More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND01480 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND01480  eukaryotic translation initiation factor 2 gamma, putative  100 
 
 		 473 aa  964    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04470  hypothetical protein similar to translation initiation factor 2 gamma subunit (Broad)  65.28 
 
 		 514 aa  613  9.999999999999999e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.972287  normal  0.290291 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83918  predicted protein  66.96 
 
 		 522 aa  612  9.999999999999999e-175  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32338  predicted protein  64.06 
 
 		 463 aa  585  1e-166  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.207682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_42307  predicted protein  58.57 
 
 		 453 aa  512  1e-144  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000154334  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0803  protein synthesis factor GTP-binding protein  46.71 
 
 		 408 aa  370  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0563  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.69 
 
 		 423 aa  368  1e-100  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0523  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.52 
 
 		 410 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0287  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.16 
 
 		 426 aa  353  4e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1319  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.79 
 
 		 409 aa  351  2e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.472649  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1464  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.84 
 
 		 410 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0246  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.58 
 
 		 410 aa  345  1e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0072  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.56 
 
 		 420 aa  345  1e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0382  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.08 
 
 		 410 aa  345  1e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1389  protein synthesis factor GTP-binding protein  43.74 
 
 		 415 aa  344  2e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0455  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.6 
 
 		 410 aa  343  5e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2240  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.6 
 
 		 411 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0660  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.34 
 
 		 411 aa  331  2e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0605  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.11 
 
 		 411 aa  330  2e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2243  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.55 
 
 		 415 aa  331  2e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.241915  hitchhiker  0.0027626 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2861  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  41.87 
 
 		 411 aa  330  3e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00223054  normal  0.810551 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0247  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.12 
 
 		 403 aa  327  3e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2398  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.72 
 
 		 412 aa  317  2e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3452  protein synthesis factor GTP-binding protein  42.35 
 
 		 410 aa  315  9.999999999999999e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2278  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  41.84 
 
 		 408 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2209  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.04 
 
 		 411 aa  307  3e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.211822  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1486  protein synthesis factor GTP-binding protein  42.02 
 
 		 409 aa  306  7e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.848382  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0730  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.53 
 
 		 410 aa  301  2e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1531  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  39.72 
 
 		 408 aa  291  1e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1010  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  37.24 
 
 		 411 aa  278  1e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000495902 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0078  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  37.79 
 
 		 411 aa  278  1e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0695482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1171  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  37.24 
 
 		 411 aa  278  2e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.568284  normal  0.119689 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0242  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  36 
 
 		 408 aa  276  6e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  30 
 
 		 644 aa  118  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  32 
 
 		 634 aa  109  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3567  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.22 
 
 		 636 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0832  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.44 
 
 		 637 aa  106  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.19 
 
 		 619 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0102  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.11 
 
 		 636 aa  104  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.83 
 
 		 635 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1547  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.14 
 
 		 601 aa  101  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3415  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  29.84 
 
 		 636 aa  100  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0035  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.72 
 
 		 636 aa  100  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0034  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.4 
 
 		 636 aa  99.8  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1123  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.37 
 
 		 627 aa  99.8  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2086  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.46 
 
 		 657 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0347898  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.27 
 
 		 635 aa  99.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0762  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.89 
 
 		 634 aa  99  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.97012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4628  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  25.74 
 
 		 628 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2825  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.98 
 
 		 643 aa  97.1  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.76 
 
 		 629 aa  97.1  7e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0443  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.73 
 
 		 635 aa  96.3  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04524  elongation factor Tu  30.92 
 
 		 384 aa  96.7  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00165696  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04538  elongation factor Tu  30.92 
 
 		 384 aa  96.7  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2560  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.5 
 
 		 631 aa  96.3  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.475206  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.12 
 
 		 635 aa  96.3  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1693  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.48 
 
 		 643 aa  95.9  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.986647 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  28.19 
 
 		 644 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  26.11 
 
 		 395 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  26.11 
 
 		 395 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0164  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.64 
 
 		 636 aa  94.7  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5596  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  29.41 
 
 		 570 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2019  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.52 
 
 		 634 aa  93.2  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0284313  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  30 
 
 		 395 aa  92.8  1e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3266  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.36 
 
 		 643 aa  92.8  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.901802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  30.92 
 
 		 396 aa  93.2  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  30.92 
 
 		 396 aa  93.2  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5216  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  29.41 
 
 		 565 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2372  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.78 
 
 		 635 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25300  selenocysteine-specific elongation factor SelB  30.57 
 
 		 641 aa  92.8  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5304  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  29.41 
 
 		 565 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.95 
 
 		 650 aa  92.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  30.92 
 
 		 396 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000150336  hitchhiker  0.00000130036 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  30.92 
 
 		 396 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  30.92 
 
 		 396 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  30.92 
 
 		 396 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000015318  hitchhiker  0.0000000000310582 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1982  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.08 
 
 		 612 aa  92  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.869997  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  29.39 
 
 		 396 aa  91.7  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  26.67 
 
 		 399 aa  91.7  3e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  29.39 
 
 		 396 aa  91.7  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3299  elongation factor Tu  29.77 
 
 		 402 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00521718  hitchhiker  0.000291329 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  29.77 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  30.77 
 
 		 399 aa  90.9  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  30.77 
 
 		 399 aa  90.9  4e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  30.77 
 
 		 399 aa  90.9  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  29.77 
 
 		 396 aa  90.9  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  29.77 
 
 		 396 aa  90.9  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  29.77 
 
 		 396 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  29.77 
 
 		 396 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  29.77 
 
 		 396 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  29.77 
 
 		 396 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  29.77 
 
 		 396 aa  90.9  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  29.77 
 
 		 396 aa  90.9  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  29.77 
 
 		 396 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  29.77 
 
 		 396 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  29.77 
 
 		 396 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  29.77 
 
 		 396 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  29.77 
 
 		 396 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  29.77 
 
 		 396 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  29.77 
 
 		 396 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>