-164  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  68.75 
 
 
396 aa  580  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  68.75 
 
 
396 aa  580  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  68 
 
 
396 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  68 
 
 
396 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  68.66 
 
 
396 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2690  translation elongation factor Tu  71.5 
 
 
405 aa  580  1e-164  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000740208  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  67.75 
 
 
396 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  67.75 
 
 
396 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2909  translation elongation factor Tu  71.5 
 
 
405 aa  580  1e-164  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.124736  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  71.11 
 
 
396 aa  580  1e-164  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0318  elongation factor Tu  68.83 
 
 
400 aa  579  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000823048  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1541  elongation factor Tu  73 
 
 
397 aa  577  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.161942  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1553  elongation factor Tu  73 
 
 
397 aa  577  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000482346  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  67.75 
 
 
396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  69 
 
 
396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1447  elongation factor Tu  72 
 
 
397 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  69 
 
 
396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000705932  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  69.08 
 
 
400 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  67.75 
 
 
396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  72.75 
 
 
395 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  69.08 
 
 
400 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1184  translation elongation factor Tu  70.76 
 
 
405 aa  574  1.0000000000000001e-163  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000189456  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2621  translation elongation factor Tu  71.01 
 
 
405 aa  576  1.0000000000000001e-163  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169473  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  71.5 
 
 
395 aa  577  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  71.5 
 
 
395 aa  577  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  70.9 
 
 
397 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  73.25 
 
 
395 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2730  elongation factor Tu  69.08 
 
 
400 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  68.08 
 
 
400 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  68.5 
 
 
396 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  68 
 
 
396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2989  elongation factor Tu  72.75 
 
 
397 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  67.75 
 
 
394 aa  571  1.0000000000000001e-162  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0495  elongation factor Tu  69.5 
 
 
394 aa  573  1.0000000000000001e-162  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  68.5 
 
 
396 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  68.58 
 
 
396 aa  569  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  68.75 
 
 
396 aa  568  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  68.25 
 
 
396 aa  568  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  68.25 
 
 
396 aa  568  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0192  elongation factor Tu  70.82 
 
 
400 aa  571  1e-161  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174926  normal  0.0285704 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  69.5 
 
 
396 aa  569  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  69.5 
 
 
396 aa  569  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  68.75 
 
 
396 aa  568  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06230  elongation factor Tu  68.75 
 
 
397 aa  571  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141067  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  68.58 
 
 
396 aa  569  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>