More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1486 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1486  protein synthesis factor GTP-binding protein  100 
 
 
409 aa  818    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.848382  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3452  protein synthesis factor GTP-binding protein  90.44 
 
 
410 aa  714    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2398  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  79.01 
 
 
412 aa  625  1e-178  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0730  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  79.76 
 
 
410 aa  623  1e-177  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2209  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  75.91 
 
 
411 aa  606  9.999999999999999e-173  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.211822  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1319  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  64.44 
 
 
409 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.472649  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0287  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  62.47 
 
 
426 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2278  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  63.05 
 
 
408 aa  504  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0523  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  59.41 
 
 
410 aa  499  1e-140  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0803  protein synthesis factor GTP-binding protein  58.05 
 
 
408 aa  499  1e-140  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2240  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  59.01 
 
 
411 aa  496  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0455  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  58.44 
 
 
410 aa  495  1e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0382  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  58.19 
 
 
410 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1464  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  58.19 
 
 
410 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0660  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  57.28 
 
 
411 aa  485  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0246  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  55.85 
 
 
410 aa  479  1e-134  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0247  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  60.3 
 
 
403 aa  478  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2861  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  56.05 
 
 
411 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00223054  normal  0.810551 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0605  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  57.78 
 
 
411 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0563  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  52.53 
 
 
423 aa  441  1e-123  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1389  protein synthesis factor GTP-binding protein  51.96 
 
 
415 aa  423  1e-117  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0072  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  51.98 
 
 
420 aa  424  1e-117  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2243  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  52.22 
 
 
415 aa  418  9.999999999999999e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.241915  hitchhiker  0.0027626 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0242  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  46.57 
 
 
408 aa  364  2e-99  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0078  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.81 
 
 
411 aa  362  6e-99  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0695482  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1531  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.22 
 
 
408 aa  352  8e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1171  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.47 
 
 
411 aa  350  2e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.568284  normal  0.119689 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1010  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.67 
 
 
411 aa  348  1e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000495902 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32338  predicted protein  41.18 
 
 
463 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.207682  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83918  predicted protein  41.41 
 
 
522 aa  335  5.999999999999999e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652137  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01480  eukaryotic translation initiation factor 2 gamma, putative  42.02 
 
 
473 aa  323  3e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04470  hypothetical protein similar to translation initiation factor 2 gamma subunit (Broad)  42.04 
 
 
514 aa  323  4e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.972287  normal  0.290291 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_42307  predicted protein  41.89 
 
 
453 aa  322  9.999999999999999e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000154334  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.53 
 
 
644 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.44 
 
 
644 aa  139  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.06 
 
 
650 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.46 
 
 
619 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0762  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.13 
 
 
634 aa  136  8e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.97012  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.17 
 
 
634 aa  136  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0832  selenocysteine-specific translation elongation factor  33 
 
 
637 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3567  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.55 
 
 
636 aa  133  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4628  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  33.33 
 
 
628 aa  133  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2019  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.54 
 
 
634 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0284313  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.85 
 
 
635 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.55 
 
 
627 aa  129  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2560  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.57 
 
 
631 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.475206  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2441  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.75 
 
 
642 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.65 
 
 
629 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2083  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.23 
 
 
611 aa  127  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0653  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.72 
 
 
636 aa  125  9e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0190681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3415  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  36.19 
 
 
636 aa  125  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2086  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.31 
 
 
657 aa  126  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0347898  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1693  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.18 
 
 
643 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.986647 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.28 
 
 
635 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2825  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.73 
 
 
643 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518854  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2548  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  28.32 
 
 
637 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1547  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.63 
 
 
601 aa  124  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5216  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.75 
 
 
565 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5304  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.75 
 
 
565 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5596  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.45 
 
 
570 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.18 
 
 
635 aa  123  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6555  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.4 
 
 
637 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0281066  hitchhiker  0.00125424 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1982  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  32.74 
 
 
612 aa  123  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.869997  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2372  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.39 
 
 
635 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  30.82 
 
 
397 aa  122  9e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1123  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.97 
 
 
627 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1904  translation elongation factor, selenocysteine-specific  29.3 
 
 
651 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2391  translation elongation factor, selenocysteine-specific  29.3 
 
 
651 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451398  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1697  translation elongation factor, selenocysteine-specific  29.3 
 
 
651 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0576  translation elongation factor, selenocysteine-specific  29.3 
 
 
651 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11400  selenocysteine-specific elongation factor SelB  28.86 
 
 
657 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  29.16 
 
 
397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  29.16 
 
 
397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1678  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.68 
 
 
641 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0725  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.68 
 
 
641 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01084  hypothetical protein similar to elongation factor EF-Tu (Broad)  29.61 
 
 
439 aa  119  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2084  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.76 
 
 
635 aa  119  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  31.23 
 
 
399 aa  119  7.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2254  translation elongation factor, selenocysteine-specific  29.06 
 
 
651 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0142669  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1114  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.73 
 
 
633 aa  119  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  28.6 
 
 
397 aa  119  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0611  elongation factor Tu  28.26 
 
 
394 aa  119  9.999999999999999e-26  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.016281  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  28.76 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0596  elongation factor Tu  30 
 
 
394 aa  117  3e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00435785  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  31.7 
 
 
396 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0102  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.68 
 
 
636 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  26.79 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0164  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.12 
 
 
636 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  28.76 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  26.79 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  29.36 
 
 
396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  28.86 
 
 
395 aa  116  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  28.86 
 
 
395 aa  116  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0250  elongation factor Tu  28.47 
 
 
405 aa  116  6.9999999999999995e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0263  elongation factor Tu  28.47 
 
 
405 aa  116  6.9999999999999995e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516793  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5075  elongation factor Tu  28.47 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602594  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  28.85 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  28.85 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1015  elongation factor Tu  28.7 
 
 
396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.345465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1005  elongation factor Tu  28.7 
 
 
396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>