More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_65888 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_65888  mitochondrial translation elongation factor TU  100 
 
 		 430 aa  877    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.77122  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03130  translation elongation factor, putative  67.54 
 
 		 464 aa  596  1e-169  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.522015  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01084  hypothetical protein similar to elongation factor EF-Tu (Broad)  70.53 
 
 		 439 aa  585  1e-166  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  67.76 
 
 		 396 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  67.57 
 
 		 400 aa  557  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  67.76 
 
 		 396 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  67.76 
 
 		 396 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  67.76 
 
 		 396 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  68.42 
 
 		 396 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  67.42 
 
 		 396 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  67.5 
 
 		 400 aa  546  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  67.17 
 
 		 396 aa  546  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  67.5 
 
 		 400 aa  546  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  67.67 
 
 		 396 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  67.67 
 
 		 396 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  67.67 
 
 		 396 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  67.67 
 
 		 396 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  67.42 
 
 		 396 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  66.75 
 
 		 396 aa  545  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  67.51 
 
 		 396 aa  545  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  67.25 
 
 		 396 aa  547  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  67.25 
 
 		 396 aa  547  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  67 
 
 		 396 aa  546  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  67 
 
 		 396 aa  546  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  66.5 
 
 		 396 aa  544  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  66.08 
 
 		 396 aa  542  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  66.5 
 
 		 396 aa  544  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  66.67 
 
 		 396 aa  543  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  66.08 
 
 		 396 aa  542  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  66.25 
 
 		 396 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  66.25 
 
 		 396 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  66.5 
 
 		 395 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  66.25 
 
 		 396 aa  537  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl621  elongation factor Tu  66.16 
 
 		 394 aa  538  1e-151  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  65.99 
 
 		 396 aa  535  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  65.24 
 
 		 396 aa  535  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  65.24 
 
 		 396 aa  535  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  64.91 
 
 		 396 aa  536  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  64.91 
 
 		 396 aa  536  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  66.5 
 
 		 395 aa  538  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  65.99 
 
 		 396 aa  535  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  66.25 
 
 		 396 aa  537  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  65.66 
 
 		 397 aa  531  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  64.99 
 
 		 396 aa  532  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  64.99 
 
 		 396 aa  532  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  64.82 
 
 		 397 aa  533  1e-150  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  64.82 
 
 		 397 aa  533  1e-150  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  63.41 
 
 		 396 aa  532  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  63.41 
 
 		 396 aa  532  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3923  elongation factor Tu  65.58 
 
 		 397 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.375909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  66.08 
 
 		 395 aa  533  1e-150  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  64.82 
 
 		 397 aa  533  1e-150  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  66.25 
 
 		 396 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  66.25 
 
 		 396 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  64.82 
 
 		 397 aa  533  1e-150  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  65.66 
 
 		 397 aa  531  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  65.25 
 
 		 400 aa  531  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3911  elongation factor Tu  65.58 
 
 		 397 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0156728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  65.25 
 
 		 400 aa  531  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4484  translation elongation factor Tu  64.74 
 
 		 395 aa  528  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000251988  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0331  elongation factor Tu  65.66 
 
 		 391 aa  531  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.386625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  65.24 
 
 		 396 aa  531  1e-149  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2536  elongation factor Tu  65.66 
 
 		 391 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1707  elongation factor Tu  65.66 
 
 		 391 aa  531  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1714  elongation factor Tu  65.66 
 
 		 391 aa  531  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  65.75 
 
 		 400 aa  530  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1247  elongation factor Tu  66.5 
 
 		 396 aa  531  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.727206  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  65.24 
 
 		 396 aa  528  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  65.49 
 
 		 396 aa  529  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  64.23 
 
 		 396 aa  529  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000705932  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  64.23 
 
 		 396 aa  530  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0734  elongation factor Tu  65.41 
 
 		 391 aa  530  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.481957  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0756  elongation factor Tu  65.41 
 
 		 391 aa  530  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.097757  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23641  elongation factor Tu  64.74 
 
 		 399 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2549  elongation factor Tu  65.66 
 
 		 391 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.812394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0359  elongation factor Tu  65.66 
 
 		 391 aa  531  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0345  elongation factor Tu  65.66 
 
 		 391 aa  531  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  0.827994 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  64.99 
 
 		 396 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  64.99 
 
 		 396 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0582  elongation factor Tu  67.83 
 
 		 396 aa  527  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  64.75 
 
 		 400 aa  526  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  64.99 
 
 		 396 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  64.75 
 
 		 400 aa  526  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  64.99 
 
 		 396 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2191  elongation factor Tu  64.9 
 
 		 396 aa  525  1e-148  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2101  elongation factor Tu  64.9 
 
 		 396 aa  525  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.235673  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  64.99 
 
 		 396 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  64.99 
 
 		 396 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  64.99 
 
 		 396 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  64.99 
 
 		 396 aa  525  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  64.99 
 
 		 396 aa  525  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3599  elongation factor Tu  64.25 
 
 		 396 aa  525  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0100711  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3797  elongation factor Tu  64 
 
 		 396 aa  525  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000312567  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  64.99 
 
 		 396 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  64.99 
 
 		 396 aa  526  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  64.99 
 
 		 396 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  64.99 
 
 		 396 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2203  elongation factor Tu  64.9 
 
 		 396 aa  525  1e-148  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000805833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  64.99 
 
 		 396 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0792  elongation factor Tu  65.32 
 
 		 396 aa  525  1e-148  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.476652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>